recherche bibliographique en médecine d'urgence

Recherche bibliographique en médecine d'urgence

Recherche bibliographique en

médecine d'urgence

• Pourquoi ?• Avec quoi ?• Pour quels résultats ?• Comment ?

Recherche bibliographique en

médecine d'urgence

• Pourquoi ?• Avec quoi ?• Pour quels résultats ?• Comment ?

Recherche bibliographique en

médecine d'urgence

A partir d'une situation clinique Formuler la question Élaborer la stratégie de recherche ( à partir des mots clés)

Situations cliniquesSituations cliniques

• Femme de 62 ans cancer ovaire, avec dyspnée et gène thoracique : scinti V/Q non contributive : le « scintigraphiste » vous dit :diagnostic d'EP exclu.

• Homme 69 ans, premier épisode de décompensation de cardiopathie hypertensive il y a 1 mois : la famille vous demande votre avis sur l'évolution de sa maladie.

Formulation de la question

• Définition précise de ce qu’est le problème du malade et information qu’il est nécessaire d’acquérir pour résoudre le problème

• Patient (problème)• Intervention (facteur pronostique...)• Comparaison• Outcome (issue, conséquence)

Formuler la question PICO

• Traduire la situation clinique en une question bien structurée identifiant les concepts clés, en étant spécifique

Patient ou problème Intervention Comparaison Outcome

Patients ou Problèmes

• Définir la situation, la maladie• Sévérité, degré d’évolution• Hôpital, communauté, pré-

hospitalier• Age, sexe• Pathologie associée

InterventionIntervention

• Trt medical, chirurgical • Pronostic, facteur de risque, test diagnostique• Pour qui, comment, quand• Considérer la complexité de l’intervention

Comparaison

• Aucune• Placebo• Traitement de référence• Test de référence• Autre intervention

Outcome

• Guérison• Mortalité• Amélioration• Effets indésirables• Décision clinique

• .• Femme de 62 ans cancer ovaire, avec dyspnée et

gène thoracique : scinti V/Q non contributive : le « scintigraphiste » vous dit :diagnostic d'EP exclu.

• Homme 69 ans, premier épisode de décompensation de cardiopathie hypertensive il y a 1 mois : la famille vous demande votre avis sur l'évolution de sa maladie.

• Chez les patients à haut risque (P), une scinti non contributive (I), permet-elle d'écarter une EP (O)?

Patient Intervention Comparaison Outcome

Haut risque d'EP Scintigraphie non contributive

Exclusion diagnostique

• Femme de 62 ans cancer ovaire, avec dyspnée et gène thoracique : scinti V/Q non contributive : le « scintigraphiste » vous dit :diagnostic d'EP exclu.

• Homme 69 ans, premier épisode de décompensation de cardiopathie hypertensive il y a 1 mois : la famille vous demande votre avis sur l'évolution de sa maladie.

• Chez les patients à haut risque(P), une scinti non contributive (I), permet-elle d'écarter une EP (O) ?

• Quelle la médiane de survie(O) des patients avec cardiopathie (P), et quels sont les facteurs pronostiques (I) influençant cette survie?

ACP Journal Club: The well-built clinical question: a key to evidence-based decision

Richardson, W. Scott ; Wilson, Mark C.; Nishikawa, Jim ; Hayward, Robert S. A.

Patient Intervention Comparaison Outcome

Haut risque d'EP Scintigraphie non contributive

Exclusion diagnostique

Cardiopathie chez l'adulte âgé

Facteurs pronostiques

Médiane de survie

A vous !

Vous examinez aux urgences un jeune homme de 19 ans, sans aucun antécédent, qui présente depuis 3jours des céphalées, une douleur sus-maxillaire gauche, avec une rhinorhée purulente, et un fébricule à38,2°C. Le diagnostic de sinusite maxillaire est posé : vous discutez avec votre collègue la durée du traitement antibiotique, et l'intéret d'un traitement de courte durée par rapport au traitement standard.

Vous recevez aux urgences un homme de 48 ans, hypertendu, diabétique (type 1) et tabagique, pour un premier épisode de douleur thoracique, qui a duré 45 minutes et qui a cédé spontanement au repos.L'examen clinique est normal. L'ECG montre une inversion des ondes T en V4, V5, et V6. La première troponine est normale. Vous lui administrez de l'aspirine et le gardez en observation sous scope.Son medecin traitant, que vous avez contacté, vous demande si vous lui avez prescrit un béta-bloquant : il pense que le pronostic à court terme de son patient en sera amélioré.

PubMed mode d'emploi

Mohamed El Khebir, Albert Trinh-Duc, Aline.Santin, Aurore Armand-Perroux

, Christophe Perrier, Maxime Maignant, Didier Honnard

Sous-commission des référentiels SFMU

Juin 2013

Dr Mohamed El Khebir SAMU 60- SCREF/SFMU

PubMed mode d'emploi ou

comment optimiser la recherche

bibliographique

PubMed PubMed (Public Medline) est l’interface

permettant d’interroger gratuitement Medline, la plus grande base de données bibliographiques au monde, gérée et maintenue par la National Library of Medicine (NLM).

Plus de 4500 revues biomédicales référencées, en majorité en langue anglaise.

Plus de 21 millions de notices bibliographiques, en augmentation constante.

Revues publiées au cours des 2 dernières années, concernant le traitement de l’asthme par les bronchodilatateurs.

Surabondance d’informations

Langage d’interrogation de PubMed= langage d’indexation

Bordereau d’indexationBordereau d’indexation

Liste de mots clés ou descripteurs attribués au documents et organisés hierarchiquement

MeSH : Medical Subject Headings

Le MeSH est le thesaurus du vocabulaire contrôlé de la National Library of Medicine

26853 descripteurs

Un descripteur = un seul concept

Hiérarchisés sous forme d’arborescence, du descripteur le plus générique au descripteur le plus spécifique

MeSH:qualificatifs (subheadings)

En plus des descripteurs, le thesaurus MeSH contient des qualificatifs (subheadings)

descripteur/qualificatif = spécificité et précision

83 qualificatifsAffinités descripteur/qualificatif :Chaque catégorie de descripteur a ses propres qualificatifs.Maladies : diagnostic, traitement, complications, épidémiologie…Médicaments : effets indésirables, pharmacologie, toxicité…Investigations diagnostiques : normes, méthodes, statistiques…

MeSH database

L’accès à l’arborescence et à la liste des qualificatifs attribuables se fait par la fonction

Mesh database

On peut y accéder de 2 manières: en cliquant sur le lien MeSH database ou sur l’onglet déroulant situé à gauche de la fenêtre d’interrogation

11 descripteurs sont proposés avec leurs définitions

On choisit le descripteur le plus adapté à notre requête

La liste des qualificatifs (subheadings) pouvant être associés au descripteur « asthma:

il y en a 46 (sur les 83 possibles)

MeSH:qualificatifs (subheadings)

Asthma/Drug therapy recherchera les articles sur le traitement médicamenteux de l’asthme

Asthma/Diagnosis: articles sur le diagnostic de l’asthme

Asthma/Epidemiology: articles sur l’épidémiologie de l’asthme

MeSH arborescence

Sur la même page du MeSH database, en déroulant vers le bas, on trouve les arborescences du MeSH comprenant le descripteur asthma.

MeSH : arborescenceTermes

génériques

Termes specifiques

MeSH : arborescence

Explosion

PubMed: exemple

Nous allons associer le descripteur « asthma » avec le qualificatif « drug therapy »:

asthma/drug therapy.

Pour cela, nous pouvons soit entrer la requête directement dans la fenêtre d’interrogation de PubMed soit utiliser la fonction « search builder » du MeSH database

Requête avec la fonction « PubMed search builder » de la page MeSH database:

1-On coche la case « drug therapy »

2-On clique le boutonAdd to search buider

la requête apparait dans la boite »PubMed search builder

On lance la recherche par le bouton search PubMed

On peut empêcher l’explosion en cochant cette case

Restreint la recherche aux seules notices

dont le sujet majeur est l’asthme

En cliquant sur ces 2 boutons,

on obtient la requête suivante

On obtient 19554 références on a gagné en spécificité avec les champs majr et

noexp

MeSH : champs (fields)

Les principaux champs précisant la nature du mot clé• Descripteur [mh]• Descripteur majeur [majr]• Auteur [au]• Langue [la]• Titre de périodique [ta]• Type de publication [pt]• Date de publication [dp]

Les champs de localisation• Mot du titre [ti] • Mot du titre ou du résumé [tiab]• Mot du bordereau d’indexation [tw]

indiquent la nature ou la localisation des descripteurssont indiqués par leur abréviation mise entre crochetsLorsqu’ils ne sont pas précisés, PubMed recherche de manière automatique dans les champs principaux: c’est le mapping automatique

MeSH : champs (fields)

(les champs les plus utiles sont entourés)

MeSH : champs (fields)

french [au]french[la]

Asthma [mh]Asthma [majr]Asthma [majr:noexp]Asthma [tiab]Review [pt]

2011:2013 [dp]

Le mot « french peut renvoyer a un nom d’auteur ou à la langue de l’article: le champs

permet de le préciser

Le mot asthma peut être désigné commedescripteur: mh

desripteur majeur:majrdescripteur majeur et non explosé: majr:noexp

mot du titre ou de l’abstract [tiab]

Le champs publication type [pt] permet de préciser le type d’article: ici, une revue de la littérature

Le champs date of publication [dp] permet de sélectionner une date de publication: ici, entre 2011 et 2013

Opérateurs booléens

AND : croise

OR : unit

NOT : exclut

Trois opérateurs booléens- AND, OR, NOT- saisis en lettres capitalesUne règle :Les mots clés encadrant ORsont mis entre parenthèsesAND: augmente la spécificité(donc moins de références)OR : augmente la sensibilité(donc plus de références)

Notre exemple

Nous cherchons les plus récentes publications, sous forme de revue publiées au cours des 2 dernières années, concernant le traitement de l’asthme par les bronchodilatateurs.

Nous allons chercher le descripteur MeSH correspondant à bronchodilatateur grâce au Portail électronique de terminologie du Cismef

On choisit le 1er résultat qui nous est proposé

1-On choisit le qualificatif le mieux adapté

à notre recherche

2-On clique sur Add to search builder

L’opérateur booléen AND est présent par défaut dans ce menu déroulant

On cherche « review » dans la fenêtre d’interrogation

On sélectionne là encore le 1er résultat proposé

Aucun qualificatif n’est associé à ce descripteur

Voici notre requête

("Asthma/drug therapy"[Majr:noexp] AND "Bronchodilator Agents/therapeutic use"[Mesh]) AND "Review"[Publication Type]

Les champs sont automatiquements intégrés, la syntaxe est correcte.

Nous avons 718 références (le30/05/13).

Nous n’avons pas introduit la recherche des articles sur la période qui nous intéresse (de 2011 à 2013).

Nous allons utiliser une fonctionnalité de la page Pubmed :   »Choose additional filters »

Cette fonctionnalité peut être utilisée pour choisir le type de revue « reviews » à la place de sa recherche dans le MesH comme vu précédemment.

N’oubliez pas de désactiver le(s) filtre(s) pour ne pas perturber une autre recherche: »clear

all »!

L'équation de recherche

Descripteur/qualificatif [champs] AND descripteur/qualificatif [champs] AND (desc./qua.[chps] OR desc./qua. [chps])

Avec de l’entraînement, on peut écrire directement cette équation dans la fenêtre de recherche de PubMed, en se passant de la fonction de recherche de MeSH database:

Asthma/dt [majr:noexp] AND bronchodilator agents/tu [mh] AND review [pt] AND 2010 : 2012 [dp]

L'équation de recherche

MERCI et bonnes recherches !

Si vous souhaitez suivre cette thématique, vous pouvez sauvegarder l’équation

MyNCBI : Session personnalisable et

accessible sur tout ordinateurSauvegarde d’équation de

recherche ou de bibliographie

L'équation de recherche

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Ce tutoriel en ligne vous donnera la marche à suivre

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L’objectif est de pouvoir construire, a partir d’une situation ou d’une question, une requête spécifique apportant un nombre de références utilisables et répondant à la question posée.

La méthode que nous vous avons montré ici doit vous permettre d’atteindre cet objectif.

A condition de bien comprendre les notions de langage « MeSH »…

Bonnes recherches bibliographique. Pour toute question ayant trait à ce diaporama: m.elkhebir@ch-

beauvais.fr