Ann Letellier, directrice (FMV)Yvan L’Homme, co-directeur (ACIA)

• Groupe actif à l’UdeM depuis 2007– Sous la direction de Dr Sylvain Quessy

• En 2009, suite à la reconnaissance officielle par l’UdeM, nomination des membres de la direction:– Directrice (A Letellier, UMtl)– Co-directeur (Y L’Homme,ACIA)– Mandat de 2 ans– Supporté par un comité de gestion

• 25 membres à ce jour, diverses organisations

RechercheEnseignement*

Industrie

• CTIA: certificat en technologie et innocuité des aliments (1er cycle)

• Objectifs

– Optimiser les efforts de recherche et d’enseignement en salubrité alimentaire dans l’Est du Canada

– Développer des stratégies d’analyse du risque (évaluation, gestion et communication du risque) dans une approche de la ferme à la table

– Développer des programmes d’enseignement spécifiques visant une compréhension globale des sources de contamination et le développement des stratégies de contrôle

– Accroître les collaborations, le réseautage et les échanges entre les chercheurs

– Optimiser la diffusion des résultats de la recherche et leur impact

• L’adhésion comme membre du groupe:

– Chercheurs et microbiologistes ayant des activités en salubrité alimentaire

– Adhésion volontaire– Collaboration entre les membres et participation aux

activitiés (évaluation des séminaires d’étudiants, enseignement au Certificat en technologie et innocuité des aliments, présentation des activités de recherche)

– Membres d’agences gouvernementales/laboratoires et centres gouvernementaux ou universités

– Membres réguliers ou associés (relié au niveau d’activités en salubrité alimentaire)

MEMBRES (24)FVM: Faculté de médecine vétérinaire (12)• Dre Marie Archambault, Dre Josée Harel, Dre Ann Letellier, Dr Serge Messier• Dr Jérôme DelCastillo, Dr John M. Fairbrother, Dr Malcom Gains, Dr Sylvain Quessy• Dre Martine Bouliane, Dr Daniel Perron*, Dr Philippe Fravalo, Dre Nadia Bergeron

LST/CFIA: Laboratoire de St-Hyacinthe de l’Agence Canadienne d’Inspection des Aliments (2)

• Dr Yvan l’Homme**, Dre Carole Simard**

CRDA/AAC: Centre de Recherche et Développement sur les Aliments d’Agriculture et Agro-alimentaire Canada à St-Hyacinthe (5)

• Dre Evelyne Guévremont, Dre Julie Brassard**, Dre Michèle Marcotte• Dr Alain Houde**, Dr Akier Assanta Mafu

IRDA: Institut de Recherche et de Développement en Agroenvironnement (2)• Dre Caroline Côté**, Mme Mylène Généreux

HC: Laboratoire de Longueuil de Santé Canada (1)•  M Yvon-Louis Trottier

PHAC: Agence de santé publique du Canada (2)• Dre Rebecca Guy**• Dr Pascal Michel**

MAPAQ: Ministère de l’Agriculture, des Pêcheries et de l’Alimentation du Québec (1)• Dre Madeleine Fortin* Professeurs invités au Département de pathologie et microbiologie

** Professeurs associés au Département de pathologie et microbiologie

« Chaire de recherche industrielle du CRSNG en salubrité des viandes

(CRSV-CRSNG) » Programme Professeurs-chercheurs industriels (PCI)

Demande de subvention No: 130565330 Faculté de médecine vétérinaire,

Université de Montréal.

7

Ann Letellier, Ph.D., titulaire, professeure agrégéeSylvain Quessy, DMV, Ph.D. vice-doyen recherche/étud.sup, professeur titulairePhilippe Fravalo, Ph.D., professeur agrégéSylvette L-Lewandowski, Ph.D., professionnelle de rechercheNadia Bergeron, DMV, PhD, professionnelle de recherche

L’équipe de la Chaire-CRSNG• Chercheurs associés

– Marie Archambault (antibiorésistance)– Martine Boulianne (Chaire avicole)– Jérôme del Castillo (pharmacologie)

• Plusieurs collaborateurs de la FMV (CRIP/GREMIP) et de l’extérieur

• 3 assistantes administratives• 2 agents de recherche/technicien• Plus de 14 PhD et MSc, 2 post-

doctorants• Laboratoire de diagnostic

– Bactériologie– Épidémiologie moléculaire– Détection d’antibiotiques dans les

aliments

• Plusieurs experts dans le projet de développement de la qualité /salubrité des produits alimentaires au Vietnam (5 MSc)

Les partenaires de la Chaire-CRSNG

• Chaire de recherche industrielle du CRSNG en salubrité des viandes(2011-2016)

• 5 nouveaux partenaires industriels• 2.2 Millions $ pour 5 ans

Nos partenaires

10

Salubrité des viandes (B,C)

Pathogènes émergents

Développement de stratégies de contrôle

Mission de la ChaireMission de la Chaire• Effectuer des recherches fondamentales et

appliquées en salubrité des viandes

• Supporter l’industrie dans les enjeux reliés à la salubrité des viandes afin de maintenir la confiance des consommateurs dans les produits de viandes canadiens

• Développer des outils pour permettre à l’industrie de demeurer compétitive face aux agents pathogènes émergents

11

Démarche basée sur l’analyse du risque

• Évaluation du risque– Identification et caractérisation des pathogènes émergents– Étude de l’exposition, évaluation du risque réel pour l’humain

• Gestion du risque– Stratégies de contrôle des agents pathogènes– HACCP (analyse des risques et maîtrise des points critiques)

• Communication du risque– Service d’accompagnement (autorités gouvernementales,

vétérinaires, industrie…)– Réponse aux médias

12

Vision commune-objectifs complémentaires

13

Utilisation judicieuse des médicaments chez le porc

Épidémiologie et contrôle des pathogènes chez le porc

Campylobacter chez le poulet de chair

Volet 1 Volet 2 Volet 31 PhD

1 MSc

1 PhD2 Post-doc2 MSc

2 PhD2 MSc

Certains autres projets…• Grappes scientifiques porcines AAC (2011-2013)

– Développement de nouvelles stratégies alimentaires dans le but d’améliorer le développement de l’intestin, les fonctions de défense du système immunitaire, la santé et les performances de croissance des porcelets

• Collaboration avec Dr Martin Lessard (AAC, Lennoxville)• Modèle d’infection expérimentale à Salmonella Typhimurium

– Utilisation d’outils moléculaires, de géomatique et d’analyse systémique pour identifier les principaux vecteurs de contamination bactérienne et virale dans un réseau abattoir-fermes porcines

• Collaboration avec U de Sherbrooke, AAC, ACIA• 3 étudiants MSc, 1 étudiante PhD

Sujets de recherches complémentaires à ceux de la CRSV- Dr Philippe Fravalo

• Listeria monocytogenes en production porcine:– Abattage /découpe : détection et traçabilité moléculaire

(sérotypage par PCR et pulsotypage) en usine, adhérence aux surfaces (PCR-SSCP)

– Tranchage du produit prêt à manger : évaluation de l’eau ozonée comme moyen de gestion du risque

• Écologie de la flore digestive des porcs et volailles en relation avec des évolutions de la diète (forme (mash/moulée) et additifs alternatifs aux ATB) dans une perspective de contrôle de Salmonella et Campylobacter Évolution des dénombrements «pasteuriens » vers une approche

moléculaire : Q-PCRDéveloppement de typage de pathogènes (analyses HRM)Analyse comparative d’empreintes de profils de flore (PCR-SSCP)Analyse taxonomique par pyroséquençage (collaboration en cours)

Dr Yvon-Louis TrottierSanté CanadaLaboratoire Régional de Microbiologie (Longueuil)

Expertise:•Développement et évaluation de méthodes de détection et de confirmation de pathogènes alimentaires pour application réglementaire ( Loi des aliments et drogues / Compendium des méthodes d’analyses de santé Canada) •Support aux activités de recherche du Bureau des dangers microbiens sur les méthodes de détection et de caractérisation des pathogènes émergents ( Cronobacter (Enterobacter) sakazakii, Arcobacter butzleri ) •Services d’analyses d’échantillons d’eau potable et environnementaux pour la santé des premières nations au Québec (26 communautés)•Collaboration au niveau national et international sur les comités de standardisation et de validation de méthodes et l’incertitude de mesure en microbiologie. (ISO, AOAC) •Activités d’analyse de conformité pour le programme de l’inspectorat de Santé Canada (Pharmaceutique (USP), vérification de stérilité ,instruments médicaux, produits de santé naturels, contrefaçon de médicaments, plaintes de consommateur, intégrité frontalière)

Projets en collaboration avec des membres du GRESA:

1.4500096 (2009-2012) - Caractérisation biologique, détection moléculaire et contrôle des virus d’origine alimentaire. (Santé Canada (1) Trottier Y-L. (Longueuil) , (2) Houde. A., (3) Brassard, J. Agriculture et agroalimentaire Canada (St-Hyacinthe)2.4500829 (2011-2012) - Detection, characterization and assessment of novel and emerging zoonotic viral and bacterial threats to humans in the food chain ( (1) Houde A., (2) Brassard J., (3) Guévremont E. , Agriculture et agroalimentaire Canada (St-Hyacinthe) (4) Inglis D., Agriculture et agroalimentaire Canada (Lethbridge) , et (5) Tineke Jones Agriculture et agroalimentaire Canada (Lacombe), Santé Canada Trottier Y-L. (Longueuil), .

Julie Brassard, PhD CRDA, Virologie alimentaire

Domaines d'expertise :

•Détermination de l'origine des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain dans la chaîne alimentaire et dans son environnement. •Évaluation des profils de survie ou de persistance des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain dans la chaîne alimentaire et dans son environnement. •Élaboration de stratégies de contrôle de la ferme à la table des virus pathogènes présentant des risques pour l'humain. •Étude des virus modèles ou substituts et des indicateurs viraux potentiels.

Projets en cours en collaboration avec des membres du GRESA:

1.2010-2013: Enhancing mitigation strategies for microbiological risk in fresh horticultural products. PI-Susan Bach AAC, Évelyne Guévremont, Caroline Côté IRDA, Julie Brassard AAC.

2.2010-2013 - Detection, characterization and assessment of novel and emerging zoonotic viral and bacterial threats to humans in the food chain. PI- Évelyne Guévremont AAC, Yvon-Louis Trottier SC, Julie Brassard AAC, Alain Houde AAC, Yvan L’Homme, ACIA

3.2009-2012-Ecology of human enteric pathogens in fresh horticultural products. PI-Pascal Delaquis, AAC; Julie Brassard AAC, Évelyne Guévremont AAC; Yvon-Louis-Trottier SC, Alain Houde AAC.

4.2010-2012- Use of tools related to molecular characterization, systemic analysis of stakeholders and geomatics for identification of principal vectors and contamination sources by bacteria and virus indicators at farm and slaughterhouse level. PI- Ann Letellier FMV; John Fairbrother FMV; Philippe Fravalo FMV, Yvan L’Homme ACIA, Julie Brassard AAC

5.2012-2013: Salubrité et impact technologique de la réduction en sodium suggérée par Santé Canada sur la fermentation et la transformation des légumes (bactéries et virus pathogènes). PI -Tony Savard AAC, Julie Brassard AAC, Yvan L’Homme ACIA.

Expertise :

Adhésion des bactéries pathogènes aux surfaces et formation des biofilms Mise au point des stratégies de contrôle d'agents pathogènes et d'altération des

aliments Microbiologie, salubrité des aliments, salubrité des surfaces et biosécurité prévention de la contamination des aliments par la maîtrise de l'hygiène des

surfaces Développement d'antimicrobiens naturels et résistance microbienne aux

désinfectants Étude des paramètres physico-chimiques de la contamination des interfaces Utilisation des probiotiques pour la biodécontamination des interfaces Écologie microbienne des produits de viandes blanches (volaille) et rouges Évaluation de l'hygiène des surfaces en bioindustrie et en milieu hospitalier par

les techniques moléculaires et microscopiques Médecine vétérinaire (inspection de viandes et sous produits) Activités internationales sur l’hygiène, la salubrité et la biosécurité des aliments

Projet de recherche avec les membres du GRESA

2011-2014 – Détection des résidus d’antibiotiques dans les œufs en coquille produits dans les fermes de Kinshasa en République démocratique du Congo Héric Kazadi (1), Faculté de médecine vétérinaire, Université de Kinshasa (Kinshasa); (2) Maf Akier Assanta, Agriculture et Agroalimentaire Canada (St-Hyacinthe); (3) Martine Boulianne, Faculté de médecine vétérinaire, Université de Montréal (St-Hyacinthe).

Dr Maf Akier Assanta

Dr Yvan L’Homme Virologie

Intérêts de rechercheDétection, épidémiologie et contrôle de virus alimentairesTaxonomie et classification viraleCaractérisation moléculaire, écologie et épidémiologie de virus entériques Détection, épidémiologie et contrôle de la ParatuberculoseDétection, épidémiologie et contrôle des lentivirus des petits ruminantsDéveloppement de méthodes diagnostiques alimentaires et vétérinaires

Projets en collaboration avec membres du GRESA1. Caractérisation moléculaire, écologie et épidémiologie de virus entériques animaux et

humains (RotaV, AstroV, CaliciV, PicobirnaV, HEV) - Julie Brassard (AAC-GRESA)2. Détection, épidémiologie et contrôle de virus alimentaires Julie Brassard (AAC-GRESA)3. Étude des sources et vecteurs de contaminations virales dans un réseau abattoir-ferme

porcines Julie Brassard (AAC-GRESA), Ann Letellier (UdeM-GRESA), Philippe Fravalo (UdeM, GRESA), John Fairbrother (UdeM, GRESA),

Expertise:•Sources, survie et transport des microorganismes pathogènes pour l’humain présents dans l’environnement agricole• Salubrité de l’eau et des aliments• Irrigation et épandage de fumiers

Projets en collaboration avec des membres du GRESA:

1. Impact de l’application de pesticides sur la persistance d’E. coli et de Salmonella spp. dans la culture du brocoli (A. Letellier)

2. Impact de l’irrigation sur la salubrité de la laitue frisée et de l’oignon vert: combiner le délai irrigation-récolte et le contenu de l’eau en E . coli (J. Brassard, J.M. Fairbrother, E. Guévremont)

3. Impact de l’épandage du lisier de porc et de la gestion de l’eau d’irrigation sur la salubrité du brocoli: essai au champ (J. Brassard, J.M. Fairbrother, E. Guévremont)

4. Impact de la date et de la source d’eau d’irrigation sur la salubrité de la laitue romaine en terre noire (J. Brassard, J.M. Fairbrother, E. Guévremont)

Hygiène de l’environnement agricole et salubrité des

produits horticoles

Caroline Côté, agr. Ph.D.

Expertise•Surveillance et diagnostic des E. coli•Caractérisation et détection des E. coli pathogènes et résistance antimicrobienne

Projets de collaboration avec les membres du GRESA1.2010-En cours. Effet de clinoptilolite sur les populations d’E. coli chez le porc. 1) Fairbrother JM, FMV; 2) Letellier A, FMV; 3) Fravalo P, FMV.

2.2010-En cours. Caractérisation de souches d’E. coli isolées à partir d’échantillons d’eau, de fèces et de carcasses de porcs et de poulets au Vietnam. 1) Fairbrother JM, FMV; 2) Letellier A, FMV; 3) Quessy S, FMV.

3.2011-En cours. Prévalence de bactéries d’origine alimentaire et profils d’antibiorésistance dans des carcasses de poulets vendus au détail au Vietnam. 1) Boulianne M, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV; 3) Quessy S, FMV.

4.2011-En cours. Effet des pratiques de biosécurité sur les populations bactériennes de poulailler avant et après le détassement. 1) Boulianne M, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV.

5.2011-En cours. Impact de la moulée texturée sur les populations d’E. coli ainsi que la flore commensale et le système digestif du porc. 1) Letellier A, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV; 3) Fravalo P, FMV.

6.2011-En cours. Analyse de la diffusion d’E. coli, marqueurs microbiologiques, dans un réseau d’abattoirs et de fermes porcines. 1) Letellier A, FMV; 2) Fairbrother JM, FMV; 3) Brassard J, Agriculture et agroalimentaire Canada (AAC); 4) Fravalo P, FMV; 5) L’Homme Y, ACIA.

7.2011. Impact de la date et de la source d’eau d’irrigation sur la salubrité de divers légumes et végétaux. 1) Fairbrother JM, FMV; 2) Côté C, Institut de recherche et de développement en agroenvironnement (IRDA).

Laboratoire de référence de l’OIE pour Escherichia coliFaculté de médecine vétérinaire (FMV)

John M. Fairbrother, BVSc, PhD

Agence de la santé publique du CanadaDre Rebecca Guy

Expertise:

•Développement des méthodes moléculaires rapides pour quantification et caractérisations génétiques des protozoaires et bactéries pathogènes, et quantification des pathogènes viables.•Quantification et caractérisations génétiques des pathogènes dans l’eau de sources d’eau potable et l’eau récréative.•Caractérisations génétiques de Cryptosporidium , Giardia et Campylobacter provenant de l’environnement, dans les animaux et humains.•La survie des pathogènes dans l'environnement.

Marie Archambault DMV, M.Sc., Ph.D., Dipl. ACVM

• Professeure agrégée, Faculté de Médecine vétérinaire, Université de Montréal

Champs d’expertise:– Résistance aux antibiotiques chez les bactéries– Étude sur les mécanismes de résistance à la bacitracine et le biofilm

chez Clostridium perfringens– Étude sur le Étude sur le Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) résistant à la méthicilline (SARM)

en médecine vétérinaireen médecine vétérinaire– Étude sur le transfert horizontal de la résistance aux antibiotiques Étude sur le transfert horizontal de la résistance aux antibiotiques

chez chez Enterococcus faecalisEnterococcus faecalis– Diagnostic en bactériologie vétérinaireDiagnostic en bactériologie vétérinaire

Projet en collaboration:1.1. Étude sur le Étude sur le Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) résistant à la méthicilline (SARM)

chez le porc à l’abattoir au Québec chez le porc à l’abattoir au Québec (A Letellier)(A Letellier)2.2. CCaractérisation des Enterococcus porcins et aviaires aractérisation des Enterococcus porcins et aviaires (A Letellier, J. (A Letellier, J.

Harel)Harel)

Dr Evelyne GuévremontCentre de recherche et de développement sur les aliments, St-HyacintheAgriculture et Agroalimentaire Canada

ExpertiseTravaux répondant à la priorité de recherche d’AAC de développer des stratégies de gestion des risques microbiologiques dans la chaîne alimentaire:•Ciblés en amont de la chaîne alimentaire soit en production laitière et horticole;•Basés sur l’identification et la caractérisation de sources de Campylobacter autres qu’aviaires;•Isolement de Campylobacter jejuni/coli et émergents à partir d’échantillons de fèces, lisier, eau et légumes feuillus, identification par PCR et comparaison des souches par PFGE.

Projets en collaboration1.Detection, characterization and assessment of novel and emerging zoonotic viral and bacterial threats to humans in the food chain. Collaborateurs: Julie Brassard2.Enhancing mitigation strategies for microbiological risks in fresh horticultural products. Collaborateurs: Julie Brassard, Caroline Côté3.Co-directrice d’Alexandre Thibodeau, étudiant au docorat, Caractérisation des isolats de Campylobacter jejuni aviaires. (A Letellier, P Fravalo, S Quessy)

Dr. Malcolm J Gainspathologiste vétérinaire, FMV

ExpertiseNécropsieHistologieImmunohistochimie

Projets en collaboration

Étude des changements morphologiques dans l’intestin et les tissusimmunitaires associés aux divers régimes alimentaires chez le porc (A Letellier, P Fravalo, S Quessy)

Pathogénie et contrôle des infections à E. coli incluant O157:H7

Josée Harel (CRIP/GREMIP/GRESA) 2012

• 1,2 Influence du microbiote intestinal sur la virulence de E.coli 0157

• 3Diagnostic et caractérisation moléculaire et nanotechnologique (Gènes de virulence et antibiorésistance)

• 4Environnement– Interaction amibe /E. coli– Régulation de l’expression

des gènes de virulence par l’environnement

Tube digestifBovin1

Contamination interhumaine

FruitsLégumes

LaitFromages Viande

Traite Récolte

Homme2

Eau (12 %)4

ContaminationFécale3

Transmission directe (2 %)

Contaminationdes carcasses

Transmission par l’alimentation (66 %)3

1,2Collaboration INRA Clermont-Ferrand, 2G Le Bihan, 4M. Chekabab, 4R Lavoie, 3P Garneau1,2 CRSNG stratégique, 2,4 CRSNG subvention à la découverte, 3 CSHB

Dr Daniel Perron• U de MTL : Professeur invité

– médecine réglementée et santé publique;– ACIA - Université de Montréal - professeur invité : enseignement, formation continue et

perfectionnement, MSc et certificat, chaire de recherche en salubrité des viandes (GRESA et GREMIP), centre de recherche aviaire, mentotat et tutoriat;

– 4 universités canadiennes; Charlottetown, Calgary, Guelph et Saskatoon (téléconférences, analyse du risque, MAE, réserve vétérinaire canadienne, recrutement, échange étudiante, Association Canadienne Étudiante Médecine Vétérinaire (ACEMV);

• ACIA : Vétérinaire Liaison – ACIA / FMV / MAPAQ

• Activités académiques – Coordonnateur adjoint du CTIA;– Organiser des cours et des stages en MREG et santé publique avec les membres du GRESA;– Participer à l’enseignement (MREG et santé publique) au niveau du 1ier cycle ainsi qu’à la formation continue

des professionnels des diverses organisations publiques;

• Co-directeur d’étudiants à la maîtrise professionnelle;• Membre du jury pour les séminaires au GRESA;

Merci de votre attention!

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