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  • BIOCHIMIETOUT LE COURS EN FICHES

    Licence PACES-UE CAPES

    Sous la direction de Norbert Latruffe Professeur luniversit de Bourgogne (Dijon)

    Franoise Bleicher-Bardeletti Professeur luniversit Claude Bernard Lyon1

    Bertrand Duclos Professeur luniversit Claude Bernard Lyon1

    Joseph Vamecq Docteur en mdecine, agrg de lenseignement suprieur, charg de recherche Inserm, charg de cours luniversit de Mons

    9782100599882_Latruffe.indb 1 12/05/14 10:15

  • Dunod, 2014

    5 rue Laromiguire, 75005 Paris

    www.dunod.com

    ISBN 978-2-10-059988-2

    Illustration de couverture : Drosra yodm24-Fotolia.com

    Drosera capensis est une plante carnivore. Elle illustre un maillon inverse de la chane alimentaire, mais o les fondamentaux de la biochimie

    sont conservs, telle que la scrtion denzymes protolytiques.

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    III

    Table des matires

    Comment utiliser cet ouvrage ? X

    Avant-propos XII

    Remerciements XIV

    Partie1 Biomolcules de base(Norbert Latruffe)

    Chapitre 1 Proprits des constituants chimiques de la cellule 1

    Fiche 1 Organisation unitaire du monde vivant 2

    Fiche 2 Proprits de la matire vivante 4

    Fiche 3 Caractristiques du fonctionnement cellulaire 6

    Fiche 4 Liaisons chimiques covalentes etnoncovalentes 8

    Fiche 5 Groupements fonctionnels chimiques des biomolcules 10

    Fiche 6 Types de mcanismes chimiques utiliss dans les ractions biochimiques 12

    Fiche 7 Isomrie molculaire 14

    Fiche 8 Des biomolcules aux macromolcules 16

    Fiche 9 Biochimie inorganique 18

    Focus Le vivant se caractrise aussi pardesgrandeurs physiques 20

    QCM 21

    Chapitre 2 Structure et proprits desprincipaux glucides 23

    Fiche 10 Proprits des glucides 24

    Fiche 11 Le glucose et les monoholosides 26

    Fiche 12 Les diholosides 28

    Fiche 13 Les polyholosides 30

    Fiche 14 Les polyholosides complexes 32

    Fiche 15 Techniques danalyse 34

    Focus Les dulcorants non glucidiques 36

    QCM 37

    Chapitre 3 Les lipides 39

    Fiche 16 Proprits des lipides 40

    Fiche 17 Les acides gras 42

    Fiche 18 Les triglycrides 44

    Fiche 19 Les glycrophospholipides 46

    Fiche 20 Les sphingolipides 48

    Fiche 21 Le cholestrol 50

    Fiche 22 Techniques dtude des lipides 52

    Focus Les lipides dans les conditions extrmes 54

    QCM 55

    Chapitre 4 Structure et proprits desacides amins 57

    Fiche 23 Proprits gnrales des acides amins 58

    Fiche 24 Structure des acides amins naturels 60

    Fiche 25 Proprits physiques et physico-chimiques des acides amins 62

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  • IV

    Fiche 26 Proprits chimiques des acides amins 64

    Fiche 27 Proprits ioniques des acides amins 66

    Fiche 28 Techniques de sparation des acides amins 68

    Fiche 29 Squenage des acides amins: mthodes chimiques 70

    Fiche 30 Squenage des acides amins: mthodes enzymatiques et gntiques 72

    Focus Rle des acides amins non protiques 74

    QCM 75

    Chapitre 5 Les bases azotes etlesnuclotides 77

    Fiche 31 Structure des bases et des nuclotides 78

    Fiche 32 Proprits chimiques des bases azotes 80

    Fiche 33 Bases nucliques inhabituelles 82

    Fiche 34 Techniques danalyse et proprits spectrales des nuclotides 84

    Focus Le marquage isotopique 86

    QCM 87

    Partie2 Protines et biocatalyse enzymatique(Norbert Latruffe)

    Chapitre 6 Polypeptides et protines 89

    Fiche 35 La structure primaire des protines 90

    Fiche 36 La structure secondaire des protines 92

    Fiche 37 La structure tertiaire des protines 94

    Fiche 38 La structure quaternaire des protines 96

    Fiche 39 Proprits biologiques des protines 98

    Fiche 40 Mthodes de sparation des protines: la chromatographie 100

    Fiche 41 Mthodes de sparation des protines: lectrophorse 102

    Focus La protomique 104

    QCM 105

    Chapitre 7 Enzymes et catalyse enzymatique 107

    Fiche 42 Proprits des enzymes 108

    Fiche 43 Mesures des activits enzymatiques 110

    Fiche 44 Le complexe enzyme-substrat 112

    Fiche 45 La cintique enzymatique 114

    Fiche 46 Reprsentations graphiques delacintique enzymatique 116

    Fiche 47 Effets de la temprature et du pH surlactivit enzymatique 118

    Fiche 48 Linhibition enzymatique 120

    Fiche 49 Lactivation enzymatique 122

    Fiche 50 Rgulation allostrique: miseenvidence et mcanisme 124

    Fiche 51 Rgulation allostrique: thories etrle dans lhomostasie cellulaire 126

    Fiche 52 La rgulation par phosphorylation/dphosphorylation 128

    Fiche 53 La rgulation par activation protolytique 130

    Fiche 54 Co-enzymes, co-facteurs et vitamines 132

    Fiche 55 Co-facteurs doxydorduction 134

    Fiche 56 Co-enzymes de transfert chimique oudactivation 136

    Fiche 57 Groupements prosthtiques 138

    Fiche 58 Classification des enzymes etnouvelles enzymes 140

    Focus Histoire des sciences : exemples puiss enenzymologie 142

    QCM 143

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    V

    Partie3 Structure et expression du gnome

    Chapitre 8 Structure des acides nucliques 145(Franoise Bleicher et Bertrand Duclos)

    Fiche 59 La structure gnrale desacidesnucliques 146

    Fiche 60 La structure spatiale de lADN 148

    Fiche 61 Les proprits physico-chimiques delADN 150

    Fiche 62 Les superstructures de lADN 152

    Fiche 63 Structure de la chromatine eucaryote et du nuclode bactrien 154

    Fiche 64 Structure de lADN mitochondrial etdelADN des chloroplastes 156

    Fiche 65 Techniques de squenage de lADN 158

    Fiche 66 Structure du gnome et gnomique 160

    Fiche 67 Les squences rptes 162

    Fiche 68 Gnes en copie unique etcopiesmultiples 164

    Fiche 69 Famille de gnes 166

    Fiche 70 Structure et rle des diffrents typesdARN 168

    Fiche 71 Les proprits des ARN 170

    Focus Analyse bio-informatique des squences 172

    QCM 173

    Chapitre 9 La rplication de lADN (delADN lADN) 175(Franoise Bleicher et Bertrand Duclos)

    Fiche 72 La rplication et le cycle cellulaire 176

    Fiche 73 La rplication de lADN 178

    Fiche 74 LADN polymrase III 180

    Fiche 75 La biosynthse de lADN chezlesbactries 182

    Fiche 76 La PCR (Polymerase Chain Reaction): amplification in vitro de lADN 184

    Fiche 77 La rplication de lADN chezleseucaryotes 186

    Fiche 78 Fidlit de la rplication, dtection etcorrection des erreurs 188

    Fiche 79 Rplication du gnome ARN desrtrovirus 190

    Focus Flux de linformation gntique chez les Arches 192

    QCM 193

    Chapitre 10 Lexpression desgnes: latranscription (delADNlARN) 195(Franoise Bleicher et Bertrand Duclos)

    Fiche 80 La transcription chez les bactries 196

    Fiche 81 La transcriptase des bactries etlessites promoteurs 198

    Fiche 82 Les tapes de la transcription chezlesbactries 200

    Fiche 83 Modifications chimiques des ARNr etARNt chez les bactries 202

    Fiche 84 La transcription chez les eucaryotes 204

    Fiche 85 Structure des promoteurs eucaryotes de classe 2 206

    Fiche 86 Les facteurs de transcription 208

    Fiche 87 Mode daction de lARN polymrase II 210

    Fiche 88 La maturation post-transcriptionnelle des pr ARNm 212

    Fiche 89 Lpissage 214

    Fiche 90 Lexportation des ARN 216

    Focus Transcriptomique et cancer 218

    QCM 219

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  • VI

    Chapitre 11 Biosynthse des protines: latraduction du code gntique 221(Franoise Bleicher et Bertrand Duclos)

    Fiche 91 lucidation et mise en uvre du code gntique 222

    Fiche 92 La traduction chez les bactries 224

    Fiche 93 Structure des ARN de transfert (ARNt). Reconnaissance du codon par lanticodon ARNt 226

    Fiche 94 Activation des acides amins par les ARNt et les synthtases spcifiques 228

    Fiche 95 Structure des ribosomes 230

    Fiche 96 La traduction chez les eucaryotes 232

    Fiche 97 La rgulation traductionnelle 234

    Fiche 98 Modifications post-traductionnelles 236

    Focus La traduction, cible de nombreux antibiotiques 238

    QCM 239

    Chapitre 12 Le contrle de lexpression des gnes chez lesprocaryotes 241(Franoise Bleicher et Bertrand Duclos)

    Fiche 99 Structure des oprons 242

    Fiche 100 Contrle de la transcription doprons cataboliques ou anaboliques 244

    Fiche 101 Rgulation des gnes dubactriophage 246

    Fiche 102 Les protines de rgulation du type protines de liaison lADN 248

    Focus Rgulation de la transcription des gnes chez les bactries parlessystmesdeuxcomposants 250

    QCM 251

    Chapitre 13 La rgulation delexpressiondes gnes chez les eucaryotes 253(Franoise Bleicher et Bertrand Duclos)

    Fiche 103 La rgulation transcriptionnelle (1) 254

    Fiche 104 La rgulation transcriptionnelle (2) 256

    Fiche 105 Les mthodes dtude des promoteurs 258

    Fiche 106 Lpissage alternatif 260

    Fiche 107 Les promoteurs et les sites depolyadnylation alternatifs 262

    Fiche 108 Ldition des ARN 264

    Fiche 109 Stabilit des ARN messagers 266

    Fiche 110 Lanalyse de lexpression des gnes 268

    Fiche 111 La rgulation post-transcriptionnelle par les ARNmi 270

    Focus Nutriments et rgulation gntique 272

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