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Formulaire LR 2011-2014 Page : 1/ 99

CHEF DU LABORATOIRE DE RECHERCHE

REPUBLIQUE TUNISIENNE

Ministère de l’Enseignement Supérieur

et de la Recherche Scientifique

Ministère de l’Agriculture,

des Ressources Hydrauliques et de la Pêche

DOSSIER DE CANDIDATURE A LA

CREATION D’UN LABORATOIRE DE RECHERCHE 2011-2014

«Le laboratoire de recherche (L.R) est la structure de base pour la réalisation des activités de recherche

scientifique et de développement technologique dans tous les domaines des sciences et de la technologie, et ce,

dans le cadre des priorités nationales fixées par les plans de développement et les programmes nationaux

établis par les parties compétentes» (décret n°2009-644 du 2 mars 2009).

http://www.mes.tn/francais/divers/decret_2009_644_fr.pdf

Le dossier de candidature doit être déposé en 5 exemplaires avec une copie numérique (sur CD)

IDENTIFICATION DU LABORATOIRE DE RECHERCHE

ETABLISSEMENT : Institut National des Sciences et Technologies de la Mer (INSTM)

UNIVERSITE (en cas de cotutelle) : ……………………………………………………….......…………….……………….

DENOMINATION DU LABORATOIRE DE RECHERCHE PROJETE : Biodiversité et Biotechnologie marines

التنوع البيولوجي والبيوتكنولوجيا البحرية

DOMAINE SCIENTIFIQUE CONCERNE : Sciences Biologiques

Nom et Prénom : Mr. BRADAI Mohamed Nejmeddine Spécialité : Biodiversité des Vertébrés marins

Grade : Directeur de Recherche Fonction (s’il y a lieu): Directeur de laboratoire

Etablissement de rattachement : INSTM Université (en cas de cotutelle):……………….…………… .…..

E-mail : [email protected]

Signature :


I– PRESENTATION DU LABORATOIRE DE RECHERCHE

I-1- RESSOURCES HUMAINES

Masse critique : 4 enseignants-chercheurs du corps A, 6 du corps B et 14 entre doctorants et cadres ayant un grade équivalent ou homologue au grade d’assistant de l’enseignement supérieur. Tout enseignant chercheur et doctorant doit obligatoirement, remplir une «fiche individuelle» sous peine de ne pas être pris en considération.

a- Enseignants-chercheurs permanents (corps A et B) et doctorants

- Corps A : (Insérer autant de lignes que nécessaire)

Grade(1) Nom et prénom N° C.I.N(2) Etablissement

Professeur SADOK Saloua 00757081 INSTM

Directeur de Recherche

BRADAI Mohamed Nejmeddine

01160358 INSTM

Maitres de Conférences

BEN RABEH Faouzi 05266045 INSTM

BEJAOUI Nejla

00302188 INAT

AFLI Ahmed 00748031 INSTM

Maitres de Recherche

ABEDELWAHEB Abdelwaheb 01040959 INSTM

BEN OUADA Hatem 03848801 INSTM

Hamadi Guerbej 04023792 INSTM

(1) : Nombre total des enseignants-chercheurs du corps A : 08

- Corps B : (Insérer autant de lignes que nécessaire)


(1) et grades équivalents. (2) Obligatoire.

(2): Nombre total des enseignants-chercheurs du corps B : 14

Grade(1) Nom et prénom N° C.I.N(2) Etablissement

SOUISSI Nabil 05337877 INSTM

SAÏDI Béchir 05979659 FS Gafsa

Maîtres Assistants

LANGAR Habib 00329047 INSTM

KTARI Leila 04773948 INSTM

EL BOUR Monia 00260420 INSTM

BOUSSAID Béchir 04110602 ERVT

Chargé de Recherche

TRABELSI Lamia 06786530 INSTM

BEN SAID Rafik 01510236 INSTM

CHEBIL Leila 00743353 INSTM

Assistants BEN MUSTAPHA Karim 00557989 INSTM

NAKBI Amel 06792958 INSTM

Attaché de Recherche

BEN DHIAB Rim 06757020 INSTM

MENSI Fethi 04479295 INSTM

CHAIEB Olfa 06799101 INSTM


- Doctorants (Préparant une thèse de doctorat es-sciences): Tout doctorant doit fournir obligatoirement une attestation d’inscription au titre de l’année universitaire en cours.

(Insérer autant de lignes que nécessaire)

Nom et prénom

N°C.I.N(3)

Etablissement Université

Année de la première

inscription(*)

Nom et prénom de l’encadreur

Mabrouk Lotfi

03976218 FSS 2008-2009


BESBES Ameni 08159314 FSS

2008-2009


BEN OMRANE SIOUD Olfa 08407813 FST 2009-2010 SADOK Saloua

BOUZGAROU Olfa 06833956 FST 2008-2009 SADOK Saloua

ZILI Fatma 06849469 ISBM 2009-2010 BEN OUADA Hatem

MEZHOUD Nahla 06860252 ISBM 2010 BEN OUADA Hatem

MILED Samira 08297334 INAT 2010 BEN OUADA Hatem

BOUZIDI Nehla 08257465 ISBM 2009 MAAROUFI Khira

BEN MASSAOUD Rimel 08455509 INAT 2009-2010 BEJAOUI Najla

CHERIF Wafa 07641763 FST

2009-2010 BOUDABOUS

Abdellatif

BEN REDJEM Yoser 08331687 FST

2008/2009 BOUDABOUS

Abdellatif

Hédi Ben Hassine Salah 05398930 INAT

2009/2010 BEJAOUI Najla

El Gharsalli Refka 08552235 INAT

2008/2009 BEJAOUI Najla

KERKENI Houssem 06327511 INAT

2008/2009 ROMDHANE Med

Salah

* Doctorants inscrits à partir de l’année universitaire 2008/2009.

(3) : Nombre total de doctorants : 14

b- Cadres ayant un grade équivalent ou homologue au grade d’assistant de l’enseignement supérieur(4)


Nom et prénom N° C.I.N(3) Qualité (4) Etablissement

NEIFAR Aref 1269354 Ing INSTM

YAHIA Ali 05721785 Ing INSTM

GHOZZI Khmissa 06764841 Ing INSTM


CHALLOUF Rafika 05676418 Ing INSTM

AMMAR Jihene 08441767 Master spécialisée INSTM

ATTOUCHI Mourad 06271442 P E S INSTM

Wassim Kamoun 05325699 Tec INSTM

Mohamed Salah Krichen 05325517 Tec INSTM

Mohamed Makhloufi 05382472 Tec INSTM

AOUN ENNAB Ibrahim 07357229 Tec INSTM

OMRANE Hela 080373443 Tec INSTM

Ennajar Samira 03990680 Tec INSTM

(3)Obligatoire.

(4) Ingénieurs principaux, médecins vétérinaire, résidents en médicine vétérinaire et autres.

(4) : Nombre total des cadres : 12

TOTAL GENERAL (1) +(2) +(3) +(4) : 48


c- Etudiants en mastère de recherche


Nom et prénom

N°C.I.N(5)

Etablissement-Université

Année de la première inscription

Nom et prénom de l’encadreur

FENDRI Rahma 08808104 INSM/FSS 2009-2010 BRADAI

Mohamed Nejmeddine

AOUINI Hend 05455215 INSM/INAT 2008-2009 BEN SAID Rafik

REBHI Manel 08480233 INSM/INAT 2008/2009 Sadok Saloua

BESSADOK Boutheina

07643329 INSM/INAT 2009/2010 Sadok Saloua

CHABBOU Wiem 07356299 INSM/FST 2009/2010 Sadok Saloua

Souraya Belhaj Yahia

05584321 INSM/ESIAT 2009/2010 Sadok Saloua

Mariem Bouaouina 06399091 INSM/INAT 2009/2010 Sadok Saloua

Oussama Khalil Râach

08718119 INSM/FST 2009/2010 Sadok Saloua

ALOUIA Leila 08911483 FSB 2009-2010 Ben Mustapha Karim

(5)Obligatoire.

I-2-COMPOSITION DU CONSEIL DU LABORATOIRE


Nom et prénom Grade /Qualité Etablissement


D.R INSTM

SADOK Saloua Pr. INSTM

AFLI Ahmed M.C INSTM

BEN OUADA Hatem M.R INSTM

Bjaoui Nejla M.C INAT

KTARI Leila M.A INSTM

Lamia Trabelsi C.R INSTM

EL BOUR Monia M.A INSTM

BEN SAID Rafik C.R INSTM


BOUZIDI NEHLA

Etudiante en thèse

INSTM Monastir

BOUZGAROU Olfa Etudiante en thèse INSTM La Goulette

Atef Ouergui Experten Biologie marine CAR/ASP

MESTIRI Fouad D.G GIPP


I-3- LOCAUX OCCUPES ACTUELLEMENT

Dans l’établissement même

Ailleurs

Nombre Superficie Nombre Superficie Etablissement

Bureaux occupés 22 350 m2

Salles de manipulation, d’analyses, d’essais

07 270 m2

Salles de réunion, de Documentation

03 140 m2

Magasins, ateliers

Terrains d’expérimentation, champs de culture

1 12 m2

Halls ou hangars de stockage, dépôts

Stations pilotes et autres facilités

1 5 m2

I-4- MOYENS LOGISTIQUES ACTUELS DISPONIBLES

-Voitures ou engins dont pourrait disposer le personnel du laboratoire projeté; -Transport assuré au personnel du laboratoire projeté par l’établissement dont il relèverait ; -Autres facilités logistiques potentielles :


Le transport est assuré au personnel du laboratoire par l’INSTM. Toutefois, un manque de matériel roulant est souvent signalé entravant parfois le travail. L’équipe bénéficie par ailleurs du navire océanographique HANNBAL de l’INSTM pour les sorties en mer ainsi que d’un Zodiac


I-5- EQUIPEMENTS SCIENTIFIQUES OPERATIONELS DEJA DISPONIBLES (Dont la valeur est supérieure à 50 mille dinars)


Nature de l’équipement utilisable Lieu d’affectation

Caméra sous marine Salammbô

Congélateur -80°C La Goulette

HPLC Préparative (Agilent techonologie 1200 series) Monastir

HPLC Analytique*** SFAX

CPG Monastir

I-6- DOCUMENTATION SCIENTIFIQUE

-Les membres du laboratoire projeté ont-t-ils déjà accès à une unité d’information et de documentation? -Le nombre de livres, de revues scientifiques reçues régulièrement y est-il : insignifiant, moyen, important? -Quelles sont les bases de données accessibles par Internet les plus utiles au laboratoire projeté?


Le nombre de livres, de revues scientifiques reçues régulièrement est moyen.

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II– PRESENTATION DES ACTIVITES DE RECHERCHE DU LABORATOIRE DE RECHERCHE (2011-2014)

Il est à noter que conformément au Décret n° 2009-644 du 2 mars 2009, les activités de recherche d’un laboratoire sont structurées en programme(s) de recherche. Chaque programme de recherche se subdivise en projets de recherche exécutés par des équipes de recherche.

II-1- IDENTIFICATION DE(S) PROGRAMME(S) DE RECHERCHE

Intitulé(s) de(s) Programme(s) de recherche Responsable du programme (1) (nom, prénom, grade et spécialité)

Programme 1 : Biodiversité marine AFLI Ahmed

Maître de conférences

Programme 2 : Biotechnologie Marine

Mme SADOK Salwa Professeur

Biochimie des produits aquatiques

(1) Ayant le grade de Professeur de l’enseignement supérieur, Maître de Conférences, Directeur de recherche, Maître de recherche et

grades équivalents.

II-2- PRESENTATION DE(S) PROGRAMME(S) DE RECHERCHE (à remplir pour chaque programme)

PROGRAMME DE RECHERCHE 1 : Biodiversité marine

1- OBJECTIFS SCIENTIFIQUES DU PROGRAMME DE RECHERCHE 1 a- Objectif général du programme de recherche 1

Etude du statut des espèces rares, menacées et invasives (paramètres biologiques, écologiques, interaction

avec la pêche, habitats sensibles…) dans un but d’élaborer des plans d’action nationaux de conservation et

de délimiter des zones à protéger (aires protégées). L’étude de la biodiversité dans les écosystèmes

remarquables, fragiles ou ayant une grande importance écologique est également programmée pour suivre

l’évolution de certaines espèces clefs, mettre en place une méthodologie complète pour l’étude éco

systémique des zones transitoires en Tunisie, instaurer une banque de données relatives aux inventaires

des espèces et des habitats et expliquer l’expansion de certains phénomènes et certaines espèces en

fonction des changements climatiques.

A cet effet, Le programme vise les taxa de vertébrés marins, rares, menacés ou exotiques.

La biologie et l’écologie de plusieurs poissons osseux rares sont généralement mal connues vu leur faible

valeur économique, bien qu’ils ont leur importance dans l’écosystème et la chaine alimentaire. Les

variations dans leurs distributions et abondances pourraient informer sur les effets des changements

globaux sur les populations de poissons. Dans le cadre de l’approche écosystémique pour la pêche,

Certaines espèces seront étudiées. Certaines espèces menacées seront également étudiées (mérous) et le

phénomène biogéographique d’entrée d’espèces exotiques sera suivi.


Dans ce même cadre, le suivi des blooms de méduses et l’impact des cages d’aquaculture en mer sur

l’environnement marin, la biodiversité et le secteur de la pêche sera entrepris.

Pour les espèces menacées, le projet s’intéresserait aux élasmobranches (requins et raies), aux mérous, aux

tortues marines et aux cétacés. La reconnaissance du statut des ces taxa (paramètres biologiques et

écologiques, Impact des techniques de pêches, bycatch, nurseries, Caractérisation génétique, échouages)

constituerait en outre la mise en œuvre des conventions internationales ratifiées par la Tunisie et les plans

d’action élaborés par la convention de Barcelone et adoptés par la Tunisie.

Par ailleurs, les résultats obtenus antérieurement montrent que dans la plupart des zones lagunaires en

Tunisie, les peuplements sont affectés, pourtant les valeurs des paramètres physico-chimiques

enregistrées à une certaine période de l’année sont en dessous des seuils de perturbation. Pour pouvoir

répondre clairement à cette problématique, il est donc nécessaire de réaliser un suivi saisonnier pour

discerner la variabilité des paramètres physico-chimiques qui semblent atteindre à un certain moment de

l’année des valeurs élevées, essentiellement de température et de salinité mais également du taux de

pollution. Ceci se manifeste clairement dans la lagune de Bizerte pour laquelle la communication avec la

mer d’un côté et avec le lac Ichkeul de l’autre amplifie la fluctuation de la température et de la salinité

entre l’hiver et l’été. Ce qui représente une sélection naturelle thermohaline des espèces.

De même, le programme envisage d’étudier la biocénose coralligène dans le nord de la Tunisie. En effet,

cet écosystème est considéré comme le deuxième pole de biodiversité marine en Méditerranée après les

herbiers de posidonie. Il s’agit de mesurer la biodiversité et ses descripteurs et de réaliser la distribution

spatiale du coralligène par le biais de l’imagerie par sonar à balayage latéral.

Ce programme vise également à étudier les herbiers de posidonie et les peuplements associés. Il s’agit

d’étudier les paramètres biométriques de P. oceanica, l’épiphytisme sur ses feuilles et ses rhizomes et la

cartographie de son étendue dans la zone de Mahdia. Il prévoit aussi un monitoring des herbiers balisés

lors du précédent programme EBHaR (Sidi Ali El-Mekki et Kerkennah), avec une remise en état si

nécessaire du balisage et intègre l’établissement d’un inventaire des espèces inscrites sur l’annexe du

protocole relatif aux ASP/DB du genre Cystoseira sur les côtes de Tunisie.

b- Quels seraient les objectifs spécifiques du programme de recherche 1 ?


1ers objectifs Spécifiques : - Monitoring du site de ponte des îles Kuriat

pour la détermination des différents

paramètres de reproduction et de survie. La

recherche sur la sex-ratio sera développée

davantage.

- Développer les recherches pour atténuer les

captures accidentelles et la mortalité des

tortues marines.

- Etude des échouages sur les côtes

tunisiennes (les causes de mortalité, les

épibiontes…)

- Evaluation de l’incidence du phénomène de

la paternité multiple chez la population des

caouannes des Iles kuriat et son rôle dans la

diversité génétique de cette population.

Résultat attendu : Connaissance du statut des tortues marines

nécessaire pour l’élaboration d’un plan d’action

national de protection (nidification et biologie de la

reproduction, interactions avec la pêche, migration,

caractéristiques génitiques…)


2ème objectif Spécifique : - Evaluation socio-économique et écologique

des interactions engins de pêche/ dauphins. - Etudier l'efficacité de l'utilisation des

systèmes acoustiques (pingers) sur la

réduction des interactions dauphins-engins

de pêche.

- Etude des échouages des cétacés sur les

côtes tunisiennes (les causes de mortalité

…)

Résultat attendu : Nos connaissances sur la faune cétologique (espèces, abondance et répartition) seront améliorées. De même les interactions dauphins – pêche seront élucidés davantage.

3ème objectif Spécifique : - Détermination des paramètres biologiques

et écologiques des espèces communes

- Impact des techniques de pêches sur les

élasmobranches

- Délimitation des nurseries des espèces

communes dans la région du golfe de

Gabès

- Caractérisation génétique des

élasmobranches à problèmes systématique

Résultat attendu : Connaissance des paramètres biologiques des

élasmobranches, des zones des nurseries ainsi que

des captures accidentelles pour des fins de

conservation et d’aménagement des pêcheries.

Les révisions systématiques permettent d’avoir une

idée claire sur la biodiversité de la faune

ichtyologique tunisienne

4ème objectif Spécifique : - Ecobiologie du poisson perroquet

Sparisoma cretense (Scaridae) et

Dactylopterus volitans (Dactylopteridae des

côtes tunisiennes ;

- Etude génétique des mérous

- Suivi des poissons exotiques

- Etude d’impact de cages flottantes

d’aquaculture avec un œil sur les méduses

Résultat attendu : - expliquer l’expansion de certains

phénomènes et certaines espèces de

poissons (Sparisoma cretense….) et les

méduses avec les changements climatiques.

- l’impact des cages d’aquaculture en mer sur

l’environnement marin, la biodiversité et le

secteur de la pêche - Contribution à la caractérisation de la faune

ichtyologique tunisienne dans un contexte

de changements globaux

5ème objectif Spécifique : Réaliser une étude pluridisciplinaire dans un site

transitoire pilote (une ou deux lagunes tunisiennes)

où les principaux aspects seront traités ; paramètres

physico-chimiques et peuplements de macrofaune

benthique.

Résultat attendu : Les campagnes d’échantillonnage doivent être

effectuées de façon régulière dans le temps

(saisonnalité) pour enregistrer les phénomènes qui

se passent à petite échelle temporelle.

6ème objectif Spécifique : Etude de la biodiversité dans le coralligène au nord

de la Tunisie.

Résultat attendu : - Mesurer la biodiversité et ses descripteurs dans le

coralligène (recensements et inventaires des

espèces et des communautés les plus importantes,

calculs d’indices écologiques, analyse des

associations et des groupements récurrents et étude

de la distribution écologique naturelle des espèces

clefs).

- Réaliser la distribution spatiale du coralligène

(diversité gama) par le biais de l’imagerie par sonar

à balayage latéral


7ème objectif Spécifique : Etude des herbiers de posidonie, inventaire des

cystoseires et suivi des signalisations de Caulerpa

taxifolia

Résultat attendu : - Caractériser les paramètres biométriques de P.

oceanica, l’épiphytisme sur ses feuilles et ses

rhizomes et la cartographie de son étendue dans la

zone de Mahdia.

- Monitoring des herbiers de posidonie (Sidi Ali El-

Mekki et Kerkennah)

- Inventaire des cystoseires c- Ces objectifs sont- ils compatibles avec la mission de l’établissement auquel se rattache le laboratoire ? Oui, surtout que parmi les missions de l’INSTM on peut lire :

- Mener des programmes de recherche sur contrat dans des domaines liés directement ou

indirectement à la mer et à ses ressources: Pêche, Agriculture, Environnement marin, Technologies

de la mer, Océanographie, etc.

- Contribuer à résoudre les problèmes liés au développement des activités urbaines et économiques

sur le littoral et dans les eaux territoriales

- Servir d'instrument d'aide à la décision en vue d’une gestion durable de la mer et de ses ressources.

d- Quels sont les 4 mots clés qui caractérisent le mieux l’orientation générale du programme de recherche et la spécificité des compétences des chercheurs ?

1/-. Espèces menacées 3/-.Coralligène

2/-.Habitats sensibles 4/-.inventaires systématiques


2- ETAT DES CONNAISSANCES RELATIVES AUX PROBLEMATIQUES A PRENDRE EN CHARGE PAR LE PROGRAMME DE RECHERCHE 1

a- au niveau national


Tortues Les paramètres de nidification de la tortue marine ont été établis sur le site des îles Kuriat mais la

continuation de la collecte des données est toujours utile pour constituer une banque de données

concernant cette espèce. Le monitoring des îles Kuriat s’est élargi à l’étude de la sex-ratio des nouveau-

nés. De même l’étude de l’impact de l’activité de pêche sur les populations des tortues marines a été

abordée pour le chalutage benthique, les filets de pêche artisanale et les palangres. d’autres techniques

engendrant des captures accidentelles, des essais de réduction du bycatch seront envisagées dans ce

programme. D’autres créneaux nouveaux pour connaître mieux le statut de ces reptiles ont été

également abordés comme la génétique des populations et l’étude des échouages.

Cétacés

Compétiteurs directs de l’homme puisqu’ils se nourrissent des mêmes ressources biologiques qu’il

exploite pour ses besoins, les dauphins sont incriminés de nombreux méfaits. Ces conflits entre

dauphins et pêches sont devenus une source d’inquiétude majeure au niveau de certaines pêcheries

tunisiennes, notamment celles exploitant les faibles profondeurs. Les pêcheurs accusent surtout les

dauphins de détériorer leurs filets de pêche entraînant ainsi de lourdes pertes économiques en

production halieutique, en dépenses de réparation et en acquisition de nouveaux engins.

Elasmobranches

Quelques études ont concerné quelques aspects de la biologie des deux groupes des élasmobranches :

Requins et raies et leur bycatch.

Espèces exotiques

En Tunisie et depuis le début du siècle, plusieurs migrants de la mer rouge sont sporadiquement

observés ou définitivement installés dans nos eaux marines tunisiennes et particulièrement dans la

région du golfe de Gabès. L’inventaire et l’étude de l’impact de ces espèces introduites s’imposent

donc. Une attention particulière sera réservée pour les poissons.

Lagunes tunisiennes

Dans le cadre du projet EBHaR pour la période 2006-2010, plusieurs sites lagunaires et côtiers ont été

prospectés à une certaine période de l’année. Il s’agit du golfe de Tunis, de la lagune de Bizerte, de la

lagune de Ghar El-Melh, de la lagune de Monastir, du lac sud de Tunis et de la zone côtière de Dkhila

(Monastir). Les valeurs enregistrées pour les principaux paramètres physico-chimiques sont, presque

toutes, en dessous du seuil de pollution toléré et les zones étudiées ne sont pas, a priori, menacées par

la pollution. Néanmoins, la plupart de ces zones montrent un disfonctionnement important dont la cause

principale reste indéterminée. Mais, il semble que dans ces milieux lagunaires transitoires, l’effet des

conditions extrêmes de température et de salinité semble le plus important pour le fonctionnement du

benthos animal.

Coralligène au nord de la Tunisie

Le coralligène héberge une connectivité intense parmi ses habitants. La compétition spatiale est forte,

l'espace est complètement saturé par des organismes et l’epibiosie est extrêmement fréquente. Les

réactions alello-chimiques doivent jouer un rôle important dans la compétition spatiale, puisque le

coralligène présente un très haut pourcentage d'espèce chimiquement active. Les rapports trophiques

sont aussi forts dans le coralligène, principalement parmi les espèces vagiles, puisque la plupart des

invertébrés sessiles ont un squelette qui dissuade l'alimentation. Plusieurs exemples de mutualisme,

commensalisme et de parasitisme y ont été observés.


Herbiers de posidonie

Signataire de la convention de Barcelone (Barcelone, 1995) et ayant adopté les divers protocoles établis

dans le cadre de cette convention, et notamment celui relatifs aux Aires Spécialement Protégées et à la

Diversité Biologique (ASP/DB), la Tunisie s’est engagée de prendre des mesures en vue de la

protection et de la conservation des espèces animales et végétales dans l'ensemble de la zone de la mer

Méditerranée.

L’annexe II du protocole relatif aux ASP/DB listait un ensemble d’espèces considérées en danger ou

menacées où figuraient 14 espèces végétales marines. Cette liste a été amendées par la 16ème Réunion

Ordinaire des Parties Contractantes en novembre 2009 à Marrakech (Maroc) et regroupe depuis 20

espèces végétales et tout le genre Cystoseira à l’exception de Cystoseira compressa.

Plusieurs plans d’actions ont été élaborés par le CAR/ASP à la demande des parties contractantes à la

convention de Barcelone, pour répondre, entre autre, aux besoins de conservation et de protection

d’espèces et d’habitats marins. L’INSTM de par ses compétences et ses prérogatives (recherche en

milieu marin) s’est vu attribué le statut d’associé dans le plan d’action pour la conservation de la

végétation marine en Méditerranée (UNEP(DEC)/MED IG 13/8, 2001), et a depuis réalisées plusieurs

actions en collaboration avec le soutient du CAR/ASP dans le cadre de la mise en œuvre du dit plan

d’action de la végétation marine, dont les plus récentes celles entamées courant le précédent programme

EBHaR et relatifs à l’évaluation de la qualité de l’environnement à travers un bio-indicateur

Magnoliophyte et le suivi de l’expansion d’une caulerpale envahissante. Concernant les cystoseires,

seules des données très fragmentaires et très anciennes sont disponibles à l’état actuel des choses en

Tunisie. Une mise à jour de nos connaissances spécifiques et taxonomiques s’avère obligatoires pour

répondre aux objectifs tracés par le plan d’action de la végétation marine et pour lequel l’INSTM est

associé.

b- au niveau international (Insérer autant de lignes que nécessaire)

Les espèces menacées bénéficient actuellement d’un statut particulier en Méditerranée, leur étude et leur

surveillance permettront d’établir des stratégies de protection et de conservation et par conséquent une

meilleure gestion de ces populations.

Tortues

Il est clair que l’impact des activités humaines sur les tortues marines est évident. Les principaux

dangers et effets sont :

- détérioration des habitats critiques du cycle de la vie comme les aires de nidification,

d’alimentation et d’hivernage et les routes migratoires.

- Les captures accidentelles et intentionnelles, la consommation et les collisions avec les

bateaux.

- La pollution qui touche aussi bien les espèces que les habitats.

Suite à cette situation, un plan d’action méditerranéen a été élaboré dans le cadre de la convention de

Barcelone pour la protection des tortues marines. La Tunisie a ratifié la convention de Barcelone et a

adopté le plan d’action.

La connaissance sur la génétique des populations, le statut, la biologie et l’écologie des tortues marines

s’améliore rapidement en Méditerranée mais plusieurs lacunes existent encore.

Cétacés

Les cétacés, agressés un peu partout dans le monde (pollution, compétition au niveau des ressources,

pêche ciblée ou accidentelle), sont en danger et sont de ce fait protégés par plusieurs accords et

conventions internationaux dont la plupart ont été ratifié et adopté par la Tunisie. Nous citons entre

autres l'accord sur la Conservation des Cétacés de la Mer Noire, de la Mer Méditerranée et de la zone

Atlantique adjacente (ACCOBAMS) et la convention de Barcelone et son protocole relatif aux aires

spécialement protégées et à la diversité biologique.

La résolution 2.21 de MOP2 du premier accord vise l’évaluation et l’atténuation des impacts négatifs


des interactions entre les cétacés et les activités de pêche dans la zone de l’ACCOBAMS.

Parmi les priorités du plan d’action pour la conservation des cétacés en Méditerranée, élaboré dans le

cadre de la convention de Barcelone, nous retenons l’élimination des pêches accidentelles dans les

engins de pêche et la collecte d’informations concernant les interactions cétacés – pêche.

Elasmobranches

En raison de leurs caractéristiques biologiques particulières ; un cycle sexuel relativement long, un âge

de maturité sexuel tardif, une fécondité faible induisant un faible taux de croissance des populations et

un faible taux de renouvellement ; les Elasmobranches se trouvent face à un danger d’extinction. En

effet des données partielles et des longues séries d’observations suggèrent que les chondrichtyens,

étaient plus abondants en Méditerranée il y a quelques décennies qu’aujourd’hui et qu’ils présentaient

une plus grande diversité.

Cette situation a entraîné l’émergence d’un souci international pour la conservation de cette ressource

telles que l’élaboration par l’FAO d’un Plan International d’Action pour la conservation et la gestation

de population de requins (IPOA-Shark), l’élaboration d’un projet de conservation des poissons

cartilagineux en Méditerranée par le centre des activités régionales pour les aires spécialement

protégées et la classification de certaines espèces sur la liste rouge de l’IUCN.

En Méditerranée les études concernant les requins sont fragmentaires et le statut de la majorité des

espèces méditerranéennes est inconnu. Par ailleurs, des tentatives de recherche et de coopérations

méditerranéennes ont été menées dans le but de l’étude de ce groupe. A cet effet, un programme

MEDLEM (Mediterranean Large Elasmobranchs Monitoring) a été lancé dans le cadre de la

Commission Générale de la Pêche en Méditerranée (CGPM) dans lequel la Tunisie est impliquée. Dans

ce projet, nous essayons de connaître davantage le statut de ce groupe de poissons pour avoir le

maximum d’éléments pour toute stratégie de protection.

Espèces exotiques

Le problème des espèces exotiques s’est posé sérieusement en Méditerranée depuis quelques années.

Ces espèces proviennent principalement de la mer rouge et sont dites lesseptiennes et secondairement de

l’Atlantique. Les espèces lesseptiennes intéressent principalement le bassin oriental. Certaines espèces

pourraient occuper même la niche écologique d’autres autochtones à valeur commerciale.

Lagunes tunisiennes

Les lagunes méditerranéennes montrent des spécificités particulières. Elles sont régies généralement

par un ou quelques facteurs prédominants. Dans les zones polluées, ce sont les facteurs de pollution qui

régissent le fonctionnement de l’écosystème, et dans les zones non polluées ce sont des facteurs

environnementaux, essentiellement la température, la salinité et les ressources trophiques disponibles

qui jouent un rôle prépondérant dans l’organisation des peuplements.

Coralligène au nord de la Tunisie

Le coralligène est considéré comme le deuxième pôle de biodiversité en Méditerranée. Actuellement, il

est protégé naturellement des activités humaines nuisibles puisqu’il se forme généralement dans des

profondeurs assez élevées. Mais avec l’accroissement des nuisances sur le littoral et dans les îles du

nord de la Tunisie, cet écosystème peut être touché.

Herbiers de posidonie

La posidonie est endémique à la Méditerranée, et les herbiers qu’elle forme représentent un pôle de

biodiversité, le premier en Méditerranée. Toutefois, l’état des herbiers de posidonie s’est dégradé

depuis des décennies, essentiellement dans les zones exposées aux émissaires industriels et urbains et

aux activités nuisibles comme le chalutage et les travaux d’aménagements côtiers.


3- REFERENCES DES DIX (10) PUBLICATIONS LES PLUS RECENTES (DE MOINS DE 5 ANS) ET SIGNIFICATIVES DES CHERCHEURS AYANT UN RAPPORT AVEC LES PROBLEMATIQUES A PRENDRE EN CHARGE PAR LE PROGRAMME DE RECHERCHE 1

1/ -JRIBI I., ECHWIKHI K., BRADAÏ M. N. & A. BOUAIN, 2008. Incidental capture of sea turtles by

longlines in the Gulf of Gabès (South Tunisia): A comparative study between bottom and surface longlines.

Scientia Marina 72(2): 337-342. 2/- SAIDI, B., BRADAÏ M.N. & A. BOUAIN, 2009. Reproductive biology and diet of Mustelus punctulatus

(Risso, 1826) (Chondrichthyes: Triakidae) from the Gulf of Gabès, central Mediterranean Sea. Scientia Marina

73(2), 249-258. 3/- AFLI A., BOUFAHJA F., SADRAOUI S., BEN MUSTAPHA K., AISSA P. & MRABET R., 2009.

Functional organization of the benthic macrofauna within Bizerte lagoon (south-western Mediterranean), amost-

closed area subjected to strong environmental variations. Cahiers de Biologie Marine, 50 (2) : 105-117. 4/-. CHAIEB O., EL OUAER A., MAFFUCCI F., BRADAI M.N., BENTIVEGNA F., SAID K. & N.

CHATTI, 2010. Genetic survey of loggerhead turtle Caretta caretta nesting population in Tunisia. Marine

Biodiversity Records, page 1 of 6. Marine Biological Association of the United Kingdom, 2010 5/- ECHWIKHI K., JRIBI I. BRADAÏ M. N. & A. BOUAÏN, 2010. Effect of type of bait on pelagic longline

fishery–loggerhead turtle interactions in the Gulf of Gabes (Tunisia). AQUATIC CONSERVATION: MARINE

AND FRESHWATER ECOSYSTEMS Aquatic Conserv: Mar. Freshw. Ecosyst. (2010) 6/- ENAJJAR S., BRADAÏ M. N. & A. BOUAÏN, 2008. New data on the reproductive biology of the common

guitarfish of the Gulf of Gabès (southern Tunisia, central Mediterranean). Journal of the Marine Biological

Association of the United Kingdom, 2008, 88 (5): 1063-1068 7/- BRADAI M.N. 2010. Tunisian fish and the global warming. Rapp. Comm. Int. Mer Médit., 39, 2010 8/- ZOUARI-KTARI R. & M.N. BRADAI, (2011). Reproductive biology of the lessepsian Reticulated

leatherjacket Stephanolepis diaspros (Fraser - Brünner, 1940) in the Gulf of Gabes (Eastern Mediterranean Sea). Rev Fish Biol Fisheries 9/- AFLI, A., BOUFAHJA F., SADRAOUI S., BEN MUSTAPHA K., AISSA P., R. MRABET, 2009.

Functional organization of the benthic macrofauna in the Bizerte lagoon (SW Mediterranean Sea), semi-enclosed

area subject to strong environmental/anthropogenic variations. Cahiers de Biologie Marine, V. 50, p.105-117

10/- AYARI R., MUIR A., PATERSON G., AFLI A. & P. AISSA, 2009. An updated list of polychaetous

annelids from Tunisian coasts (Western Mediterranean Sea). Cahiers de Biologie Marine, V. 50, p.33-45


4- STRUCTURES ET AUTRES ORGANISMES D’APPUI a- Quels sont les laboratoires et organismes étrangers ou internationaux avec lesquels des relations de collaboration régulières ont déjà été établies ?


-1er organisme : Le Centre des Activités Régionales pour les Aires Spécialement Protégées

(CAR/ASP-PNUE-PAM) -2ème organisme: Accord sur la conservation des cétacés de la mer noire, de la Méditerranée et

de la zone atlantique adjacente (ACCOBAMS) b- Des conventions particulières ont elles déjà été signées avec certains d’entres eux ? Lesquels?


c- Des relations avec les universitaires et chercheurs tunisiens établis à l’étranger ont-elles été initiées ou développées ?

(Insérer autant de lignes que nécessaire) .....................................................................................................................................................................................................................…..... .....................................................................................................................................................................................................................…..... .....................................................................................................................................................................................................................….....

.....................................................................................................................................................................................................................….....

- Convention N° 89/2009 (CAR/ASP-INSTM) : Effet des hameçons circulaires et la nature

de l’appât sur le taux des captures accidentelles des tortues marines aux palangres.

- Convention 2010 (CAR/ASP-INSTM) : suivi de la nidification des tortues marines aux îles

Kuriat.

- Mémorandum d’accord N° 01/2008 (ACCOBAMS-INSTM) : Etude des interactions

dauphins – filets de pêche au niveau des pêcheries artisanales de Kerkennah et de Kélibia :

évaluation des dégâts et des pertes économiques


d- Des coopérations de travail existent–elles déjà avec des universitaires étrangers ou tunisiens établis à l’étranger en termes de co-tutelle de doctorants en particulier ?


- Bernard SERET (IRD)

Muséum national d'Histoire naturelle

Département Systématique et Evolution

CP 51

55 rue Buffon

75231 PARIS cedex 05

Tel. : (33) 01.40.79.37.38

E-mail : [email protected]

- Flegra Bentivegna

Curator of Naples Aquarium

Villa Comunale 1

80121 Naples

tel: 0039-081-5833-400

fax: 0039-081-5833-294

mailto:[email protected]

http://www.szn.it

e- Des relations de collaboration formalisées ou régulières ont elles été établies avec d’autres laboratoires de recherche tunisiens, d’autres institutions ou organismes nationaux ? Lesquels ?


UR Biodiversité et Ecosystèmes Aquatiques (Faculté des Sciences de Sfax) LBE (Faculté des Sciences de Bizerte)

Laboratoire d’Ecologie Marine (INAT – Tunis) Laboratoire des ressources marines vivantes (INSTM) Laboratoire Milieu marin (INSTM) Laboratoire d’Aquaculture (INSTM)




http://www.szn.it/


5- METHODOLOGIE DE REALISATION DU PROGRAMME DE RECHERCHE 1


Pour la réalisation du programme de recherche, il est prévu de faire :

Des prospections en mer Pour les études des interactions avec la pêche, la délimitation d’habitats sensibles et la collecte des

échantillons biologique, la mesure de paramètres physicochimiques et l’observation d’éventuels

phénomènes écologiques.

Un nombre représentatif de stations sera retenu. Certains paramètres physico-chimiques seront mesurés

sur place à l’aide d’un multiparamètre. Les prélèvements biologiques seront réalisés avec des techniques

propres à chaque maillon de la faune (filets de pêches, benne, carotte, drague, bouteille à renversement,

quadrat, etc.).

Les associations et communautés seront étudiées également par plongée dans les profondeurs ne

dépassant pas 55 m de profondeurs et par vidéo caméra (surtout pour le coralligène). L’identification des

limites supérieures et inférieures des herbiers dans la région d’étude (nord) par différentes méthodes selon

les conditions des milieux. Elle peut être réalisée soit par observation directe à partir de la surface à l’aide

d’une lunette de Calfat ou par interprétation d’images satellites quand elles existent (en zones peu

profonde), soit par observation directe en plongée sous marine, ou indirecte à l’aide du ROV (si

disponible) et de matériel navigant (en zone profonde).

Travail de terrain sur le continent - Prospections des plages pour la nidification de la tortue marine et le suivi des échouages des

tortues et cétacés

- Des enquêtes dans les ports en relation avec le bycatch et échantillonnage biologique aux

points de débarquement

- Prospection des sources hydrothermales

- Récupération des co-produits à partir des usines de transformations des produits de la mer

- Récupération des bycatch à partir des campagnes de Hannibal.

Au laboratoire - les échantillons destinés à l’étude biologique seront triés et les espèces seront identifiées et

comptées. Ensuite des analyses statistiques univariées et multivariées seront réalisées sur les

données obtenues. Ce qui va permettre de tester plusieurs approches scientifiques

complémentaires, trophique, écologique, taxonomique et autres

- Détermination des paramètres biologiques des poissons étudiés par observation et coupe des

structures osseuses (âge et croissance), l’évolution des gonades (paramètres de reproduction) et

par l’utilisation d’indices appropriés (régime alimentaire)

- Pour les études génétiques, la méthodologie serait la suivante :

1- Extraction de l’ADN

2- Electrophorèse sur gel d'agarose

3- Amplification par PCR (Polymerase Chain Reaction)

4- Purification des produits d’amplification

5- Séquençage

6- Analyse des séquences

7- Analyse phylogénétique des données


6- MISE EN ŒUVRE DU PROGRAMME DE RECHERCHE 1 SOUS FORME DE PROJETS

(Le chef de projet devrait avoir au moins le grade de Maître Assistant ou grades équivalents)

a- Les projets répondant aux objectifs scientifiques du programme de recherche à financier sur des

crédits publics

(Insérer autant de blocs et lignes que nécessaire)

Projet 1 : Reconnaissance et conservation des poissons, tortues et cétacés et de leurs habitats.

Nom du chef du projet : Mohamed Nejmeddine Bradai

Grade : Directeur de Recherche

Nom des chercheurs impliqués : Grade :

Nejla Béjaoui MC

BRADAI Mohamed Nejmeddine SAÏDI Béchir

FADHLAOUI Karima

ATTIA EL HILI Hédia

CHAIEB Olfa

Imed Jribi

Ali El Ouaer

RAIS Chedly

D.R MA

M.A (collaboratrice) Dr.

Vétérinaire (collaborateur) A.R

M.A (collaborateur) Ing en chef (collaborateur)

A.R (collaborateur)

Nom des doctorants à mobiliser dans le cadre du projet :

- Mabrouk Lotfi (inscrit en2008/2009) - BEN MASSAOUD Rimel (inscrite en 2009- 2010)

Date de démarrage prévue du projet : Deuxième semestre 2011

Projet 2 : Diversité biologique dans les écosystèmes fragiles

Nom du chef du projet : Ahmad Afli Grade : Maître assistant habilité

Nom des chercheurs impliqués :

Grade :

AFLI Ahmed

BEN MUSTAPHA

Karim LANGAR Habib

ARAFA Soumaya

DJABOU Hanem

M.C

As

M.A.H

MA (collaboratrice) Ing. (collaboratrice)

Med Salah Romdhane Fériel Sellem

Pr. (collaborateur) MA (collaboratrice)


- Houssem KERKENI (1ère inscription en 2008/2009) - Mabrouk Lotfi (inscrit en 2008/2009) - Hédi Ben Hassine Salah (2009/2010)


b- Les projets répondant aux objectifs du monde économique et financés par des crédits privés (entreprises et autres organismes)


Projet 1 :

Entreprise ou organisme concerné :

Nom du chef du projet : Grade :



Date de démarrage prévue du projet :

Le projet fait-il l’objet d’un contrat entre le laboratoire et l’entreprise ou l’organisme concerné?


c- Les projets à exécuter dans le cadre de la coopération internationale et financés par des organismes étrangers


Projet 1 :

Nom du chef de projet tunisien :

Nom du bailleur de fonds :

Noms des partenaires institutionnels étrangers :

Type de coopération : bilatérale multilatérale



Date de démarrage prévue du projet :

Durée prévue du projet :


7- ECHEANCIER DE MISE EN ŒUVRE DES PROJETS DE RECHERCHE

- 1ère année : - Réunions et mobilisation de l’équipe de recherche

- Bibliographie et collecte de données

- Choix des sites dans les zones retenues

- Planification, essai du matériel et préparation des campagnes en mer

Projet 1

- Monitoring du site des îles Kuriat

- Etude de la sex-ratio de la caouanne Caretta caretta

- Expérimentation des hameçons circulaires

- Prospection et étude des échouages des tortues marines et des cétacés ;

- Prélèvement des échantillons pour les études génétiques (tortues et cétacées) ;

- Etude des espèces rares de poisson et suivi des espèces exotiques ;

- Etude des interactions dauphins- filets de pêche à bord et dans les ports ;

- Expérimentation des pingers et évaluation de l’effet sur l’interaction des filet avec les dauphins et

l’effet sur la pêche ;

- Diversité des dasyatidés dans le golfe de Gabès (études systématiques)

- Etude des nurseries pour les élasmobranches

- Échantillonnage de vertèbres des espèces d’élasmobranches concernées par l’étude

- de l’âge et la croissance

- Étude de l’interaction élasmobranches chalut dans le golfe de Gabès

- Suivi des débarquements et des campagnes de pêches spécifiques des élasmobranches dans le sud

Tunisien.

- Echantillonnage pour les études génétiques (élasmobranches)

- Etude de l’impact des cages d’aquaculture sur l’environnement (mesures des paramètres et

échantillonnage)

Projet 2

- Réalisation des campagnes en mer et collecte des données (inventaires, comptages, densités,

distribution, etc.)

- Analyse de laboratoire des échantillons recueillis

- Détermination des paramètres physico-chimiques de l’eau et du sédiment

- Identification des espèces

- 2ème année : Projet 1


Les membres de l’équipe de recherche assurent –t-ils une veille pour saisir les opportunités de financement fournies :

- par l’Union Européenne dans le cadre de l’accord spécifique de coopération scientifique et

technologique avec la Tunisie ? Oui

- par les conventions de coopération scientifique et technique entre la Tunisie et les pays amis?

- par les organisations du système des Nations Unies? Oui


- Etude de la sex-ratio de la caouanne Caretta caretta

- la recherche d’éventuels sites de nidification des tortues ;

- Prospection et étude des échouages des tortues marines et des cétacés ;

- Prélèvement des échantillons pour les études génétiques (tortues et cétacées) ;

- Etude des interactions tortues- engins de pêche avec une éventuelle extension aux zones nord et

Est ;

- Analyse des résultats sur les espèces de poissons rares, et suivi des espèces exotiques;

- Etude des interactions dauphins- filets de pêche à bord et dans les ports ;

- Ecobiologie des dasyatidés dans le golfe de Gabès


- Échantillonnage de vertèbres des espèces d’élasmobranches concernées par l’étude

- de l’âge et la croissance


- Suivi des débarquements et des campagnes de pêches spécifiques des élasmobranches dans le sud

Tunisien.

- Echantillonnage pour les études génétiques (élasmobranches)

- Etude de l’impact des cages d’aquaculture sur l’environnement (analyse des données)

-

Projet 2

- Réalisation de campagnes de prospection en mer

- Analyse des données

- Analyse au laboratoire des échantillons



- 3ème année : Projet 1


- Analyse des résultats de la sex-ratio de la caouanne Caretta caretta

- Analyse des résultats de l’étude des interactions tortues- engins de pêche

- Etudes génétiques (tortues et cétacées et mérous)

- Etude des interactions dauphins- filets de pêche à bord et dans les ports


- Détermination de l’âge et la croissance des espèces d’élasmobranches concernées


- Analyse des débarquements et des campagnes de pêches spécifiques des élasmobranches dans le

sud Tunisien.

- Etudes génétiques (élasmobranches)

Projet 2

- Réalisation de campagnes de prospection en mer

- Analyse des données et contrôle


- Analyse au laboratoire des échantillons recueillis


- Production scientifique (articles et communications lors de manifestations scientifiques)

- 4ème année : - Analyse et traitement des données obtenues

Projet 1

- Elaboration d’un plan d’action national pour la conservation et la gestion des élasmobranches


- Elaboration d’un plan d’action national pour la conservation des tortues marines

Projet 2

- Analyse des données obtenues

- Elaboration du rapport final

8- CONSISTANCE DES RESULTATS ATTENDUS DES PROJETS DE RECHERCHE a- La pertinence des résultats attendus des projets recherche Par rapport à la problématique posée au départ et aux objectifs spécifiques visés par les activités programmées dans le cadre de chacun des projets prévus, explicitez la plus value identifiable et évaluable de chaque projet :


Projet 1 : Reconnaissance et conservation des poissons, tortues et cétacés et de leurs habitats

Nom du chef de projet : Mohamed Nejmeddine Bradai

Résultat attendu : - Connaissance du statut des tortues marines nécessaire pour l’élaboration d’un plan d’action

national de protection - Connaissance des paramètres biologiques des élasmobranches et de certains poissons

- osseux (mérous, Scaridae et Dactylopteridae), des zones des nurseries ainsi que des captures

accidentelles pour des fins de conservation et d’aménagement des pêcheries.

- Nos connaissances sur la faune cétologique (espèces, abondance et répartition) seront améliorées.

De même les interactions dauphins – pêche seront élucidés d’avantage.

- Les révisions systématiques permettent d’avoir une idée claire sur la biodiversité de la faune

ichtyologique tunisienne (élasmobranches et quelques poissons osseux) - Impact des changements globaux sur l’environnement marin et particulièrement sur la faune

ichtyologique tunisienne.

- En quoi consisterait la pertinence scientifique ou l’originalité des résultats attendus du projet? - Ces résultats visent-ils à améliorer la connaissance scientifique? - Ces résultats visent-ils une innovation technologique? - En quoi le projet peut-t-il contribuer au développement économique et/ou ou culturel du pays? - En quoi ses résultats seraient-ils socialement pertinents?

Projet 2 : Diversité biologique dans les écosystèmes fragiles

Nom du chef de projet : Ahmad Afli

Résultat attendu :

- Mise en place d’une méthodologie d’étude écosystèmique et qui peut être reproduite après sur

d’autres sites lagunaires.

- Etablissement de l’état écologique d’une lagune avec un travail multidisciplinaire

- Inventaires taxonomiques de groupes importants structurant le coralligène et recensements de ces

principaux biotopes


- Connaissance de la structure et du fonctionnement de l’habitat coralligène par le biais d’indices

dont plusieurs seront utilisés pour la première fois

- Connaissance de la distribution spatiale du coralligène dans certains sites remarquables à travers

l’usage de nouvelles techniques performantes (sonar à balayage latéral interféromètres

bathymétriques)

- Caractériser les herbiers de posidonie (cartographie et paramètres biométriques) et les

peuplements associés (épiphytisme sur les feuilles et les rhizomes) dans la zone de Mahdia

- Monitoring (Sidi Ali El-Mekki et Kerkennah) et inventaire des cystoseires dans les stations

prospectées par Ben Maïz et al. (1987)

b-La consistance des résultats attendus du programme de recherche 1 en termes de formation diplômante (habilitations, thèses, mastères)

- Liste nominative des enseignants-chercheurs du corps B susceptibles de soutenir leurs habilitations au terme du mandat de 4 ans du laboratoire.

Saidi Béchir

- Liste nominative des doctorants susceptibles de soutenir leurs thèses de doctorat au terme du mandat de 4 ans du laboratoire.

- Mabrouk Lotfi - BEN MASSAOUD Rimel - Hédi Ben Hassine Salah - Houssem KERKENI

- Nombre estimatif d’étudiants susceptibles de soutenir leurs mémoires de mastère au terme du mandat de 4 ans du laboratoire.

09

c- La consistance de la production scientifique du programme de recherche

- Nombre estimatif d’ouvrages individuels ou collectifs et autres publications spécifiques.

01

- Nombre estimatif d’articles scientifiques dans les revues indexées, à comité de lectures. 17

- Nombre estimatif de communications à des manifestations scientifiques internationales et nationales avec actes.

30

d- Nombre estimatif de brevets d’invention ou d’obtentions végétales du programme de recherche (sur les 4 ans)


PROGRAMME DE RECHERCHE 2

Biotechnologie Marine

1- OBJECTIFS SCIENTIFIQUES DU PROGRAMME DE RECHERCHE 2

a- Objectif général du programme de recherche 2

Le programme de recherche vise la prospection et l’identification des souches de microalgues

thermophiles peuplant les écosystèmes associés aux sources hydrothermales de la Tunisie et la recherche

et la caractérisation d’actifs biologiques issus de ces microalgues.

Le projet s’intéresse également à l’étude de certains mécanismes physiologiques d’adaptation de certaines

souches des microalgues aux conditions d’extrêmes températures.

Sur le plan technologique, le projet vise la modélisation et l’optimisation des procédés de culture de

certaines souches thermophiles ainsi que l’induction de synthèse de leurs potentiels bioactifs.

De même une étude d’extraction des substances bioactives et bioénergétiques des algues et autres

organismes est programmé.

Dans la même voie de valorisation de la biomasse végétale aquatique, l’objectif est de se tourner vers les

macroalgues peu exploitées sur nos côtes par l’extraction de substances à haute valeur ajoutée pouvant être

employés dans différents domaines (agroalimentaire, santé, environnement, bioénergie). Lorsque les

ressources naturelles ne suffisent pas à combler les besoins du marché il faut se tourner vers la culture et

c’est dans cette optique que ce projet vise l’étude et l’optimisation des conditions de culture de

macroalgues potentiellement exploitables en Tunisie pour répondre à ce besoin.

Pour s’aligner aux thématiques actuelles d’intérêt communautaire à savoir l'agro-alimentaire et

l'environnement; ce programme de recherche a également inclus la qualité des produits halio-alimentaire,

la gestion des co-produits générés par les usines de transformation des produits de la pêche et l'étude des

statuts des organismes aquatiques dans leurs milieux. L'un des objectifs de ce projet est aussi de contribuer

à la mise au point de procédés pour prévenir l'apparition de l'altération et de prolonger la durée de

conservation des produits de pêche en utilisant des anti-oxydants et anti-microbiens naturels, et des

emballages innovants (biofilms). Il vise ainsi à l'amélioration de la qualité générique et spécifique des

produits de la mer. Il est nécessaire de contribuer à élaborer des procédures d'extraction, de fractionnement

et d'identification de biomolécules à partir de la biomasse aquatique. Il s'agit de procéder à la

caractérisation des différentes composantes des espèces marines (végétale et animale) et de leurs

coproduits, particulièrement sur les plans enzymatique et lipidique (oméga-3), et d’évaluer le potentiel des

ingrédients actifs et l’adaptation de méthodes analytiques spécifiques pour l’identification de biomolécules

marines.

La contribution au maintien et au développement durable de la filière aquacole de production du bar et de

la daurade en Tunisie représente également une priorité de recherche de ce programme. Il vise à favoriser

la mise sur le marché d’espèces répondants aux besoins du consommateur et de développer des procédés

de conditionnement adéquats répondants aux besoins de santé et de bien être du consommateur.

Enfin le programme traite de l'aspect environnemental des organismes aquatiques et contribue à l'étude de

l’effet modulateur de l’environnement sur le potentiel toxique des pathogènes et son interférence sur les

espèces cibles aquatiques et de biodégradation ou traitement biologique. Répondant aux thématiques de

recherches prioritaires tunisienne et internationale, ce programme a été subdivisé en quatre axes de

recherche:

1- Identification, sélection, isolement et optimisation de la production et recherche de substances

d’intérêt es des microalgues thermophiles

2- Extraction de Bioactifs d’Organismes Marins (macroalgues surtout)


3- Qualité Halio-Alimentaire des produites de la mer

4- Toxines Microbiennes et Biodégradation Des Organismes Aquatiques

b- Quels seraient les objectifs spécifiques du programme de recherche ?


1er

objectif Spécifique:

Prospection des sources hydrothermales,

Identification et purification de souches de

microalgues thermophiles.

2ème


Modélisation et optimisation de la culture en

laboratoire ainsi que de la synthèse d’actifs

d’intérêt par les espèces sélectionnées.

3ème


Fractionnement et caractérisation de certaines

substances actives.

Screening d’activités biologiques.

4ème

objectif Spécifique

Etude des mécanismes physiologiques

d’adaptation de ces souches aux extrêmes

températures.

Résultats attendus:

Listing de souches de microalgues peuplant les

écosystèmes associés aux sources hydrothermales.

Constitution d’une souchethèque au sein du

laboratoire.

Déterminer les équations des modèles de croissance,

de productivité et de synthèse d’actifs biologiques en

fonction des facteurs du milieu de culture.

Certains actifs seront induits expérimentalement de

façon à obtenir une synthèse maximale.

Des actifs biologiques d’intérêt seront identifiés.

Des actifs seront incorporés dans des produits finis et

semi finis.

Mettre en évidence des stratégies morphologiques et

physiologiques d’adaptation aux fortes températures

5ème

objectif spécifique

-Culture au laboratoire de l’espèce Gracilaria à

partir de spores et essais de transplantation en

milieu naturel.

6ème objectif spécifique:

-Culture au laboratoire de l’espèce Gracilaria à

partir de spores et essais de transplantation en

milieu naturel

7ème

objectif spécifique:

-Culture en milieu contrôlé de l’algue

Gracilaria verrucosa à partir de boutures du

milieu naturel

8ème


-Culture des macroalgues dans les effluents

piscicoles.

9ème



-Maîtrise et optimisation des étapes de cultures

depuis la sporulation jusqu’à l’obtention de plantules

dans des milieux artificiels de laboratoire et leur

implantation en milieu naturel.

-Mise au point de techniques de culture des

Gracilaria appropriées à la nature du site

(bathymétrie, substrat, mouvements des eaux…).

-Acquisition de certaines connaissances sur la

transformation de l’agar en matériau plastique

-Assurer un approvisionnement continu d’algues

pour la production de biocarburant.

-Obtention d’un pigment purifié ayant des

applications dans différents domaines

-Mise en évidence de macroalgues pouvant être


-Voie de valorisation de l’agar pour la

production de matériaux plastique

10ème


-Extraction et purification du pigment R-

phycoérythrine.

11ème


-Etude des activités antibiotiques, inhibitrice du

développement de microalgues, de macroalgues

et d’invertébrés marins pour différentes espèces

d’algues récoltées sur les côtes tunisiennes.

-Isolement et analyse structurale des composés

actifs

-Isolement de bactéries associées aux

macroalgues

-Etudes des propriétés biologiques des bactéries

isolées

-Comparaison des activités des bactéries

trouvées avec celles des algues « hôtes».

12ème


-Identification et caractérisation des sources

algales pouvant être utilisées dans la production

de bioénergie

-Mise en œuvre du procédé de production de

bioéthanol.

utilisées pour la production de substances antifouling

pour remplacer les biocides de synthèses toxiques

utilisés actuellement dans les peintures antifouling

-Identification des biomolécules actives de

macroalgues.

-Mise en évidence d’activités biologiques produites

par les bactéries associées pouvant être exploitées

dans différents domaines

-Essai de compréhension du rôle des bactéries

associées dans la protection contre l’épiphytisme de

macroalgues.

-Fournir les données nécessaires pour choisir la voie

de valorisation appropriée: hydrolyse, méthanisation

ou estérification.

-Déterminer les conditions optimales des différentes

étapes (hydrolyse et fermentation) dans la production

du bioéthanol

13ème


-Valoriser les coproduits issus des unités de

transformation des produits de la pêche.

-Etude des propriétés biologiques des

hydrolysats protéiques

-Isolement des acides gras polyinsaturés à partir

des déchets des produits de la pêche

-Etude comparative des collagènes extraits de

différentes sources

14ème


-Etude des propriétés spécifiques de certains

produits de la pêche (sardine, crevettes).

15ème


-Fractionnement et étude des propriétés

fonctionnelles de certains polysaccharides partir

des coproduits de crustacés

16ème


-Elaboration de nouvelles méthodes rapides

capables d'évaluer la qualité des produits

aquatiques.


-Production des hydrolysats des protéines à partir des

sous-produits de la pêche présentant des propriétés

fonctionnelles dans la conservation des produits

aquatiques transformés.

-Caractérisation saisonnière des acides gras des sous-

produits des poissons bleus.

-Détermination des propriétés des collagènes extraits

de la peau des poissons cartilagineux.

- Déterminer les conditions optimales assurant la

qualité supérieure de la crevette royale et de la

sardine pour leur attribuer un signe de qualité.

-Production de biofilms et de revêtement alimentaires

naturels

-Développement et validation de méthodes d’analyse

des sulfites


17ème


Etude de la viabilité cellulaire chez les bivalves

durant le stockage à l’état vivant

18ème


- Assurer la salubrité et l’innocuité des produits

de la pêche.

19ème


-Assurer la traçabilité des produits halio-

alimentaires afin d’éviter les fraudes et le

mauvais étiquetage.

20ème


-Caractérisation des peptides indicateurs de la

dégradation de la qualité des produits de la mer

au cours de la conservation.

21ème


-Etudes des activités anti-microbiennes/anti-

oxydantes de substances naturelles pour la

préservation des produits halio-alimentaires

22ème


-Déterminer les indicateurs de stress chez les

organismes stockés à l’état vivant.

23ème


-Caractérisation et modulation de la composition

lipidique et de la qualité de la chair des poissons

(loup et daurade) d’élevage par le facteur

alimentation.

-Mise en place d’un nouveau model de contrôle de

l’état vivant et de fraîcheur.

-Elaboration et validation de nouvelles méthodes

pour l’analyse des toxines d’origine aquatique.

-Mise en place et maîtrise des méthodes d’extraction

et de détection des virus à partir des coquillages.

-Développement et validation de nouvelles méthodes

de détection et d’identification moléculaire des gènes

codant pour les enzymes d’altération.

-Elaboration des méthodes d’identifications qui sont

facile à appliquer, simple et rapide.

-Production des amorces universelles ayant des

intérêts dans le secteur industriel.

-Prévenir la dégradation post-mortem des produits

halio-alimentaires.

-Identifier les facteurs influant la qualité

nutritionnelle et de fraîcheur chez les poissons

sauvages et d’élevage au cours du stockage.

-Production de produits halio-alimentaires innovants.

-Préservation de la qualité nutritionnelle et

organoleptique en fonction des procédures de

transformation.

-Prolongation de la survie des organismes aquatiques

en anoxie ou pendant le stockage à l’état vivant par

traitements spécifiques.

- Acquisition des connaissances sur les critères

prédictifs de la qualité de la chair de poisson qui

pourront être pris en compte dans les filières de

production piscicole du loup et daurade.

- Détermination des effets des lipides alimentaires sur

la constitution des dépôts lipidiques et incidence sur

la qualité de la chair des poissons d’élevage (loup et

daurade).

Meilleure valorisation économique des produits

aquacoles.

24ème


- Etude spécifiques de substances toxiques

générées par les bactéries et cyanobactéries et

modulation de leurs effets par les facteurs

abiotiques et biotiques sur les espèces cibles

marines.

-Caractérisation spécifiques des toxines ou

bactériocines les plus actives en zones marines

côtières, leurs interférences organiques et leurs

modes d’activation.


25ème


- Etude spécifiques des différentes formes de

cyanotoxines et autres toxines associées en zones

continentales et effets de l’environnement sur

leur potentiel toxique.

26ème


Tendances de biodégradation des micro-

organismes et potentiel de réhabilitation ou de

bio remédiation.

27ème


Evaluation simultanée des effets générés par les

différentes formes des toxines étudiées : mise en

place de batterie de biomarqueurs spécifiques

(biochimiques, physiologiques et génotoxiques

et bioessais).

-Caractérisation spécifiques des cyanotoxines et/ou

les bactériocines associées en zones continentales

marines côtières, leurs interférences organiques et

leurs modes d’activation.

- Screening des activités biologiques et de

biodégradation et leurs modulations.

-Evaluation des différents types d’effets générés par

les toxines en termes d’altérations moyennant

l’application d’ approches multi-marqueurs.

-Intégration de nouveaux outils d’analyse

toxicologique.

c- Ces objectifs sont- ils compatibles avec la mission de l’établissement auquel se rattache le

laboratoire ?

Oui, surtout que parmi les missions de l’INSTM on peut lire :

Mener des programmes de recherche sur contrat dans des domaines liés directement ou

indirectement à la mer, à ses ressources et à l’aquaculture: Pêche, Agriculture, Environnement

marin, Biotechnologies marine, Océanographie, Secteur piscicole, etc.

d- Quels sont les 4 mots clés qui caractérisent le mieux l’orientation générale du programme de

recherche et la spécificité des compétences des chercheurs ?

1/- Extraction des substances bioactives 3/- Qualité des produits halio-alimentaire

2/-Toxicité 4/-Valorisation


2- ETAT DES CONNAISSANCES RELATIVES AUX PROBLEMATIQUES A PRENDRE EN

CHARGE PAR LE PROGRAMME DE RECHERCHE 2

c- au niveau national


L'étude des microalgues et leur utilisation comme source de produits et composés valorisables a débuté

en Tunisie en 1996, dans le cadre de collaborations entre le centre universitaire de biotechnologie algale

(CUBIA) de l’université de Liège et l’institut national des sciences et technologies de la mer (INSTM).

Pas moins de 9 projets sont initiés dans ce cadre, depuis 1996. Trois de ces projets sont inscrits dans le

cadre du fond DGCI belge de transfert de technologies. Ils sont intitulés comme suit :

- Développement d'un pilote de culture de microalgues spiruline. Définition des voies de

valorisation de la biomasse et des conditions pour la mise en place d'une unité industrielle de

production en Tunisie.

- Transfert développement et promotion des technologies visant aux applications

économiques des microalgues en Tunisie.

- Evaluation des ressources naturelles et transfert de technologies de culture et de valorisation

de la microalgue Dunaliella.

Deux projets d’action dans le cadre de l’arrangement particulier entre la Belgique et la Tunisie relatif au

financement d’études et de consultances multisectorielles :

- Organisation d’une journée d’information sur la valorisation industrielle des microalgues en

Tunisie.

Action de consultation en vue de l’établissement d’un modèle de structure d’unités de liaison avec

l’environnement socio économique à l’INSTM.

L’étude des activités biologiques des macroalgues et l’extraction de composés actifs sont une

nouvelle voie de recherche. Actuellement, le screening des propriétés antifouling d’un grand nombre

d’espèces (algues brunes et vertes) a été réalisé. Les résultats ont permis de cibler certaines espèces

(appartenant aux groupes taxonomiques des Fucales et Dictyotales (pour les brunes) et des Bryopsidales

(pour les vertes)) potentiellement exploitables dans ce domaine afin d’en extraire des substances actives

non polluantes. De plus une étude portant sur l’analyse du microfouling a été réalisée et a permis

l’isolement et l’identification de bactéries et de microalgues foulantes. Ces microorganismes font

maintenant partie de la souchothèque de l’INSTM et constituent des organismes tests permettant de

réaliser des tests biologiques appropriés à l’étude de l’activité antifouling.

Le processus de production est particulièrement important dans le domaine de la pêche et des produits

halio-alimentaires car il peut avoir des incidences considérables sur la qualité du produit aquatique et

sur l'environnement. A titre d'exemple, les déchets générés par les conserveries tunisiennes de thon et

sardine représentent environ et respectivement 50 et 30% de leurs productions estimées à 22800 tonnes

(GICA 2008). De tels produits constituent une importante source polluante mais qui peut être valorisée

pour en extraire des produits de hautes valeurs tels que les huiles de poissons et les hydrolysats

protéiques. Ces bioproduits peuvent être également obtenus à partir des poissons de faibles valeurs

marchandes, des déchets (environ 1500T/an) des usines de transformations des crevettes et des

seiches/poulpes, des filetage des poissons et également des écart de triage qui concernent tous les

produits plus au moins altérés lors de la pêche, du transport, de la manutention ou retirés après triage

dans les usines de conditionnement, de congélation ou de conserverie de poissons. A ce titre, l’encre de

seiche s’est révélé efficace pour prolonger la conservation des crevettes (Sadok et al., 2004).

La FAO, qui a étendu son action dans de nombreux domaines correspondant à différents aspects de la

qualité, en particulier celui de la sécurité sanitaire et la qualité nutritionnelle, a récemment inclus celui

de la qualité spécifique. Cette dernière, correspond à une démarche supplémentaire pour valoriser les

caractéristiques spécifiques du produit liées à sa composition et à ses méthodes de

production/commercialisation, permettant ainsi de différencier le produit et de lui attribuer un signe de

qualité ou un label, tel est le cas de l'huître en France (label rouge). Dans ce contexte, des initiatives ont


été prises à l’échelle nationale, initiées par le GIPP pour valoriser certains produits de la pêche telles que

la sardine ou la crevette royale en leurs octroyant un signe de qualité. De son coté, le centre international

des technologies de l'environnement de Tunis (CITET) a lancé au cours de cette année (2009), la

création d'Ecolabel tunisien dans deux secteurs économiques importants dont celui de l'agro-alimentaire

ayant pour objectifs la rationalisation de l'utilisation des ressources naturelles ainsi que la réduction des

déchets. Cette démarche doit passer par des études concernant la caractérisation biochimique de ces

produits et l’étude de l’amélioration de leurs préservations.

Pour la filière de production aquacole du loup et daurade, la production se situe aux alentours de 4000

tonnes en 2010. Cette production est le produit de plusieurs unités de production actives à terre et en

cages en mer ouverte.

Le nouveau plan stratégique de développement de l’aquaculture marine élaboré par le Ministère de

l’Agriculture vise à atteindre en 2016 une production d’environ 10000 tonnes des poissons marins,

essentiellement loups et daurades.

C’est dans ce cadre général que le présent programme de recherche inclus également cette action pour

servir de soutien et contribuer à la consolidation de la filière de production de loup et daurade

notamment par l’assurance de la qualité du produit d’élevage.

Dans ce contexte de forte complexité, seule une approche pluridisciplinaire associant de manière étroite

connaissance des produits et impact des procédés sur la qualité permet de proposer des procédés

innovants à même de mieux valoriser les produits de la pêche/halio-alimentaires et les co-produits

générés par les usines de transformations. Ce projet sera ainsi subdivisé selon trois actions:

- La première action: Valorisation des produits et co-produits aquatiques,

- La seconde action: Appui à la conception de la qualité par la maîtrise des procédés,

- La troisième action: Amélioration de la conservation des produits aquatiques

Les nuisances notamment générés par les micro-organismes pathogènes sont exprimées par la

production de toxines (bactériocines, phycotoxines, cyanotoxines…etc) à différentes concentrations et

dont les effets sont détectés à différentes échelles biologique : organique, physiologique, génétique ou

biochimique.

Les différentes formes de toxines ou métabolites secondaires (produits extra cellulaires actives sur la

faune et la flore marine ou dulçaquicole) sont générés pour la plupart par les micro-organismes

pathogènes ou opportunistes et constituent des indicateurs permettant l’évaluation fiable de l’état de

santé des espèces aquatiques dans leurs milieux et/ou leur qualité en tant que produits à haute valeur

commerciale. Ces substances constituent des réponses à l’émergence et l’intensification de différents

types d’agressions (altérations et/ou maladies) en milieux marins ou dulçaquicoles affectant des espèces

écologiquement ou économiquement importantes, touchant de plus prés les espèces benthiques, et

pouvant mener dans certains cas jusqu'à l’éradication de populations entières, et conduisent à

d’importants bouleversements des écosystèmes aquatiques.

Aussi, les toxines ou bio molécules constituent les différentes formes d’expression des agents

pathogènes (bactéries, micro-algues ou protozoaires) qui sont susceptibles de générer des conditions

complexes et aléatoires laissant souvent des filières de production dans le désarroi. Dans un cadre plus

complexe, les composés toxiques élaborés par les micro-organismes benthiques et/ou épiphytes sont

souvent produits en association synergique par deux types de micro-organismes (tel le cas des

cyanotoxines et bactériocines associées).

En milieu marin côtier comme en milieu dulçaquicole, le métabolisme des micro-organismes et leur

croissance sont régulés et/ou forcés par les facteurs environnementaux : abiotiques (température,

salinité, ensoleillement…etc), biotiques (nutritionnelles) ou les variations climatiques inter-annuelles

telle que l’oscillation Sud du phénomène El Nino, qui sont susceptibles de moduler l’expression

toxicogène par induction des changements de génotypes (cas des bactéries, cyanobactéries,

champignons et parasites) les rendant plus virulentes.

Dans le même contexte, l’effet d’anthropisation organique est inducteur de production de

biomolécules de dégradation qui confèrent aux micro-organismes une multi-résistance en déviant leur

métabolisme ou biosynthèse rendant la détection des effets plus complexes nécessitant la mise en place

de techniques de pointe quant à leur identification et la détection des différentes formes de toxines ou de

molécules biodégradables.

En Tunisie, les ressources marines et aquacoles notamment en bivalves et poissons benthiques


demeurent très vulnérables à toute source toxique. L’étude des différentes voies toxiques générées par

les micro-organismes notamment pathogènes ainsi que leur influence sur les espèces exploitables

s’avère très importante en amont pour leur gestion rationnelle.

Par ailleurs, l’exploitation des différentes voies de biodégradation est impérative en vue de remédier aux

différents types de nuisances notamment par la mise au point de procédés de traitement biologique se

basant sur le pouvoir épurateur de quelques organismes aquatiques.

Ainsi, le présent programme vient consolider et compléter les actions précédentes de l’INSTM en

termes de bio surveillance (programmes de recherche (1998 – 2002), (2002 – 2006) et (2006-2009)) via

la coordination d’un groupe de recherche inter laboratoire et en collaboration très étroite avec les

institutions de recherche universitaires en terme de pathologie et toxicologie aquatique. L’utilisation

d’un grand nombre d’acquis sera mis au profit d’étude du potentiel toxique et de biodégradation des

pathogènes et son interférence sur les espèces aquatiques en zones sensibles.

Les actions établies dans le cadre du présent programme permettront dans un premier temps d’établir un

screening des principales sources toxiques pathogènes en fonction des conditions environnementales

aussi bien en milieu marin côtier qu’en milieu d’eaux douces (sites pilotes). Dans un deuxième temps

l’intérêt portera sur l’étude plus spécifique et ciblée des toxines les plus influentes et leurs voies de

production ainsi que les interrelations entre plusieurs voies toxiques. La troisième étape l’attention sera

portée aux voies de biodégradation des toxines microbiennes et tendance équilibrantes d’altérations.

Ainsi, quatre actions sont définies dans le cadre du présent programme:

- Première action: modulation des toxines microbiennes (bactériocines et mycotoxines) des

espèces marines.

- Deuxième action: modulation des toxines microbiennes (cyanotoxines et bactériocines)

d’espèces dulçaquicoles.

- Troisième action : biodégradation toxiniques et bio remédiation.

- Quatrième action : Evaluation de la toxicité organique générée par les différents types de

toxines ou produits actives.

d- au niveau international


Chez les microalgues les températures maximales de survie connues à ce jour ne dépassent pas 75°C

(Robert A. Zierenberg et al., 2000). Ces derniers auteurs considèrent comme microalgue thermophile

toute espèce de microalgues pouvant vivre et se multiplier entre 40 et 75 °C. On distingue des

thermophiles de nature (appelés aussi thermophiles extrême) et ceux qui supportent facultativement la

thermophilie (appelés thermophiles modérés), pouvant prospérer à des hautes températures, mais ayant

leur optimum de croissance (au-dessous de 30 °C).

Il est préétabli que la survie de ces espèces dans ces milieux extrêmes réside essentiellement dans leur

versatilité, flexibilité et réactivité métaboliques exceptionnelles (Stal, 1995). Ces espèces ont la capacité

de varier et de modeler instantanément leur métabolisme en fonction des conditions environnementales,

ce qui leur offre une large gamme de tolérance vis-à-vis des facteurs du milieu. L'appareil

photosynthétique est probablement plus sensible à l’élévation de la température, mais le phénomène

d’adaptation physiologique à la température des microalgues thermophiles est inconnu.

Cette adaptation physiologique peut toucher aussi bien la composition pigmentaire que le

fonctionnement du système photosynthétique. D’ailleurs, les microalgues thermophiles présentent une

pigmentation diversifiée qui assure une efficacité photosynthétique élevée et une capacité à soutenir la

production photosynthétique nette à une faible intensité lumineuse. On suppose chez ces

microorganismes l’existence de mécanismes énergétiques, métaboliques et physiologiques originaux qui

leur permettent de s’adapter et survivre dans tels milieux extrêmes. Par exemple, Zuber (1979) suppose

l’existence de processus biochimiques particuliers qui assurent la stabilité de leurs composants

membranaires et le fonctionnement de leurs coenzymes. En effet l’auteur démontre que les enzymes

thermophiles semblent être stables à des températures de 70 et 90°C, contre celles des espèces

mésophiles stables seulement à des températures inférieures à 60°C.

On sait également que la température interagit avec d’autres facteurs du milieu (Lumière, pH,

concentration en éléments nutritifs, etc…) sur la production et la composition des lipides et des


carbohydrates chez les microalgues (Hu et al., 2008). La variation de la composition biochimique et du

profil des acides gras ou osidique, en fonction de la variation des facteurs du milieu, dont la température,

est cependant rarement étudiée (Hu et al., 2008). De plus la majorité des études se sont intéressés à la

totalité des lipides ou des sucres sans examiner individuellement la variation de chaque classe à part.

Des travaux menés à l’INSTM, ont montrés un effet très significatif de la température et de l’intensité

lumineuse sur la production des exo-polymères (EPS). Leurs variations affectent également la

composition biochimique de ces derniers et en conséquence leur activité biologique (Trabelsi et al,

2010). Les connaissances concernant l’effet de la température sur la synthèse et les propriétés physico-

chimiques des EPS des microalgues sont très peu abordés (Shah et al, 2000 et De Philippis et al, 2001).

Les macroalgues constituent une richesse naturelle exploitable dans les domaines industriels et

agroalimentaires essentiellement. Elles sont utilisées en alimentation humaine, en agriculture dans les

secteurs de production végétale et animales et dans l’extraction de substances bioactives (cosmétiques,

pharmaceutique) et de pigments (colorants, marqueurs). De plus elles servent en thalassothérapie, dans

l’épuration des eaux et même pour la production de bioénergie. Lorsque les ressources naturelles ne

suffisent pas à combler les besoins du marché, il faut se tourner vers l’aquaculture. C’est dans ce

contexte que s’articule notre projet avec deux grandes thématiques : La culture des algues et leur

valorisation par l’extraction de molécules à hautes valeurs ajoutées ou la production de bioénergie.

La valorisation et le développement de la culture des algues nécessitent la connaissance de plusieurs

phénomènes physiologiques permettant d’élucider les processus de la photosynthèse et les métabolismes

qui régissent notamment la croissance et l’élaboration de différentes substances telles que les

phycocolloïdes (agar-agar, carraghénanes ; alginates) et autres.

En outre, vu la production aléatoire des macroalgues, en particulier de Gracilaria du lac de Bizerte, et

dans l’optique d’augmenter les biomasses exploitables de ce plan d’eau, la culture par bouturage in situ

est une voie stratégique à adopter. Cependant, ceci n’est pas toujours réalisable, car les conditions

climatiques et hydrologiques sont très fluctuantes d’une année à l’autre et les biomasses naturelles ne

sont pas toujours abondantes pour faire des cultures à grande échelle. Pour cette raison on a pensé à

adopter une autre stratégie culturale. Cette dernière sera basée sur le contrôle –au laboratoire- de

plusieurs paramètres physico-chimiques afin de produire en masse, les macroalgues - d’une façon

générale- aussi bien par bouturage que par voie faisant intervenir des cellules spécialisées telles que les

spores. Les petites plantules d’algues produites au laboratoire permettraient d’une part, d’enrichir le

milieu naturel, d’autre part d’ouvrir la voie pour le développement d’une algoculture artificielle

intensive en bassins. Tout ceci a pour but la production de différents produits, en particulier l’agar-

agar.

D’autre part, les ressources algales naturelles semblent être limitantes pour le développement de la

production d’énergie à partir de macroalgues. Afin d’assurer un approvisionnement continu d’algue, on

propose de les cultiver dans les effluents piscicoles. Ces effluents génèrent une pollution dont l’origine

est l’excès d’aliment et les produits d’excrétion qui peuvent contribuer à l’eutrophisation du milieu

naturel. En effet, les substances dissoutes peuvent être valorisées pour la production de biomasse algale

par des techniques déjà proposées pour le traitement de rejets urbains. Le concept de cultiver des

macroalgues dans des effluents piscicoles permet une amélioration de la qualité de l’effluent tout en

transformant ses composantes dissoutes en biomasse valorisable.

Les macroalgues, comme déjà énoncé plus haut, représentent un grand réservoir de molécules naturelles

avec un grand éventail d’utilisation : Alimentation, pharmacologie, cosmétologie, peinture, agriculture,

Certaines molécules déjà bien connues telles que les phycocolloïdes (agar, carraghénanes et alginates)

extraits de macroalgues sont très demandés et représentent plus de 15% de la production mondiale

d’algues.

Les algues rouges et les algues vertes contiennent des teneurs importantes en protéines de l’ordre de 20

à 40 %. Cependant, l’extraction de ces protéines est difficile en raison de la présence dans leur paroi de

quantités importantes de polysaccharides en particulier la cellulose. Afin d’optimiser la solubilisation

des protéines par les méthodes d’extraction classiques, on fait recours aux détergent ou aux traitements

alcalins. La plupart de ces protocoles expérimentaux engendrent la dénaturation de la fraction protéique

et limitent les recherches sur les propriétés biochimiques et biologiques de ces protéines algales.

L’utilisation des polysaccharidases facilite l’accès à la fraction protéique et engendre l’amélioration des

teneurs d’extraction des protéines des algues. L’hydrolyse enzymatique est un procédé biotechnologique


innovant.

Notre projet porte sur l’optimisation de l’extraction des protéines et des phycoérythrines par ce procédé

ainsi que la purification des phycoérythrines. Les phycoérythrines faisant partie des phycobiliprotéines,

pigments photosynthétiques majoritaires chez les cyanobactéries et les algues rouges, sont largement

utilisées en techniques biomédicales et en diagnostiques cliniques. Ces applications sont dues

essentiellement à leurs propriétés spectrales. Ils sont utilisés essentiellement en tant que marqueurs

fluorescents en immunologie.

D’autre part, Les peintures antifouling efficaces sont basées sur l’oxyde de cuivre ou l’oxyde de

tributyltin (TBTO). Ce sont les antifouling les plus communs utilisés par environ 80% de la flottille

commerciale mondiale. Une fois submergée, les peintures antifouling laissent s’échapper des composés

toxiques qui peuvent causer des effets environnementaux néfastes. Les effets de la pollution au TBT sur

les biotopes marins ont été décrits pour la première fois en 1980 en corrélation avec l’amincissement des

coquilles et du déclin de la production d’huîtres en cultures Crassostrea gigas dans la Baie d’Arcachon

(France).

De nombreuses études ont montrés que les composés organiques extraits de différents groupes

taxonomiques marins inhibent le fouling en laboratoire et sur terrain. Il a été établi que ces organismes

secrètent des composés chimiques qui préviennent les larves d’autres organismes marins de coloniser

leur surface.

Les algues sont d’importants membres de l’écosystème marin. Du fait qu’elles ne sont pas dotées d’un

moyen de défense mécanique elles semblent vulnérables. Pourtant l’absence de prédation vis à vis de

certaines espèces montrent bien, au contraire, l’élaboration d’une défense chimique. Les mécanismes

biochimiques que ces organismes marins ont développés comme défense chimique pour l’inhibition du

développement de micro et macro organismes épiphytes peuvent constituer une alternative potentielle

pour la prévention du biofouling.

Enfin, les macroalgues présentent l’avantage d’avoir un taux de croissance beaucoup plus élevé que

celui des plantes terrestres. Elles n’ont pas besoin d’un apport d’eau continu et puisent leurs sels nutritifs

à partir du milieu ce qui en fait d’excellents candidats pour assainir des eaux « eutrophes » telles que les

eaux usées des zones urbaines.

Ainsi cette action vise à évaluer le potentiel des algues pour la production de bioénergie. Il s’agit d’une

part de définir les espèces d’algues présentant une composition biochimique optimale pour la production

de biocarburant et d’autre part de mieux cerner les conditions physiologiques permettant l’amélioration

de cette composition biochimique chez diverses espèces d’algues.

La production mondiale des pêches et de l’aquaculture ainsi que les disponibilités de poisson à des fins

alimentaires sont actuellement en pleine expansion et sont importantes pour la sécurité alimentaire

mondiale, en fournissant plus de 15% de l’offre totale des protéines animales (FAO, 2007). Au cours de

ces dernières décennies, la consommation moyenne/habitant de poisson et de produits de la pêche dans

le monde connaît une augmentation régulière atteignant les 16.9 Kg en 2007 (cf 11.5 Kg dans les années

70). Cette consommation devrait atteindre 50% au cours de la prochaine décennie (FAO, 2008) en

raison des multiples vertus que présentent les produits de la mer pour la santé humaine. Il faut aussi

noter que l'industrie halio-alimentaire repose sur une ressource qui est naturelle, renouvelable et

commune; propriétés qui se distinguent de celles des ressources agroalimentaires.

Cependant, certaines des pratiques de transformation et des technologies d’innovation en agro-

alimentaires risquent de poser des problèmes d'innocuité et de qualité (Burlingame & Pineiro, 2007),

nécessitant par conséquent, une attention particulière afin d'assurer la protection du consommateur.

Pour les produits aquacoles et le secteur halio-alimentaire, les concepts qualité et innocuité sont encore

plus rigoureux. En effet, ces produits sont hautement périssables, et toute inadvertance à l’un des

paramètres de qualité peut particulièrement nuire à la santé publique. La nécessité d'un suivi et d'une

optimisation tout le long du processus production - conservation est primordiale. Par ailleurs, les

préoccupations accrues relatives à la santé ont modifiés les modes de consommation et parmi ces

changements modernes, la demande de produits fonctionnels et d’ingrédients de santé qui ont une bonne

valeur nutritionnelle (Alnoldi 2004).

Action 1: Valorisation des produits et co-produits aquatiques

Par ailleurs, les exigences accrues des consommateurs vis-à-vis des risques potentiels liés à la présence

http://www.scopus.com/scopus/search/submit/author.url?author=Burlingame%2c+B.&authorId=15838893200&origin=resultslist&src=s

http://www.scopus.com/scopus/search/submit/author.url?author=Pineiro%2c+M.&authorId=15840687200&origin=resultslist&src=s


de préservatifs dans les produits alimentaires ont stimulé un travail soutenu en matière de recherche sur

l’extraction et l’utilisation des additifs naturels. Ainsi les résultats de recherche à l’échelle internationale

sont diversifiés et en continuelle croissance. L’enrobage par des polysaccharides, des protéines, et des

lipides extraits à partir des sous-produits de la mer, a été trouvé efficace pour prolonger la durée de

conservation des produits de la pêche frais, congelé ou transformés. Ce revêtement comestible déposé

sous forme de film agit en retardant la perte de l’humidité, l’oxydation des lipides et la décoloration des

produits aquatiques (Gennadios et al., 1997; Panchavarnam, 2003).

L’utilisation de la chitine et du chitosane, extraits des carapaces des crustacés, s’est révélée efficace

dans la préservation des produits de la mer (Jeon et al. 2002) et dans l’emballage d’une manière générale

(Srinivasa & Tharanathan, 2007).

Néanmoins, ce domaine de recherche reste presque inexploré vu la richesse des ressources aquatiques.

Ainsi, les investigations dans ce secteur en vue de produire des substances à haute valeur ajoutée

pour assurer la satisfaction des consommateurs sont très prometteuses.

Action 2 : Appui et conception de la qualité: Maîtrise des procédés

Les méthodes biochimiques et chimiques pour l’évaluation de la qualité des produits de la mer

présentent l’intérêt de pouvoir établir des normes quantitatives et d’établir des seuils de tolérance des

indicateurs chimiques. Parmi les procédures les plus utiles pour mesurer la qualité des produits de la

mer, celles qui sont basées sur la détermination des bases volatiles totales (ABVT), la triméthylamine,

les amines biogènes, et la rancidité oxydative. La mesure de l’ABVT reste l’outil de routine adopté dans

le contrôle officiel des produits de la pêche. Plusieurs méthodes ont été développées à l’échelle

internationale et nationale (Sadok et al., 1997, Monser el Al. 2002; Adhoum et al., 2003, Dhaouadi et

al., 2006, 2007). Cependant, l’élaboration de méthodes et capteurs en-ligne capables d'évaluer la qualité

des produits aquatiques, leurs arômes et leur innocuité (analyse des toxines) restent une priorité de

recherche et constituent un grand défi pour les objectifs fixés dans ce volet de recherche.

L'intoxication par les produits halio-alimentaires peut se produire également suite à la présence de virus

dans les bivalves qui sont des animaux filtreurs, susceptibles d’adsorber et d’accumuler ces

microorganismes acellulaires à différents niveaux de leurs organes (muqueuses du tube digestif,

hépatopancréas, branchies, tissus périphériques manteau, muscles, cœur) lorsqu’ils sont élevés dans un

milieu marin contaminé par des virus entériques (Romalde et al., 1994). La présence des virus

entériques a été rapportée à de nombreuses reprises dans la chair des bivalves (Marion et al., 2004).

D’autre part, les facteurs de stress environnementaux tels que les méthodes de conservation contribuent

à l’augmentation des diversités des pathogènes alimentaires, en induisant des changements de

génotypes des bactéries, les rendant plus résistantes ou plus virulentes. Cette diversité des pathogènes

rend leur détection et leur identification complexes et nécessite l’amélioration des méthodes existantes.

Dans ce contexte un volet de recherche a été dégagé pour développer une méthode de détection et

d’identification sensible et rapide des bactéries productrices d’histamine dans les produits de la pêche

basée sur les techniques moléculaires : PCR, RFLP et séquençage direct, ainsi que la mise en place de

techniques adéquates d’extraction et de détection des virus entériques dans la chair des bivalves. Le

développement d’amorces spécifiques et fiables pour la détection des gènes sera basé sur des analyses

bioinformatiques des séquences des gènes déjà disponibles dans les banques de données. En effet,

l’outil bioinformatique permettra de mieux concevoir les bonnes amorces pour une meilleure

application en PCR.

Au cours de cette dernière décennie, les programmes d’assurance qualité et de traçabilité des produits

halio-alimentaires se sont intensifiés afin d’éviter les fraudes et le mauvais étiquetage des poissons et

des produits de la mer (Giuseppe et al., 2005). Les techniques génétiques sensibles et en particulier celle

basée sur la PCR (Polymérase Chain Reaction) se sont avérées prometteuses pour le développement de

méthodes de routine (Trotta et al., 2005) et de kits d’analyse rapide. Du fait de sa stabilité, la

quantification de l’ADN représente en effet une piste très intéressante pour les espèces transformées. La

continuité de cette activité dans notre laboratoire est nécessaire pour développer des protocoles et des

procédures permettant d’identifier les poissons et les fruits de mer ainsi que pour mettre au point une

technique sensible et fiable pour quantifier les espèces dans les produits contenant du poisson et des

fruits de mer.

Pour conclure, il est important de rappeler que toutes ces méthodes d’analyses globales ne sont pas

opposées mais complémentaires des méthodes d’analyse sensorielles classiques. Elles apportent

différents niveaux d’informations pour assurer la qualité et l’innocuité et par conséquent la sécurité des

http://www.scopus.com/scopus/search/submit/author.url?author=Srinivasa%2c+P.C.&authorId=6602291986&origin=resultslist&src=s

http://www.scopus.com/scopus/search/submit/author.url?author=Tharanathan%2c+R.N.&authorId=7003270662&origin=resultslist&src=s


produits aquatiques.

Action 3. Amélioration de la conservation des produits aquatiques:

L’amélioration de la qualité des produits aquatiques prend diverses formes par la réalisation d’études

concernant la détermination et l’amélioration de la fraîcheur et la détermination des moyens pour la

préserver tels que la manipulation, l’hygiène et le conditionnement. Dans le domaine de l’amélioration

de la qualité, plusieurs travaux ont été réalisés pour prolonger la conservation des produits aquatiques se

basant sur la combinaison des effets de traitement et de la température de stockage (Dileep et al., 2005;

Olafsdottir et al., 2006) et l'utilisation des bio-produits ayant des activités antimicrobienne et

antioxydante (Fattouch et al. 2008).

De même ces produits doivent aussi répondre à d'autres exigences tel que la facilité d'emploi (produits

prêts à cuisiner ou à consommer). Ainsi dans certaines sociétés, les ventes au détail des produits de la

mer a diminué au bénéfice de produits transformés (Le Roux 2001) vu le changement du modèle de

consommation. Cependant la meilleure façon de préserver la fraîcheur d’un produit aquatique, c’est de

le maintenir à l’état vivant. Cette filière est en pleine expansion à l’échelle internationale. Ainsi certains

consommateurs, n’hésiteraient pas à payer plus cher pour un produit ultra-frais ou vivant (Csavas,

1992). De plus la vente de poissons vivants représente une valeur ajoutée considérable. Il a été ainsi

estimé que le prix du poisson vivant peut être supérieur de 40 à 300 % à celui du même poisson mort

(Mapstone et al., 2002). Ce même succès de commercialisation à l’état vivant a été retrouvé chez les

crustacés. Un tel succès a été atteint grâce aux travaux de recherche réalisés dans ce domaine (Salin &

Jayasree-Vadhyar, 2001).

A l’échelle nationale, ces champs d’action auront certainement des besoins de recherche et

développement particulièrement pour l’optimisation des conditions de stockage en fonction du type de

traitement et de l’espèce étudiée.

L’étude des différentes voies toxiques générées par les micro-organismes ainsi que leur influence sur les

espèces exploitables s’avère très importante en amont pour leur gestion rationnelle des ressources. La

mise en place d’un groupe de travail polyvalent sera à intégrer les programmes régionaux en

biotechnologie aquatique

Par ailleurs, l’exploitation des différentes voies de biodégradation est impérative en vue de

remédier aux différents types de nuisances notamment par la mise au point de procédés de traitement

biologique se basant sur le pouvoir épurateur de quelques organismes aquatiques à normaliser à l’échelle

local et régionale.

Aussi, il y’a lieu de développer les systèmes d’échange d’informations permettant le suivi et

préservation équilibrée des milieux aquatiques à l’échelle internationale en tenant compte des

changements climatiques globaux.

3- REFERENCES DES DIX (10) PUBLICATIONS LES PLUS RECENTES (DE MOINS DE 5

ANS) ET SIGNIFICATIVES DES CHERCHEURS AYANT UN RAPPORT AVEC LES

PROBLEMATIQUES A PRENDRE EN CHARGE PAR LE PROGRAMME DE RECHERCHE

1. Attouchi, M., & Sadok, S. (2010). The effect of powdered thyme sprinkling on quality changes

of wild and farmed gilthead sea bream fillets stored in ice. Food Chemistry, 119, 1527-1534.

2. Azaza M. S., Mensi F., Ksouri J., Dhraief M.N., Brini B., Abdelmouleh A., Kraiem M. M.

(2007) Growth of Nile tilapia (Oreochromis niloticus L.) fed with diets containing graded levels of

green algae ulva meal (Ulva rigida) reared in geothermal waters of southern Tunisia. J. Appl. Ichthyol,

1–6.

3. Ben Said R., Romdhane M.S., El Abed A., Mrabet R. (2011) Temporal variation of some

biometric parameters, agar – yield and quality of Gelidium spinosum (S.G. Gmelin) P.C. Silva

(Rhodophyta, Rhodophyceae, Gelidiales) from Monastir coasts (Tunisia). Cahiers de Biologie

Marine. 52 :71-78

4. Chebil Ajjabi L., Chouba L. (2009). Biosorption of Cu2+

and Zn2+

from aqueous solutions by

dried marine green macroalga Chaetomorpha linum. Journal of Environmental Management, 1–5

5. El Bour, M., Jaafar-kéfi, F., Hamrouni, M., Mahmoud, N., Dellali, M., Trigui-El-Menif, N.,


Aloui-Bejaoui, N., (2008). Etude de dépistage de la maladie de l’anneau brun chez des espèces de

bivalves des côtes tunisiennes. Bull. Soc. Zool. Fr., 133 (1-3) :107-115.

6. Limam Z., Sadok S. & El Abed A. (2008). Enzymatic hydrolysis of shrimp head waste:

functional and biochemical properties. Food Biotechnology, 22 (4), 352 –36

7. Ktari L., Ismail-Ben Ali A., Ben Redjem Y., Langar H., El Bour M. (2010). Antifouling activity

and chemical investigation of the brown alga Dictyota fasciola (Dictyotales) from Tunisian coast.

Cahiers de Biologie Marine, 51: 109-115.

8. Rym Ben Dhiab, Nejeh Ghenim, Lamia Trabelsi, Ali Yahia, Rafika Challouf, Khemissa Ghozzi,

Jihene Ammar, Hela Omrane, Hatem Ben Ouada. (2010). Modeling growth and photosynthetic

response in Arthrospira platensis as function of light intensity and glucose concentration using factorial

design. J. Appl. Phycol. DOI 10.1007/s10811-010-9515-9.

9. Trabelsi L., Ben Ouada H., Bacha H. (2010) Biological activities of Arthrospira platensis

(filamentous cyanobacteria) extracellular metabolites. Phytothérapie. Volume 8

10. Trabelsi L., M’sakni N.H., Ben Ouada H., Bacha H., Roudesli S. (2009) Partial Characterization

of Extracellular Polysaccharides from the Cyanobacterium Arthrospira platensis. Biotechnology and

Bioprocess Engineering. 14: 27-31. DOI/10.1007/s12257-008-0102-8.


4- STRUCTURES ET AUTRES ORGANISMES D’APPUI

a- Quels sont les laboratoires et organismes étrangers ou internationaux avec lesquels des relations

de collaboration régulières ont déjà été établies ?


-1er

organisme : Institut national Polytechnique de Lorraine (ENSAIA) Nancy France, Pr. Mohamed

El Ghoul

-2ème

organisme: Institut polytechnique de Bordeaux- ENSEIRB .Laboratoire d'Intégration du

Matériau au Système, UMR CNRS 5218.

-3ème

organisme : Université de Liège. Belgique. Laboratoire de Photobiologie.

- 4ème

organisme : Université de Bordeaux I, laboratoire PhyValBio, département Environnements et

Paléoenvironnements Océaniques

-5ème

organisme : Université de Hull –UK,

-6ème

organisme : Institut Français De Recherche pour l’Exploitation De La Mer- IFREMER.

- 7ème

organisme Université du Piémont Oriental “Amedeo Avogadro”, Faculté des Sciences.

Département de Sciences du milieu et de la Vie. Alessandria- Italie. Università del Piemonte Orientale

“Amedeo Avogadro”

-8ème

organisme : Université IBNZOHR Agadir-Maroc, Laboratoires Eaux et Environnement de la Faculté

des Sciences. Faculté des Sciences de Montpellier.

-9ème

organisme : Muséum National de l’Histoire Naturelles de Paris.

-10ème

organisme : Institut Supérieur de Biotechnologie de Monastir. (03-UR/09-01, Génome, Diagnostic

Immunitaire et Valorisation (GEDIV).

b-Des conventions particulières ont elles déjà été signées avec certains d’entres eux ?

Lesquels?


2010. CMCU entre l’INSTM, la faculté des sciences de Monastir, la faculté de médecine de Monastir et

l’université de Bordeaux « Elaboration de biocapteurs cellulaires pour la détection des métaux lourds dans

l’eau »

c- Des relations avec les universitaires et chercheurs tunisiens établis à l’étranger ont-elles été initiées

ou développées ?


Programme de collaboration avec les chercheurs tunisiens résidents à l’étranger». Accord de collaboration

entre l’INSTM et le Professeur Mohamed GHOUL, Ecole polytechnique Nancy, France. « Production de

substances naturelles actives à partir des microalgues aquatiques en milieux extrêmes : Optimisation de

procédés d’extraction et de caractérisation ». 2008


d- Des coopérations de travail existent–elles déjà avec des universitaires étrangers ou tunisiens

établis à l’étranger en termes de co-tutelle de doctorants en particulier ?


- Micheline Grignon Dubois

Laboratoire PhyValBio

Université Bordeaux I

Cotutelle de la thèse de Wafa Chérif

.

e- Des relations de collaboration formalisées ou régulières ont elles été établies avec d’autres

laboratoires de recherche tunisiens, d’autres institutions ou organismes nationaux ? Lesquels ?


Laboratoire des polymères et Biopolymères. Faculté Sciences Monastir.

Laboratoire des maladies transmissibles et des molécules bioactives. Faculté de Pharmacie de Monastir.

Laboratoire de Physique et Chimie des Interfaces. Faculté des sciences de Monastir

Unité mycotoxines, phycotoxines et pathologies associées. Faculté de pharmacie.de Monastir.

Laboratoire de recherche sur les substances biologiquement compatibles. Faculté Médecine dentaire de

Monastir.

Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire, Faculté de Médecine Dentaire de Monastir

Laboratoire d’Analyse et Valorisation des Polluants de l’Environnement et des produits. Faculté de

pharmacie de Monastir.

Institut National des Sciences Appliquées de Tunis

Faculté des Sciences de Tunis

Institut Pasteur de Tunis

ENIS – Sfax

Laboratoire de Toxicologie, Institut Supérieur d’Agriculture, Chott Mariem, Sousse

Laboratoire de Biosurveillance, Faculté des Sciences de Bizerte

Laboratoire d’aquaculture, INSTM


5- METHODOLOGIE DE REALISATION DU PROGRAMME DE RECHERCHE


Microalgues

1. Sorties sur terrain, échantillonnage aux niveaux de sources hydrothermales. Purification au

laboratoire de souches par filtration, centrifugation et variation de la température et luminosité.

Identification par colorations spécifiques et par séquençage.

2. Etablir des plans d’expériences pour des cultures en laboratoire en vue de modéliser la relation

entre la croissance et la synthèse de lipides, glucides et proteines et les paramètres physico

chimiques du milieu de culture pour certaines souches sélectionnées.

3. Screening d’activités biologiques : activité antibactérienne (CMI, CMB), activité stimulatrice (sur

cellules de Cosmarium lundelli), tests de toxicité (tests MTT), pouvoir antioxydant par méthode

ABTS et autres activités éventuelles.

4. Fractionnement et caractérisation de certaines substances actives par HPLC, CPG, méthodes

colorimétriques, spectrophotométrie.

5. Mesure de la croissance, de l’activité photosynthétique (par électrode de Klarck) et de l’activité

photochimique du PSII (mesure de la cinétique de fluorescence variable).

6. Sorties sur terrain, échantillonnage aux niveaux de sources hydrothermales. Purification au

laboratoire de souches par filtration, centrifugation et variation de la température et luminosité.

Identification par colorations spécifiques et par séquençage.

macroalgues

Volet 1 : Culture d’algues :

* A partir de spores

- Culture des spores de Gracilaria au laboratoire sous différentes conditions

- Transfert des petites plantules après germination des spores au milieu naturel en bassins de

grossissement

* Par boutures

- Culture, sous conditions contrôlées, à partir des fragments de thalles collectés du milieu naturel

* Dans les effluents aquacoles

- Essais et choix des structures de culture pour chacune des algues à étudier (Ulves et Chaetomorphe)

-Suivi de la croissance et de la qualité des algues en culture dans les effluents piscicoles au niveau d’une

ferme aquacole.

Volet 2 : Valorisation :

Extraction de substances à haute valeur ajoutée

1- Voie de valorisation de l’agar

- Essai de valorisation chimique de l’agar-agar en vue de l’obtention d’un matériau plastique

2- Extraction et purification de la R-phycoérythrine

* Extraction

- Prélèvement et conservation d’échantillons de différentes espèces d’algues rouges.

- Elaboration des conditions expérimentales d’extraction des protéines des algues rouges par la technique

d’hydrolyse enzymatique ((pH, Température, nature d’enzyme, etc…) et détermination des rendements

d’extraction.

* Purification

Elaboration des conditions expérimentales de purification de pigments d’algues rouges par un Système

Aqueux Biphasique formé par un polymère et un sel. Les paramètres qui seront optimisés sont les

suivants :

- Poids moléculaire du polyéthylene glycol

- Concentration du polyéthylene glycol

- Nature et concentration du sel

- Concentration de la Nacl

- La température du système …

-


3- Extraction de molécules bioactives (antifouling)

* Récolte et traitement du matériel biologique :

Les espèces sélectionnées appartenant à des ordres taxonomiques particuliers (Fucales, Dictyotales

(pour les brunes), Bryopsidales (pour les vertes)) seront récoltées à des profondeurs allant de 0 à 10

m nécessitant des récoltes par plongées. Dans un premier temps la zone de récolte concernera la côte

nord tunisienne. Les récoltes se feront de manière mensuelle afin de déterminer la variabilité

saisonnière des activités biologiques.

* Extraction:

Les extraits bruts organiques et aqueux seront réalisés.

*Tests d'activités:

Ces extraits bruts, une fois le solvant évaporé seront testés sur une batterie de tests biologiques tels que

:

- tests antibactériens et antifongiques : en collaboration avec le laboratoire de pathologies des

organismes marins de l’INSTM.

- test d’inhibition de microalgues foulantes développé au laboratoire de valorisation des macroalgues

l’INSTM Khéreddine

- test d’inhibition de spores de macroalgues intervenant dans le macrofouling.

- Test d’inhibition du fouling in situ sur des plaques immergées dans des zones portuaires et en mer

ouverte.

* Analyse saisonnière:

Les récoltes seront effectuées à différentes périodes de l'année afin de déterminer l'influence

saisonnière et environnementale ainsi que le stade de développement de l'organisme sur la biosynthèse

de métabolites actifs.

* Isolement de composés actifs:

La purification de composés actifs se fera par différentes chromatographies successives colonnes

ouvertes, CCM, chromatographie d'exclusion, HPLC) en parallèle avec les tests d'activité biologique

afin de cibler le ou les composés actifs.

* Identification des composés actifs:

Lorsque le ou les composés seront assez purs leur analyse structurale sera réalisée par spectrométrie

(RMN (à 1 et 2 dimension), Masse, IR, UV). Les données spectrales permettront d'identifier ces

composés.

* Etude des bactéries associées

- Isolement des bactéries de la surface du matériel algal.

- Mise en culture des bactéries sur agar.

- Identification des espèces par méthodes classiques et biologie moléculaire.

- rôle dans les mécanismes de défense de l’algue contre l’épiphytisme

- Analyse des activités antibiotiques des différentes espèces isolées.

- Essai de culture dans des fermenteurs, des bactéries présentant une activité intéressante.

Production de bioénergie:

- 1- Prospection et identification des sources algales d’intérêts disponibles en Tunisie.

- 2- Etude de la composition biochimique des algues sélectionnées. On s’intéresse dans cette partie à la

composition en hydrates de carbone, en acides gras et protéines. Cette étape a pour objectif de fournir les

données nécessaires pour choisir la voie de valorisation appropriée : hydrolyse, méthanisation ou

estérification.

-3- Mise en œuvre des procédés des biotransformations

Les biotransformations envisagées sont l’hydrolyse acide et enzymatique des hydrates de carbone et leur

fermentation.

La mise en œuvre du procédé de production de bioéthanol consiste à:

- Mise en œuvre de l’étape d’hydrolyse: détermination des taux résiduels de sels compatible avec les

enzymes utilisées dans la phase d’hydrolyse, choix des enzymes et optimisation des conditions opératoires

de l’hydrolyse.

- Mise en œuvre de l’étape de fermentation: Choix de ou des souches fermentaires (bactéries ou et levures,

..), choix du mode de conduite de réacteur, choix des conditions opératoires et des substrats


d’alimentation, …

- Distillation et déshydratation de l’éthanol issu de cette étape.

Halio-alimentaire

Activité 1

- Identification des sources potentielles des molécules biologiquement actives,

- Optimisation des conditions d’extraction physicochimique du pool protéique,

- Caractérisation des molécules protéique par électrophorèse,

-Mise au point des conditions de purification des molécules isolées des diverses sources marines ; analyse

par les technique d’électrophorèse, de chromatographie basse pression et de HPLC et par LC/MS/MS

- Extraction chimique et enzymatique des acides gras et analyse par chromatographie phase gazeuse.

Activité 2:

Méthode chimique/biochimique

- Analyse par injection en flux continu (FIA) pour l’analyse des sulfites

-Microbiologie

- Isolement et culture des bactéries: milieux de culture conventionnels et sélectifs pour isoler les germes

productrices des activités décarboxylases.

- Extraction de l'ADN bactérien: en utilisation le kit "DNeasy tissue kit" (Qiagen).

-Application de la technique PCR simple ou en multiplex (selon les amorces à utiliser) dans des conditions

préalablement optimisées.

- Analyse des amplifias PCR par les techniques d’électrophorèse ou de HPLC pour mettre en évidence les

éventuels profils polymorphes.

Identification génétique

- Conception d’amorce (bio-informatique)

- Application de la technique PCR

- Séquençage et identification

Culture Cellulaire

Il s’agit d’une expérimentation répétitive sur des organismes vivants prélevés quotidiennement par lot,

jusqu’à mortalité afin de suivre dans le temps leurs états de viabilité cellulaires au niveau des organes.

Activité 3

- Etude de la désorganisation des protéines sarcoplasmiques et myofibrillaires des poissons :

Electrophorèse SDS-PAGE des protéines et identifications des protéines.

- Caractérisation et purification des peptides spécifiques indicateurs d’altération : utilisation de

l’électrophorèse SDS-PAGE pour la séparation des différentes peptides et HPLC.

Toxicité

Différentes approches seront utilisées pour le screening des sécrétions protéiques et leur modulation en

fonction des conditions de l’environnement ainsi que la purification des toxines et des biomolécules :

- Approche protéomique : Identification des différentes substances secrétées par les communautés

microbienne (purification en colonne, SDS-PAGE), séquençage et purification des différentes

molécules de toxines (ELISA, HPLC, LC/SMS, CPG et Maldi-toff).

- Approche Transcriptomique (QRTPCR) : identification des éléments génétiques accessoires

(plasmides, bactériophages et pathogénicité des iles (Island) codant pour des gènes de virulences

associées.

- Approche cellulaire et humorale (cytomètrie en flux) : identification des différentes formes

d’altérations et cibles potentiels des toxines (bactéries, hémocytes, et bio-molécules).

- Mise en place de différents types de bio-essais (tests de toxicité embryo-larvaire et autres).

Application d’un ensemble de bio-marqueurs (biochimiques, physiologiques et génotoxiques).


6- MISE EN ŒUVRE DU PROGRAMME DE RECHERCHE SOUS FORME DE PROJETS

(Le chef de projet devrait avoir au moins le grade de Maître Assistant ou grades équivalents)

a- Les projets répondant aux objectifs scientifiques du programme de recherche à financier sur

des crédits publics


Projet 1: Les microalgues thermophiles peuplant les écosystèmes associés aux sources géothermales de

la Tunisie: Prospection, Identification et Sélection. Isolement, optimisation de la production et recherche

de substances d’intérêt. (NEBTA III)

Nom du chef du projet: Hatem Ben Ouada

Grade: Maître de recherche

Nom des chercheurs impliqués : Grade:

Hatem Ben Ouada

Lamia Trabelsi

Maître de recherche

Chargée de recherche


Zili Fatma

Nahla Mezhoud

Samira Miled

Nehla Bouzidi


Projet 2 : Bioactifs Isolés d’Organismes Marins : Extraction et Ressources (BIOMERII)

Nom du chef du projet : Leila Ktari Grade : Maître assistant


Ktari Leila

Ben Said Rafik

Chebil Leila

Mensi Fethi

M.A

C.R

C.R

A.R


Cherif Wafa

Besbes Ameni



Projet 3 : Bio-produits Novateurs et Qualité Halio-Alimentaire (BIONQA)

Nom du chef du projet : Saloua Sadok Grade : Professeur


Saloua Sadok

Abdelwahed Abdelmolah

Hamadi Guerbej

Faouzi Ben Rebeh

Boussaïd Béchir

Dorsaf Sebai Elamri

Nabil Souissi

Mourad Attouchi

Grade :

Pr

MR

MR

MC

MA

MA

As

PES

Nom des doctorants à mobiliser dans le cadre du projet:

Olfa Bouzgarou

Olfa Omrane


Projet 4 : Modulation des Toxines Microbiennes et Biodégradation Des Organismes Aquatiques

(MOTOX)

Nom du chef du projet : Monia ELBOUR Grade : Maître Assistante


Monia ElBour Maître assistante

Hedia Hili Inspecteur Vétérinaire

Asma Hamza Maître Assistante

Nejla Béjaoui Maître de conférences

Sabri Messaoudi Maître Assistant

Rym Ben Dhiab Attachée de recherche

Yahia Ali Ingénieur principal

Rafika Challouf Ingénieur principal

Khemissa Ghozzi Ingénieur principal

Amel Nakbi Assistante

Mejdeddine Kraiem Professeur

Dorsaf El Amri Maître Assistante

Nadia Cherif Assistante contractuelle.


Yosr ben Redjem

El Gharsalli Refka



b- Les projets répondant aux objectifs du monde économique et financés par des crédits privés

(entreprises et autres organismes)


Projet 1 : Etude des caractéristiques biochimiques de la sardine et de la sardinelle pêchées de

différents sites de la Tunisie

Entreprise ou organisme concerné: GIPP

Nom du chef du projet : Saloua Sadok Grade : Pr

Nom des chercheurs impliqués: Grade:

Saloua Sadok

Mourad Attouchi

Pr

PES


Boutheina Ben Sadok

Date de démarrage prévue du projet : 2010

Le projet fait-il l’objet d’un contrat entre le laboratoire et l’entreprise ou l’organisme concerné? OUI

Projet ... : Caractérisation et amélioration des conditions de stockage de la crevette royale :

Attribution d’un signe de qualité

Entreprise ou organisme concerné: GIPP

Nom du chef du projet : Saloua Sadok Grade : Pr.


Saloua Sadok

Mourad Attouchi

Grade :

Pr.

PES


Oussama Raach

Date de démarrage prévue du projet: 2009

Le projet fait-il l’objet d’un contrat entre le laboratoire et l’entreprise ou l’organisme concerné? OUI


Les projets à exécuter dans le cadre de la coopération internationale et financés par des organismes

étrangers


Projet 1 : Valorisation et qualité des produits aquatiques

Nom du chef de projet tunisien: Saloua Sadok

Nom du bailleur de fonds: SCAC (Ambassade De France)

Noms des partenaires institutionnels étrangers : IFREMER (Nantes)

Type de coopération : bilatérale

multilatérale


Saloua Sadok

Mourad Attouchi

Pr.

PES

Bechir Boussaid MA


Nadia Besbes

Olfa Bouzgarou


Durée prévue du projet : 3ans

Projet ...: INF-Halieutique

Nom du chef de projet tunisien: Saloua Sadok

Nom du bailleur de fonds: Fond Européen

Noms des partenaires institutionnels étrangers :

Type de coopération: bilatérale

multilatérale

Nom des chercheurs impliqués: Grade :

Saloua Sadok

Fethi Kamoun

Nabil Souissi

Mourad Attouchi

Pr.

MA

As

PES

Nom des doctorants à mobiliser dans le cadre du projet:

Nadia Besbes

Olfa Bouzgarou

Oussama Khalil Râach

Mariem Bouaouina


Durée prévue du projet: 3ans

X

X


Les membres de l’équipe de recherche assurent –t-ils une veille pour saisir les opportunités de

financement fournies:

- par l’Union Européenne dans le cadre de l’accord spécifique de coopération scientifique et

technologique avec la Tunisie ?

Oui

- par les conventions de coopération scientifique et technique entre la Tunisie et les pays amis?

Oui

-Convention établie entre INSTM et le National Research Center (CEAS) du Caire

- par les organisations du système des Nations Unies?

7- ECHEANCIER DE MISE EN ŒUVRE DES PROJETS DE RECHERCHE

- 1ère année :

Projet 1: NEBTA III

1. Prospection, inventaire et caractérisation physicochimique des sources hydrothermales

2. Quantification de la répartition des espèces des microalgues associées aux sources géothermales

3. Purification et mise en culture de certaines souches susceptibles de se maintenir aux conditions de

laboratoire.

4. Modélisation de la croissance des souches sélectionnées en variant les facteurs physiques

(température et luminosité) et chimiques (sels de culture)

Projet 2: BIOMER II

Action 1: Culture d’algues:

* A partir des spores

-Sporulation des thalles sporophytiques et carposporophytiques de G. verrucosa

-Culture des carpospores et des tétraspores à différentes salinités

-transfert des petites plantules dans des bouteilles en plastique et grossissement dans le milieu naturel

(lagune de Bizerte)

* Par bouture

- Elaboration des paramètres les plus influents ainsi que la mise en place d’un plan d’expérience

approprié


- Suivi des paramètres physicochimiques des effluents

- Essais et suivi de la croissance d’Ulva rigida dans le canal de rejet d’une ferme aquacole

Action 2: Valorisation



- Estérification de l’agar-agar : essais préliminaires sur l’action de certains facteurs sur le rendement

massique, tels que la température et la durée de réaction.

-Recherche sur l’action de certains alcools sur le rendement et la qualité de l’agar-agar de Gelidium


- Détermination des conditions optimales de conservation des échantillons d’algues.

- Elaboration des plans d’expérience pour l’optimisation des procédés d’extraction et de purification.

3- Extraction de substances bioactives (antifouling)

- Récolte de quantité importante d’espèces sélectionnées (des groupes taxonomiques Bryopsidales et


Dictyotales)

- Fractionnement chromatographique bioguidé par les tests antifouling pour l’isolement du ou des

composés actifs.

- Etude des bactéries associées (identification et rôle dans les mécanismes de défense de l’algue contre

l’épiphytisme).

Production de bioénergie

- Prospection et identification des sources algales d’intérêts disponibles en Tunisie.

- Etude de la composition biochimique des sources algales sélectionnées et identification des paramètres

physico-chimiques influençant la production de composants cibles (lipide ou polysaccharides) par les

espèces productrices de biofuel.

Projet 3: BIONCA

Action 1

- Choix des sources de productions des hydrolysats protéiques,

- Caractérisation mensuelle de la fraction lipidique des petits pélagiques (sardine et sardinelle) issus de

différentes régions.

-Elaboration de bio-film à partir des coproduits des crustacés

Action 2

-Validation de la méthode d’analyse de l’hémoglobine par FIA

- Développement d’une méthode moléculaire pour l’identification de la crevette dans les produits

transformés

- Echantillonnage de mollusques et traitement des échantillons (extraction ARN et RT-PCR)

Action 3

- Etude des facteurs de variation des caractéristiques sensorielles et nutritionnelles de la crevette en

fonction des pratiques post-récolte.

- Effet du fumage sur la qualité sensorielle des poissons de barrage

- Développement de critères de vitalité chez la palourde stockée à l’état vivant

- Réalisations des expérimentations pour l’étude des performances zootechniques et de la qualité des

poissons d’élevages en fonction des aliments de commerce de contenances variable en lipide et

disponibles en Tunisie.

Projet 4: MOTOX

Action 1: Modulation des toxines microbiennes (bactériocines et mycotoxines)

Choix des sites de travail et espèces cibles (invertébrés et espèce(s) de poisson(s) benthique(s).

Listing des principaux types d’altérations et leur caractérisation toxinique (aspects de virulence)

Mise en place des techniques d’analyse : protéomique et génomique

Action 2: Modulation des toxines microbiennes d’espèces dulçaquicoles

Etablir des sites pilotes et d’espèces cibles.

Listing des principales formes d’infestations (aspects de virulence).

Mise en place des techniques d’analyse : protéomique et génomique.

Action 3: Biodégradation et bioremédiation

Mise en place des techniques de prospection des voies de biodégradation et de résistance microbienne.

Action 4: Evaluation de l’état de santé de certains organismes aquatiques moyennant une approche

multimarqueurs

Choix des sites d’étude (Cartographie explicite et géo référenciée des sites d’échantillonnage)

Choix des espèces bioindicatrices en fonction de différents critères (sédentaire, représentativité vis-à-vis

de l’écosystème, niveau trophique, sensibilité vis-à-vis les polluants, bio-accumulatrices,….).

Mise en place des différentes méthodes de dosage des biomarqueurs à appliquer


- 2ème année :

Projet 1: NEBTA III

1. Extraction des substances actives à partir de la biomasse et du milieu extracellulaire des souches

sélectionnées en utilisant des solvants de différentes polarités

2. Caractérisation globale des extraits par des méthodes colorimétriques (dosage des protéines,

sucres et lipides)

3. Screening des activités biologiques (cytotoxicité, antibactériennes, antioxydantes, antifongiques)

4. Fractionnement des extraits actifs par HPLC : détermination des propriétés spectrales et du poids

moléculaire

Projet 2: BIOMER II

Action 1: Culture d’algues


-Essais de prégrossissement des petites plantules issues des spores en bassins (en circuit fermé) au

laboratoire.

-Grossissement des petites plantules au milieu naturel (lagune de Bizerte et en mer, sur filière) et suivi de

leur croissance

* Par bouture

Déroulement des expérimentations


*Essais et suivi de la croissance de Chaetomorpha linum dans le canal de rejet d’une ferme aquacole

Action 2: Valorisation



- Suite des essais de fabrication d’un plastique à partir de l’agar et essais d’optimisation du procédé

de fabrication


- Expérimentation pour l’extraction et la purification.


- Etude de la variation saisonnière de biosynthèse de composés antifouliung chez les Bryopsidales

- Evaluation de l’activité antifouling in situ des extraits et substances isolées

- Analyse des activités biologiques des bactéries associées


- Mise en œuvre du procédé de fermentation et production de bioéthanol

Projet 3: BIONCA

Action 1

- Caractérisation globale des hydrolysats par différentes méthodes (protéines, sucres et lipides)

- Fractionnement des extraits actifs par HPLC: détermination des propriétés chimiques

- Continuité des travaux concernant l’élaboration des revêtements comestibles

- Extraction du collagène à partir des différentes sources marines

Action 2

- Développement d’une méthode rapide et fiable d’analyse des sulfites dans les produits de la pêche

- Développement d’une méthode d’analyse de biotoxine (acide domoique) par LC/MS/MS

- Développement d’une méthode moléculaire pour la détection des bactéries d’altérations dans les

produits halio-alimentaires

- Echantillonnage de mollusques et traitement des échantillons (extraction ARN et RT-PCR.

- Caractérisation moléculaire des virus isolée (Séquençage des régions génomiques amplifiées, étude

phylogénétique et classification des isolats viraux)


Action 3

- Etude des facteurs de variation des caractéristiques sensorielles et nutritionnelles de la crevette en

fonction des pratiques post-récolte.

- Effet du fumage sur la qualité sensorielle, microbiologique et biochimique du tilapia

- Développement de critères de vitalité chez la palourde stockée à l’état vivant

- Evaluation des effets de la qualité des aliments utilisés sur la croissance, la survie et la qualité de la

chair (profil lipidique) du loup et de la daurade

Projet 4: MOTOX


Réalisation des analyses (protéomique et génomique) des différents types de toxines générées par les

pathogènes.

Suivi in situ des productions toxiniques en fonction des conditions environnementales.

Mise en place des techniques d’analyses des effets toxiniques : tests immunologique et/ou cellulaires.

Action 2 : Modulation des toxines microbiennes d’espèces dulçaquicoles:

Analyses biochimiques et moléculaires des différents types de cyanotoxines et toxines bactériennes

associées.

Suivi in situ des productions de cyano-toxines en fonction des conditions environnementales.

Action 3 : Biodégradation et bioremédiation:

Caractérisation des voies de biodégradation spécifiques.

Spéciation des différents types de micro-organismes impliqués dans la biodégradation.

Action 4 : Evaluation de l’état de santé de certains organismes aquatiques moyennant une approche

multimarqueurs

Sélection des espèces bio-indicatrices à partir des sites choisies

Analyses au laboratoire et application d’une batterie des biomarqueurs (biochimiques, physiologiques et

génotoxiques).

Mise en place de la technique de toxicité embryo-larvaire chez les bivalves.

- 3ème année :

Projet 1 : NEBTA III

1. Modélisation et optimisation des facteurs qui induisent la synthèse des extraits actifs

2. Caractérisation de la composition en sucre par CPG/ HPLC des extraits ou fractions actives

3. Caractérisation de la composition en lipides par CCM, CPG.

4. Caractérisation des peptides par électrophorèse native et/ou dénaturante

Projet 2 : BIOMER II

Action1 : Culture d’algues


-Ajustement de certains paramètres de culture et de grossissement des petites plantules de Gracilaria,

aussi bien au milieu naturel que dans les bassins.

*Par bouture

Obtentions de conditions optimisées

Action 2 : Valorisation



-Suivi de la composition chimique des extraits obtenus et du plastique qu’on aurait obtenu par

transformation de l’agar.


- Expérimentation pour l’extraction et la purification.


- Suite des isolements et analyse chimique structurale de(s) composé(s) antifouling

- Essai de compréhension du rôle des bactéries associées dans la protection des algues contre


l’épiphytisme.


- Optimisation du procédé de production de bioéthanol.

Projet 3 : BIONCA

Action 1

- Screening des activités biologiques des peptides extraits à partir des coproduits de la pêche

- Encapsulation des acides gras polyinsaturés dans des revêtements polysaccharides à partir des déchets

des crustacés

- Caractérisations et purification du collagène

Action 2

- Validation de la méthode d’analyse des sulfites adaptée à la matrice des produits de la mer

- Développement de méthode d’analyse de biotoxine (saxitoxine) par LC/MS/MS

- Echantillonnage de mollusques et traitement des échantillons (extraction ARN et RT-PCR.

- Caractérisation moléculaire des virus isolée (Séquençage des régions génomiques amplifiées, étude

phylogénétique et classification des isolats viraux)

- Etude de la distribution et de la prévalence de ces virus chez les mollusques bivalves étudiés

- Continuité des travaux de recherche sur l’identification moléculaire des espèces de poissons dans les

produits transformés

Action 3

- Mener des expérimentations aquacoles sur la qualité (biochimiques, morphométriques) du bar et de la

daurade d’élevage nourris avec des aliments de contenances variables en lipides.

- Evaluation des effets de la qualité des aliments utilisés sur la qualité de la chair (profil lipidique) du bar

et de la daurade.

- Caractérisation de la qualité de la palourde: caractérisations sensorielles (aspect, texture, saveur),

nutritionnelles (minéraux, vitamines, autres...) et fonctionnelles (sensibilité à la chaleur et à l'exposition à

l'air…) de différents sites.

Projet 4: MOTOX

Action 1 : Modulation des toxines microbiennes (bactériocines et mycotoxines)

Mise en place des techniques d’analyses humorales et/ou cellulaires.

Détermination de l’interaction environnementale sur la production toxinique (tests in vitro).

Séquençage de gènes ou opérons impliqués.

Création de banques de données, traitement bioinformatique et essais méta-génomique.

Action 2 : Modulation des toxines microbiennes d’espèces dulçaquicoles

Mise en place des essais de culture des espèces toxiques.

Détermination de l’interaction environnementale sur la production cyantoxinique (tests in vitro).

Essais de cytotoxicité induite.

Action 3 : Biodégradation et bioremédiation

Approches génomiques et caractérisation des séquences d’activités ou des gènes de résistance.

Détermination de l’induction environnementale sur la bio production et la réhabilitation.

Action 4 : Evaluation de l’état de santé de certains organismes aquatiques moyennant une approche

multimarqueurs

Analyses au laboratoire d’une batterie des biomarqueurs (biochimiques, physiologiques et génotoxiques)

Etude de relation dose-effet à l’échelle laboratoire pour l’évaluation du risque à priori de produits

chimiques ou, à posteriori d’échantillons environnementaux.


- 4ème année :

Projet 1: NEBTA III

1. Eventuellement, pousser la caractérisation pour certains actifs vers l’identification structurale

(RMN, rayon X etc)

2. Essais d’incorporation des actifs obtenus dans des produits finis à usage thérapeutiques,

alimentaire ou autres, en fonction de la spécificité de l’extrait obtenu

3. Préparation des fiches caractéristiques des espèces et des actifs associés

4. Approche des potentialités de valorisation des espèces et des substances actives

5. Rédaction du rapport final.

Projet 2 : BIOMER II

Action 1 : Culture d’algues

Bilan des activités

Action 2 : Valorisation



Bilan des activités

2- Extraction de la R-phycoérythrine

- Optimisation des différents procédés utilisés.


- Essai d’incorporation des substances isolées dans les peintures pour une utilisation industrielles.

- Synthèse des données et bilan des activités


Synthèse des données et élaboration du rapport final

Projet 3: BIONCA

Action 1

- Optimisation et validation des procédures d’extraction du collagène

- Application des revêtements comestibles en agro-alimentaire

Action 2

- Caractérisation moléculaire des gènes codant pour les différents types de toxines microbiennes

impliquées dans l’altération des espèces vulnérables

- Contribution à la mise en place de plans de prévention contre la pollution virologique concernant des

milieux aquatiques

-Bilan et synthèse des résultats

- Mise en place d’un nouveau model de contrôle de l’état vivant et de fraîcheur

Action 3

- Evaluation des effets des aliments de commerces de contenances variables en lipides sur les

performances zootechniques et la qualité de la chair des poissons d’élevage dans le contexte climatique

Tunisien.

- Elaboration de nouveaux produits halio-alimentaires ayant des propriétés nutraceutiques

Projet 4: MOTOX


Test en pilote ou in situ des toxines étudiées.

Action 2 : Modulation des toxines microbiennes d’espèces dulçaquicoles

Test en pilote ou in situ des cyanotoxines étudiées.

Action 3 : Biodégradation et bioremédiation

Essai de biodégradation en pilote.

Action 4: Evaluation de l’état de santé de certains organismes aquatiques moyennant une approche

multimarqueurs


Etablissement d’un modèle quantifiant les effets des facteurs en exprimant les réponses biologiques sous

forme des relations ou des équations mathématiques combinant les facteurs régissant l’état de santé des

sites étudiés.

Rédaction du rapport final.

8- CONSISTANCE DES RESULTATS ATTENDUS DES PROJETS DE RECHERCHE

a- La pertinence des résultats attendus des projets recherche

Par rapport à la problématique posée au départ et aux objectifs spécifiques visés par les activités

programmées dans le cadre de chacun des projets prévus, explicitez la plus value identifiable et évaluable

de chaque projet :


Projet 1 : Les microalgues thermophiles peuplant les écosystèmes associés aux sources géothermales de

la Tunisie.

Prospection, Identification et sélection.

Isolement, optimisation de la production et recherche de substances d’intérêt.

Nom du chef de projet : Hatem Ben Ouada

Résultat attendu :

- En quoi consisterait la pertinence scientifique ou l’originalité des résultats attendus du projet?

- Ces résultats visent-ils à améliorer la connaissance scientifique?

- Ces résultats visent-ils une innovation technologique?

- En quoi le projet peut-t-il contribuer au développement économique et/ou ou culturel du pays?

- En quoi ses résultats seraient-ils socialement pertinents?

- Inventaire des espèces thermophiles associées aux sources géothermales de la Tunisie.

- Constitution d’une souche-thèque de micro algues thermophiles.

- Etablissement de modèles multivariés reliant la productivité en biomasse ou en métabolites

avec les facteurs physicochimiques du milieu.

- Compréhension de certains mécanismes physiologiques d’adaptation de certaines souches aux

conditions d’extrêmes températures.

- Induction de la synthèse de certains bioactifs.

- Etablir des fiches caractéristiques pour chaque souche étudiée comportant la composition

biochimique et les propriétés bioactives.

- Etablir des fiches de valorisation des souches étudiées.

Projet 2: Bioactifs Isolés d’Organismes Marins: Extraction et Ressources (BIOMERII)

Nom du chef de projet: Leila Ktari

Résultat attendu:

- Une meilleure connaissance sur la croissance des petites plantules de Gracilaria et leur

grossissement aussi bien en milieu naturel qu’en bassins.

- Mise au point de techniques de culture des Gracilaria appropriées à la nature du site

(bathymétrie, substrat, mouvements des eaux…).

- Production de la biomasse algale dans les effluents piscicoles

- Amélioration des conditions d’obtention de l’agar-agar et amélioration de sa qualité

- Acquisition de certaines connaissances sur la transformation de l’agar en matériau plastique

- Obtention d’un pigment purifié ayant des applications dans différents domaines


- Valorisation d’espèces communes sur les cotes tunisiennes

- Mise en évidence d’espèces de macroalgues tunisiennes présentant une activité biologique

intéressante (antibiotique, antifouling)

- Identification des biomolécules actives.

- Mise en évidence des espèces d’algues potentiellement exploitables pour la production de

biocarburant.

- Identification des paramètres physico-chimiques influençant la production de composants cible

(lipide ou polysaccharides) par les espèces productrices de biofuel.

- Mettre au point des techniques d’extraction de biocarburant.

Impacts socio-économiques et opportunités de transfert des résultats

Les résultats qui seront obtenus à la fin du projet, permettront aux investisseurs de lancer des projets

d’entreprises.

Au terme du projet, nous aurons disposé d’une base de données scientifiques relatives à :

- la culture des algues

- traitement des effluents aquacoles et préservation de l’environnement

- la transformation de phycocolloides (agar-agar) en matériaux plastiques valorisables en industrie

- l’extraction et la purification d’une protéine telle que la R-Phycoérythrine (à titre indicatif,

cette dernière est commercialisée par des compagnies spécialisées en réactifs biochimiques, à un

prix élevé pouvant atteindre les 300 Euros/mg).

- l’extraction de molécules bioactives intervenant dans plusieurs domaines (pharmaceutique,

cosmétique, industrie des peintures,…).

- Développement de nouvelles formes d’énergie à partir des ressources végétales renouvelables

permettant ainsi de réduire la dépendance énergétique vis-à-vis du pétrole

Ce projet pourra ainsi développer à coté de la pêche et de l’aquaculture, d'autres horizons dans

l'exploitation de certaines ressources vivantes marines jusqu'à ce jour très peu utilisées. L'impact

économique et social qui en découlera serait très appréciable. Plusieurs secteurs en seront bénéficiaires

par la création d'emplois à tous les niveaux (ouvriers, techniciens, commerciaux et scientifiques).

Projet 3: Bio-produits Novateurs et Qualité Halio-Alimentaire (BIONQA)

Nom du chef de projet: Saloua Sadok

Résultat attendu:

Projet BIONCA

- Accroissement de la valorisation de la biomasse marine;

- Valorisation des coproduits de la pêche, tant en nutrition animale qu'en diététique humaine ou

nutraceutique

- Répondre aux exigences nationales et aux directives Internationales en matière de qualité envers les

animaux aquatiques des pays tiers destinés à l’exportation

- Renforcer la sécurité de consommation des produits halio-alimentaires par la maîtrise des procédures

de détection des micro-organismes d’altération

- Améliorer l'emballage, le transport et la conservation des produits aquatiques: Émergence d’un produit

innovateur distinctif sur les marchés

- Appliquer la biopréservation: Evaluation des effets des pro/prébiotiques ou des anti/oxydant et

anti/microbiens naturels sur les produits halio-alimentaires

-Maîtrise des techniques moléculaires pour le diagnostic des virus pathogènes chez les mollusques

bivalves pour la consommation humaine

- Développement des méthodes analytiques en support au control de la qualité des produits de la mer

- Maîtrise des techniques chimiques et moléculaires pour le suivi de la qualité des produits de la pêche

- Contribution à l’étude des cas de mortalités anormales surtout estivales des mollusques bivalves


- Evaluation du risque d’altération des mollusques bivalves dans le milieu naturel

- Acquérir des connaissances sur les critères prédictifs de la qualité de la chair de poisson qui pourront

être pris en compte dans les filières de production piscicole.

- Déterminer les effets des lipides alimentaires sur la constitution des dépôts lipidiques et incidence sur

la qualité de la chair des poissons d’élevage

- Restauration des possibilités d’exportation d’une façon continue des mollusques bivalves

- Favoriser l’augmentation de la production aquacole nationale destinée à l’exportation par

l’amélioration de la qualité de la chair et le respect du concept de bien être des poissons d’élevage

Projet 4: Modulation des Toxines Microbiennes et Biodégradation Des Organismes Aquatiques

(MOTOX)

Nom du chef de projet : Monia El Bour

Résultat attendu :

- Caractérisation des toxines les plus actives et leurs interférences organiques.

- Caractérisation moléculaire des gènes codant pour les différents types de toxines microbiennes

impliquées dans l’altération des espèces vulnérables.

- Etablissement de la liste des cyanotoxines et leurs activités.

- Caractérisation des activités biologiques et de biodégradation et voies de réhabilitation moléculaire des

gènes codant pour les décarboxylases impliquées dans l’altération des produits de la mer.

- Développement de méthodes génomiques et protéomiques d’usage dans les analyses en pathologie

aquatique.

- Développement d’approches multimarqueurs (biochimiques, physiologiques et génotoxiques)

permettant l’évaluation de l’état de santé de certains écosystèmes aquatiques et intégration et mise en

place des nouveaux outils d’analyse écotoxicologique applicables à l’échelle laboratoire (bioessais).

b-La consistance des résultats attendus du programme de recherche en termes de formation

diplômante (habilitations, thèses, mastères)

- Liste nominative des enseignants-chercheurs du corps B susceptibles de soutenir leurs habilitations

au terme du mandat de 4 ans du laboratoire.

Lamia Trabelsi

Monia Elbour

Leila Ktari

Leila Chebil

Nabil Souissi

Bechir Boussaid

- Liste nominative des doctorants susceptibles de soutenir leurs thèses de doctorat au terme du mandat

de 4 ans du laboratoire.

Zili Fatma

Nahla Mezhoud

Samira Miled

Nehla Bouzidi

Cherif Wafa

Besbes Ameni

Attouchi Mourad


Nadia Besbes

Olfa Ben Omrane

Olfa Bouzgarou

Yosr Ben Redjem

- Nombre estimatif d’étudiants susceptibles de soutenir leurs mémoires de mastère au terme du mandat

de 4 ans du laboratoire.

23

c- La consistance de la production scientifique du programme de recherche

Nombre estimatif d’ouvrages individuels ou collectifs et autres publications spécifiques.

5

Nombre estimatif d’articles scientifiques dans les revues indexées, à comité de lectures.

36

Nombre estimatif de communications à des manifestations scientifiques internationales et nationales

avec actes.

40

c- Nombre estimatif de brevets d’invention ou d’obtentions végétales du programme de recherche

(sur les 4 ans)

4


III – MOYENS DEMANDES POUR LA MISE EN OEUVRE DES PROGRAMMES DE RECHERCHE

NB : Il est strictement demandé de remplir cette partie pour chaque projet de recherche à financier sur des crédits publics

PROJET DE RECHERCHE 1

RECONNAISSANCE ET CONSERVATION DES POISSONS, TORTUES ET CETACES ET DE LEURS HABITATS

Année budgétaire : 2011

III-1- EQUIPEMENTS DEMANDES (Insérer autant de lignes que nécessaire)

N° Désignation

Quantité Coût total (DT)

01 ordinateurs 02 2 000

02 Ordinateur portable 01 1 500

03 microscope 01 3 500

04 Balance de précision (0,1g) 01 2 000

05 Dynamomètre (10g) 02 2 000

06 Appareil photo numérique 01 2 000

07 Disque de secchi 01 1 500

13 Centrifugeuse de Paillasse 01 7 000

Total : 21 500

III-2- SEJOURS SCIENTIFIQUES (en Tunisie ou à l’étranger)


Grade Nombre

Type du séjour (mission/stage)

Objet du séjour Lieu et durée

2 Mission Conférence Méditerranéenne des tortues marine

Naples (Italie) 05 j

1 Mission Groupe de travail Bycatch espèces menacées

Turquie 03 j

2 stage Cours croissances élasmobranches

Turquie 05 j

III-3- CONTRATS ET VACATIONS (Insérer autant de lignes que nécessaire)

Qualité Nombre Objet du contrat/vacation Durée (en mois)

Rémunération totale (DT)

Techniciens

supérieurs 01 Analyses de laboratoire/ Travaux de terrain 12 7 200

Etudiant en

thèse 04 Formation diplômantes 12 12 000

Total : 26 400




N° Désignation


01 Microtome ISOMET (low speed saw) 01 30 000

02 Microtome pour histologie 01 10 000

Total : 40 000



Grade Nombre



1 Mission Conférence EEA (European Elasmobranches Association)

Nice 04 j

1 Mission Sous comité environnement (CGPM)

Rome 05 j

Etudiant 1 Stage Techniques génétique France 15




Techniciens


Etudiant en


Total : 26 400




N° Désignation


Total :



Grade Nombre



2 mission Congrès de la CIESM Allemagne 5j

Maître assistant 1 Mission Conférence EEA (European Elasmobranches Association)

05 j




Techniciens


Etudiant en


Total : 26 400




N° Désignation


Total :



Grade Nombre



1 Mission Conférence EEA (European Elasmobranches Association)

04 j

1 Mission Sous comité environnement (CGPM)

04 j




Techniciens


Etudiant en


Total : 26 400


Budget demandé pour le projet n°1

Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère année

(2011)

2ème année

(2012)

3ème année

(2013)

4ème année

(2014)

Equipements Scientifiques

21 500 40 000

Sous-traitance

5 000

Consommables et petits matériels

10 000 12 000 5 000 5 000

Missions : Tunisiens allant à l’étranger : frais de transport,

timbre et frais de séjour. Etrangers invités en Tunisie : frais de voyage et frais de séjour.

5 500 4 000 6 000 4 000

Stages à l’étranger : frais de voyage, timbre et subventions de

séjour.

2 000 2 000 - -

Déplacement et hébergement en Tunisie

1 000 2 000 1 000 -

Organisation de rencontres scientifiques

5 000

Rémunération des contractuels

19 200

19 200

19 200

19 200

Documentations et frais d’accès aux réseaux et banques de données

500

500

500

500

Divers et frais de maintenance

1 000

Total par année

59 700 79 700 37 700 33 700

Total 2011-2014

210 800



DIVERSITE BIOLOGIQUE DANS LES ECOSYSTEMES FRAGILES



N° Désignation


1 Four à moufle 1 3 200

2 Etuve 1 2 000

3 Bouteilles de plongée 15 litres 2 1 800

4 Détendeurs et accessoires 2 1 200

5 Gilets stabilisateurs 2 1 350

6 Ordinateurs de plongées 2 1 000

Totaux :

10 550



Grade Nombre



Assistant 1 mission 07 j




Doctora

nts 2 Exécution du projet 24 mois 6 000

Total : 6 000




N° Désignation


1 Benne 1 15 000

2 Turbidimètre 1 2 500

Total : 17 500



Grade Nombre



Ingénieur

principal 1 mission 07 j




Doctora


Total : 6 000




N° Désignation


1 Balance électronique 2 1 000

2 Stéréo-microscopes (loupes binoculaires) 3 5 500

Total : 6 500



Grade Nombre



Doctorant 02 stage Maîtrise de techniques 07 j




Doctora


Total : 6 000




N° Désignation


1 Microscopes 1 3 000

Total : 3 000



Grade Nombre



Maître assistant 01 mission 07 j




Doctora


Total : 6 000



Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère année

(2011)

2ème année

(2012)

3ème année

(2013)

4ème année

(2014)


10 550 17 500 6 500 3 000

Sous-traitance


2 000 2 000 2 000 2 000



3 000 3 000 3 000


séjour.

5 000


1 000 1 000 1 000 1 000


3 000 3 000


6 000 6 000 6 000 6 000


500

500

500

500


2000 2000 1000 500

Total par année

25 050 32 000 25 000 19 000

Total 2011-2014

101 050 MD


PROJET DE RECHERCHE 3: NEBTA III

Les microalgues thermophiles peuplant les écosystèmes associées aux sources géothermales de la Tunisie.

Prospection, Identification et sélection. Isolement, optimisation de la production et recherche de

substances d’intérêts

Année budgétaire: 2011

III-1- EQUIPEMENTS DEMANDES


N° Désignation


01 Microscope inversé avec équipement vidéo 1 20000

02 Armoires de culture thermo régulées 3 24000

03 Distillateur 1 5000

04 Réfrigérateur- congélateur 2 2000

05 « Quit » pour cuve pour spectrofluorimètre 1 4000

Total : 55000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Ben Ouada

Hatem

Maitre de

recherches

Mission Coordination avec laboratoire Nancy (France)/7j

Trabelsi Lamia Chargé de

recherches

Mission Système de filtration membranaire (Nancy) 15j

Zili Fatma Physiologie des microalgues Université liège

Belgique/15j

Jihene Ammar Mastère

spécialisé

Aspects valorisation Interface Université

liège Belgique / 15j

III-3- CONTRATS ET VACATIONS


Qualité Nombre Objet du contrat/vacation Durée

(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Technicien 2 1 pour culture microalgues

1 dosage et analyses laboratoire

12*2/an

11280

Mastère

spécialisé

1 Aspects valorisation 12/an

8640

Bourses

Thèse

4 Caractérisation structurale des actifs

biologiques

4*12/an

12000

Total : 32280





N° Désignation


01 Système d’ultrafiltration membranaire 2 3000

Total : 6000



Grade Nombre

Type du

séjour

(mission/stag

e)


Nahla Mezhoud Thèse Stage Caractérisation des EPS Nancy (France)/15j

Fatma ZILI Thèse Stage Caractérisation des lipides Nancy (France)/15j

Nehla Bouzidi Ingénieur Stage Identification des diatommés Bretagne (France)/15j

Samira Miled Ingénieur Stage Génie des procédés Bretagne (France)/15j




(en mois)

Rémunération

totale (DT)



12*2/an

11280

Mastère

spécialisé


8640

Bourses

Thèse

4 Caractérisation structurale des actifs biologiques 4*12/an

12000

Total : 32280





N° Désignation


Total :



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Trabelsi Lamia Chargée

de

recherches

Mission Chromatographie (Nancy) 7j

Jihene Ammar Mastere

spécialisé

Stage Aspects valorisation Interface Université

liège Belgique / 15j

Nahla Mezhoud Thèse Stage Caractérisation des EPS Nancy (France)/15j

Fatma ZILI Thèse Stage Caractérisation des lipides Nancy (France)/15j

Nehla Bouzidi Thèse Stage Identification des diatommés Bretagne (France)/15j

Samira Miled Thèse Stage Génie des procédés Bretagne (France)/15j




(en mois)

Rémunération

totale (DT)



12*2/an

11280

Mastère

spécialisé


8640

Bourses

Thèse


12000

Total : 32280





N° Désignation


Total :



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Ben Ouada

Hatem

Maitre de

recherches

Mission Coordination avec laboratoire Université liège

Belgique / 7j

Trabelsi Lamia Chargé de

recherches

Stage Chromatographie Nancy (France)/7j




(en mois)

Rémunération

totale (DT)



12*2/an

11280

Mastère

spécialisé


8640

Bourses

Thèse


12000

Total : 32280



Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère

année

(2011)

2ème

année

(2012)

3ème

année

(2013)

4ème

année

(2014)


55000 3000

Sous-traitance


15000 8000 10000 6000

Missions : Tunisiens allant à l’étranger : frais

de transport, timbre et frais de séjour.

Etrangers invités en Tunisie : frais de voyage et frais

de séjour.

4000 2000 2000

Stages à l’étranger : frais de voyage, timbre et

subventions de séjour.

4000 8000 10000 2000


1000 1000


3000


32280

32280 32280 32280

Documentations et frais d’accès aux réseaux et

banques de données

500

500

500

500


2000 2000 2000

Total par année

111780 54780 56780 47780

Total 2011-2014

271120



BIOACTIFS ISOLES D’ORGANISMES MARINS: EXTRACTION ET RESSOURCES (BIOMERII)




N° Désignation


pH mètre 1 1500

Autoclave 1 8000

microscope 1 2000

Armoire de culture 1 3500

Fermenteur 1 10000

Agitateur magnétique chauffant 2 2000

Pompe à vide 1 4000

Rotor de centrifugeuse pour microplaques+ accessoires 1 4000

Totaux :

35000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


2 chercheurs Missions Assister à des congrès

internationaux

France (2*7j)

Etudiant Doctorant stage Analyse chimique de structures France (15j)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie

1 Extraction - purification –structure chimique 12 9000

Tech.

Sup.

2 Maintien des cultures de microalgues, Tests

biologiques, traitement des algues et extraction

12 mois 2*7000

thèse 2 2*12 mois 6000

Total : 29000





N° Désignation


Salinomètre

1 1000

Machine à glace

1 6000

Hotte à flux laminaire 1 10000

Microscope inverse 1 20000

Total:

37000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


chercheurs 2 Missions Assister à des congrès

internationaux

Europe (2*7j)

Etudiant 1 Stage Production de bioénergie France (15j)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie


Tech.

Sup.



12 mois 2*7000


Total : 29000





N° Désignation


Rotaevaporateur 1 15000

Spectrophotomètre 1 4000

Lecteur Elisa 1 10000

Total :

29000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


1 chercheur Mission Assister à des congrès

internationaux

Europe (7j)

Etudiant Doctorant Stage Extraction de produits naturels

marins à partir de

microorganismes

France (15j)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie


Tech.

Sup.



12 mois 2*7000


Total: 29000





N° Désignation


Rhéomètre 1 10000

Pénétromètre 1 1000

Cryoconservateur 1 1500

Oxymètre biologique 1 5000

Total :

17500



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Etudiant Master stage France (30j)

1 chercheur Mission Assister à des congrès

internationaux

Europe (7j)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.Chimie 1 Extraction - purification –structure chimique 12 9000

Tech. Sup. 2 Maintien des cultures de microalgues, Tests


12 mois 2*7000


Total: 29000



Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère

année

(2011)

2ème

année

(2012)

3ème

année

(2013)

4ème

année

(2014)


35000 37000 29000 17500

Sous-traitance


20000 20000 10000 10000

Missions : Tunisiens allant à l’étranger: frais



de séjour.

4000 4000 2000 2000

Stages à l’étranger: frais de voyage, timbre et


2000 2000 2000 2000


500 500 500 500


2000


29000 29000 29000 29000


banques de données

500 500 500 500


500 500 500 500

Total par année

91500 93500 73500 64000

Total 2011-2014

322 500



BIO-PRODUITS NOVATEURS ET QUALITE HALIO-ALIMENTAIRE (BIONQA)




N° Désignation


Passeur automatique pour LC/MS/MS 1 20 000

Système d’ultra-filtration avec membrane 1 14000

Agitateur Vortex 2 3000

Digesteur d’azote 1 6000

Tubes en polypropylène pour centrifugeuse 5 3000

Ordinateurs portables 3 3000

Total:

40000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Chercheurs 2 Missions Congrès internationaux Europe (7j×2)

Etudiant

Doctorant

2 stage Analyse chimique de structures Europe (15j×2)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie

1 Chimie analytique 12 9000

thèse 2 2×12 mois 6000

Total : 15000





N° Désignation


lyophilisateur

1 25000

Chambre de culture 1 10000

Total:

35000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)



Etudiant

Doctorant

2 stage Analyse chimique (biotoxines,

protéomiques)

Europe (15j×2)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie



Total : 15000





N° Désignation


Passeur automatique pour GC 1 15000

Viscosimètre 1 15 000

Total : 30 000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)



Etudiant

Doctorant


protéomiques)

Europe (15j×2)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie



Total : 15000





N° Désignation


Système d’emballage sous vide 1 15 000

Sonde pH 1 1000

Total : 16 000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)



Etudiant

Doctorant


protéomiques)

Europe (15j×2)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Ing.

Chimie



Total: 15000



Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère

année

(2011)

2ème

année

(2012)

3ème

année

(2013)

4ème

année

(2014)


36 000 35 000 30 000 16 000

Sous-traitance

2000 2000 2000


20000 20000 20000 10000




de séjour.

3000 3000 3000 3000



6000 6000 4000 4000


1000 1000 1000 1000


5000 5000


15 000 15 000 15 000 15 000


banques de données

500

500

500

500


5000 5000 5000 5000

Total par année

88 500 92 500 80 500 59 500

Total 2011-2014 321 000



MODULATION DES TOXINES MICROBIENNES ET BIODEGRADATION DES ORGANISMES

AQUATIQUES (MOTOX)




N° Désignation


Four microondes 2 1000

Plaque chauffante 2 2000

pH mètre 1 1000

Bain marie + Bain ultrason 2 4000

Chambre de culture (cyanobactéries) 1 3000

Spectrophotomètre UV-visible à balayage automatique 1 15000

Ordinateurs 3 3000

Centrifugeuse réfrigérée (grands volumes) + rotors 1 15000

Dessiccateur 1 2000

Total : 46000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


TS Stage Entretien de Cytomètre en flux IUEM – Brest

Doctorant Stage Cytogénétique Ifremer - Tremblade




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

technicien

1 12 mois 6000

Total : 6000





N° Désignation


Speed Vaccum 1 8000

Microscope menu d’un système d’acquisition et d’analyse

d’image

1 25000

Total : 33000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Ingénieur 1 Stage Protéomie et génotoxicité Italie (15 jours)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Technicie

n

1 Techniques moléculaires 12 6000

Total : 6000





N° Désignation


Bain à sec 1 3000

Système d’électrophorèse vertical 1 7000

Total : 10000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)


Ingénieur 1 stage Bio marqueurs physiologique Italie (15 jours)




(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Technicie

n

1 Techniques moléculaires 12 6000

Total : 6000





N° Désignation


Multisonde 1 2000

1 ordinateur 1 2000

Total : 4000



Grade Nombre

Type du séjour

(mission/stage)





(en mois)

Rémunération

totale (DT)

Technicie

n

1 Techniques moléculaires 12

Total : 6000



Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère

année

(2011)

2ème

année

(2012)

3ème

année

(2013)

4ème

année

(2014)


26000 33000 10000 2000

Sous-traitance


15000 14000 14000 10000




de séjour.

1000 1000 1000 1000



4000 2000 3000 1000


2000 2000 2000 2000


3000 3000


6000 6000 6000 6000


banques de données

500 500 500 500


500 500 500 500

Total par année

58000 59000 40000 23000

Total 2011-2014

180 000DT


BUDGET TOTAL DEMANDE POUR LE LABORATOIRE

Montants

Demandés

(DT)

Rubriques

1ère année

(2011)

2ème année

(2012)

3ème année

(2013)

4ème année

(2014)


184050 165500 75500 38500

Sous-traitance

2000 2000 7000 3000


82000 76000 61000 43000



20500 13000 14000 15000


séjour.

18000 20000 24000 9000


6500 7500 5500 4500


3000 5000 6000 18000


76280 82280 82280 101480


3 000

3 000

3 000

3 000


8000 10000 10000 8500

Total par année

434530 411480 313480 246980

Total 2011-2014

1406470


IDENTIFICATION DU LABORATOIRE DE RECHERCHE

-Etablissement (où sera créé le laboratoire) : Institut National des Sciences et Technologies de la Mer -Université(en cas de cotutelle) : ………………………………..…………………………………………………………………………… -Dénomination du laboratoire : Biodiversité et Biotechnologie Marines

CHEF DU LABORATOIRE DE RECHERCHE

Nom et Prénom : Mohamed Nejmeddine Bradai Grade : Directeur de recherche

Fonction administrative (s’il y a lieu) : ……………………………………………………………………………………..………………

Etablissement de rattachement : Institut National des Sciences et Technologies de la Mer

Université : ……………….…………………………………………………………………………………………………………..…….…………..

CASE RESERVEE A L’ETABLISSEMENT

Avis du chef de l’établissement et recommandations du conseil scientifique :

1- Eligibilité du laboratoire (masse critique)

2- Adéquation avec les orientations de recherche de l’établissement

3- La nomination du chef du laboratoire Le chef de l’établissement : (Date, signature et cachet)


ANNEXE 1

Liste des sujets de thèses en cours de préparation (Thèse de doctorat es-sciences)

(Doctorants inscrits à partir de l’année universitaire 2008/2009)


Liste des sujets de thèses

N° Nom et prénom du

doctorant

Etablissement (où l’inscription est effectuée)

Année de la première

inscription(*)

Nom et prénom de l'encadreur

Grade Etablissement

(de rattachement) Intitulé du sujet de thèse

Avancement (%)

1 Mabrouk Lotfi INSTM 2008-2009 BRADAI

Mohamed Nejmeddine

D.R INSTM

Caractérisation des paysages marins de la région de

Mahdia : les herbiers de Posidonie et les peuplements

associés

60 %

2 BESBES Ameni INSTM 2008-2009 BRADAI

Mohamed Nejmeddine

D.R INSTM Chimiotaxonomie et bioactivités de Cystoseires

30 %

3 Ben Omran Sioud Olfa INSTM /FST 2009/2010 SADOK Saloua Pr INSTM

Variations biochimiques, histochimiques et organoleptiques de Mytilus galloprovinialis en relation avec les conditions de stockage et d’épuration

30%

4 Olfa Bouzgarrou FST 2008/2009 SADOK Saloua Pr INSTM

Valorisation des poissons de

barrage: amélioration de la

qualité organoleptique et

nutritionnelle en fonction des

modalités de transformation

30%

5 Fatma ZILI ISBM 2009-2010 BEN OUADA

Hatem

Maître

de

recherch

e INSTM

Modélisation de l’effet des facteurs

physico-chimiques sur la

composition et le profil lipidique de

deux espèces thermophiles une

cyanobactérie et une chlorophycée

isolées des eaux géothermales de la

Tunisie.

30%

6 Nahla MEZHOUD ISBM 2010-2011 BEN OUADA

Hatem

Maître de

recherche

INSTM

Variabilité dans la sécrétion et la

composition des substances

polymériques extracellulaires chez

deux microalgues thermophiles

Gloecapsa (cyanobactérie) et

15%


Cosmarium (Chlorophyte) en

relation avec les facteurs physico-

chimiques du milieu de culture.

7 Nehla BOUZIDI ISBM 2009-2010 Khira MAAROUFI Profess

eur Fac Pharmacie

Monastir

Evaluation et modélisation des

effets des facteurs physico-

chimiques sur la composition et le

profil lipidique d’espèces de

diatomées isolées des eaux

géothermales de la Tunisie.

10%

8 Samira MILED INAT 2010-2011 BEN OUADA

Hatem

Maître de

recherche

INSTM

Modélisation de la production en

biomasse et de la qualité de la

microalgue (Arthrospira platensis)

en photobioréacteur pilote, en

fonction de la variation des facteurs

physicochimiques et de leurs

interactions.

5%

9 Hedi Ben Hassine

Salah INAT 2009-2010 BEJAOUI Najla M.C INAT Biologie des Polyplacophores 10%

10 BEN MASSAOUD

Rimel INSTM/INAT 2009-2010 BEJAOUI Najla M.C INAT

Etude des delphinidés de la zone nord est de la Tunisie et etude d’interaction avec l’activité martine

-

11 CHERIF Wafa INSTM/FST 2009-2010 BOUDABOUS

Abdellatif Pr FST

Chimiodiversité des Ulvophyceae (senso Lato) des côtes tunisiennes, étude écologique et utilisation comme source de produits antisalissure

-

12 BEN REDJEM

ROMDHANE Yoser INSTM/FST 2008-2009

BOUDABOUS Abdellatif

Professeur

FST

Etude de l’activité antibactérienne des épibiontes des espèces d’éponges collectées en Tunisie

50%

13 El Gharsalli Refka INAT 2008-2009 BEJAOUI Najla M.C INAT Etude bioécologique, biochimique et parasitologique de l’espèce

15%


Ostrea stentina sur les côtes tunisiennes

14 KERKENI Mohamed

Houssem INSTM/INAT 2008-2009

HATTOUR Abdallah

Pr INSTM

Inventaire et étude systématique de la macroflore benthique dans le golfe de Gabès

60%

* Doctorants inscrits à partir de l’année universitaire 2008/2009.


ANNEXE 2

Fiches individuelles des enseignants chercheurs et doctorants


ANNEXE 3

Attestations d'inscription des doctorants

pour l’année universitaire en cours

creation d’un laboratoire de …iresa.agrinet.tn/cpera/pdfs/formulaire laboratoire de...formulaire...

Documents