m2r de chloé monestier 1 nicolas morellet / michel goulard département ecologie des forêts,...
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M2R deChloé MONESTIER
1
Nicolas Morellet / Michel Goulard
Département Ecologie des Forêts, Prairies et milieux AquatiquesLaboratoire Comportement et Ecologie de la Faune Sauvage / INRA Toulouse
Département Mathématiques et Informatique AppliquéesUMR 1201 DYNAFOR / INRA Toulouse
2
Etudes de sélection des ressources avec hypothèse : ressources ou conditions favorables => fitness (Levins 1968)
Les processus qui gouvernent la mobilité et la sélection de l’habitat sont multifactoriels (Morrison et al. 2006) :
Qualité et quantité des ressources alimentaires Abris Densité de population Densité de compétiteurs Perturbation humaines Prédateurs…
Modifications du paysage notamment agricoles : fragmentation / destruction des habitats variation de disponibilité des ressources et des habitats
Dans ce contexte importance d’étudier comment les espèces s’adaptent à cet environnement changeant
Cas du chevreuil (forte abondance et forte plasticité comportementale)
Chevreuil (Capreolus capreolus) → Espèce d’ongulé la plus répandue en France → Vit dans un paysage fragmenté et anthropique
Objectif Estimer la sélection de l’habitat du chevreuil en
termes de fréquences d’occupation des habitats
Estimer les transitions entre habitats
→ Rôle du chevreuil dans les transferts (tiques, graines, nutriments…)
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Copyright IGN 2000 0 5 km
Localisation : Canton d’Aurignac (N 43°13’, E 0°52’)
Superficie : 11 000 ha
Inclus dans la plateforme LTSER (Long-Term Socio-Ecological Research) des Coteaux de Gascogne
Habitat fragmenté : Massifs forestiers rares (<15%) Prairies et cultures Bosquets Milieu agricole hétérogène
→ Site d’étude représentatif des paysages agricoles modernes
4
Données GPS De 2005 à 2011
Suivis intensifs : 1 loc/10 min pendant 24 heures 12 à 17 jours de suivis par
an
94 individus
5
6
• Réalisation du parcellaire (occupation du sol) : parcelles agricoles, routes, haies, bâtis…• Relevés annuels des cultures• Renseignement du SIG
Utilisation d’habitats Mouvement Sélection d’habitats
occupation d’un habitat par l’individu
occupation conditionnéepar le disponible
capacités de déplacementsdes individus
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Variable dépendante :
→ habitat au temps t
Variables explicatives : « Périodes » de la journée
(4 modalités)
« Saisons » (5 modalités)
« Habitat à t-1 »(4 modalités)
« Identité de l’individu »
aube jour crépuscule
nuit
MA MJ JA SO ND
bois prairies
cultures
haies
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Bois
Prairies
Cultures
Haies
→ Modèle de mouvement (données observées) → Equations différentielles stochastiques (EDS)
Cette formulation permet • de passer par des vitesses intégrées• un apprentissage statistique par des modèles additifs
Brillinger et al. (2001), Preisler et al. (2004)
Dérive =Partie déterministe
Diffusion = Partie stochastique
Accroissementsen x et en y
Processus brownien
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)(),(),()( t dBttRD dtttRtdR
Détermination du disponible Modélisation du mouvement par individu Estimation du disponible à t sachant la localisation à t-1 (EDS) 100 simulations/localisation observée Pestiméetraj = proba associée à chaque habitat (bois/haie/prairie/culture)
en chaque point de la trajectoire
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Pestiméetraj
Utilisation d’habitats Mouvement Sélection d’habitats
Modèles Régressions logistiques
multinomiales
ModèlesEquations différentielles
stochastiques
Modèles Régressions logistiques
multinomiales avec offset
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Modèle K AICcDelta AICc
AICc Wt
Habitat(t-1)*périodes+périodes*saisons+identité individus153
28117.70
0.00 1
Périodes*saisons+habitat(t-1)+identité individus126
28130.58
12.88 0
Habitat(t-1)*périodes+saisons+identité individus117
28136.01
18.31 0
Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus
18928138.1
620.46 0
Habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus162
28149.92
32.22 0
Habitat(t-1)+périodes+saisons+identité individus90
28151.17
33.47 0
Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+identité individus153
28152.90
35.20 0
Habitat(t-1)+périodes+identité individus78
28272.72
155.02 0
Habitat(t-1)+saisons+identité individus81
28583.98
466.28 0
Périodes+saisons+identité individus81
32051.30
3933.60 0
12
Modèle K AICcDelta AICc
AICc Wt
Habitat(t-1)*périodes+périodes*saisons+identité individus153
28117.70
0.00 1
Périodes*saisons+habitat(t-1)+identité individus126
28130.58
12.88 0
Habitat(t-1)*périodes+saisons+identité individus117
28136.01
18.31 0
Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus
18928138.1
620.46 0
Habitat(t-1)*saisons+périodes*saisons+identité individus162
28149.92
32.22 0
Habitat(t-1)+périodes+saisons+identité individus90
28151.17
33.47 0
Habitat(t-1)*périodes+habitat(t-1)*saisons+identité individus153
28152.90
35.20 0
Habitat(t-1)+périodes+identité individus78
28272.72
155.02 0
Habitat(t-1)+saisons+identité individus81
28583.98
466.28 0
Périodes+saisons+identité individus81
32051.30
3933.60 0
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Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats
14
Probabilité d’être dans le bois à t
Périodes de la journée
Probabilité d’être dans le bois à t
Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats
Périodes de la journée
• Transitions bois-bois > 55%
15
Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats
• Transitions bois-bois > 55%
• + de transitions le jour
• Pas de transitions du milieu ouvert vers le bois la nuit
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Probabilité d’être dans le bois à t
Périodes de la journée
Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats
• Transitions prairie-prairie > 60%
17
Probabilité d’être dans la prairie à t
Périodes de la journée
Effet de l’habitat au temps t-1 et des périodes sur la sélection d’habitats
• Transitions prairie-prairie > 60%
• + de transitions la nuit
• - de transitions le jour
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Probabilité d’être dans la prairie à t
Périodes de la journée
Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans le bois
19
Probabilité d’être dans le bois à t
Périodes de la journée
Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans le bois
• + occupé le jour
• Peu occupé la nuit
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Probabilité d’être dans le bois à t
Périodes de la journée
Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans le bois
• + occupé le jour
• Peu occupé la nuit
• Préférentiellement occupée
en MA, SO et surtout en ND
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Probabilité d’être dans le bois à t
Périodes de la journée
Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans la prairie
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Probabilité d’être dans la prairie à t
Périodes de la journée
Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans la prairie
• Occupation maximale la nuit
• Occupation minimale le jour
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Probabilité d’être dans la prairie à t
Périodes de la journée
Effet des périodes et des saisons sur la probabilité d’être dans la prairie
• Occupation maximale la nuit
• Occupation minimale le jour
• Préférentiellement occupée en
MA et MJ
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Probabilité d’être dans la prairie à t
Périodes de la journée
Opposition bois/milieux ouvert pendant la journée
→ couvert de protection
→ moins de perturbations anthropiques
→ pics d’activité aux levers et couchers du soleil
Prairie plus fréquentée au printemps → alimentation (jeunes pousses)
→ mise bas des chevrettes
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Approche méthodologique novatrice:
‘‘sélection d’habitat conditionnée par les capacités de déplacement de l’individu’’
Mouvements et sélection d’habitats influencés par les saisons et périodes de la journée
Influence des mouvements du chevreuil sur les transferts de tiques, graines, nutriments dans le paysage
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