aminoacides & protéines

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Aminoacides & Protéines. Les Protéines sont des biomolécules constituées d’ aminoacides reliés les uns aux autres par des liaisons peptidiques. Les protéines sont utilisées pour… structure (peau & muscles) transport (hémoglobine) réguler les gênes hormones (insuline). acide. basique. - PowerPoint PPT Presentation

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1 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Aminoacides & ProtéinesAminoacides & Protéines

Les Protéines sont des biomolécules constituées d’aminoacides reliés les uns aux autres par des liaisons peptidiques .

Les Protéines sont des biomolécules constituées d’aminoacides reliés les uns aux autres par des liaisons peptidiques .

Les protéines sont utilisées pour…

• structure (peau & muscles)

• transport (hémoglobine)

• réguler les gênes

• hormones (insuline)

Les protéines sont utilisées pour…

• structure (peau & muscles)

• transport (hémoglobine)

• réguler les gênes

• hormones (insuline)

2 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Aminoacides Aminoacides

Les Aminoacides contiennent à la fois un groupe basique (groupe amine NH2) et un groupe acide (groupe acide carboxylique COOH).

Les Aminoacides contiennent à la fois un groupe basique (groupe amine NH2) et un groupe acide (groupe acide carboxylique COOH).

Une réaction se produit réunissant deux (ou plus) aminoacides. Le résultat est la formation d’un peptide ou d’une protéine, selon le nombre d’aminoacides présents.

basique acideH2NCHCOH

R O

3 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Liaisons PeptidiquesLiaisons Peptidiques

Un liaison peptidique est une liaison de type amide liant les aminoacides pour former les peptides et les protéines.

Un liaison peptidique est une liaison de type amide liant les aminoacides pour former les peptides et les protéines.

R C

O

NH2

amide

H2NCHCOH

R O

H2NCHCOH

R O

NCHCOH

R O

H

OR

H2NCHC HOH+

liaison peptide

4 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Peptides & Protéines Peptides & Protéines

Les Peptides contiennent 50 (ou moins) aminoacides et sont classés comme ci-dessous:

• Les Dipeptides contiennent 2 aminoacides.

• Les Tripeptides contiennent 3 aminoacides.

• Les Polypeptides contiennent 50 ou moins aminoacides.

Les Protéines contiennent plus de 50 aminoacides.

Les Peptides contiennent 50 (ou moins) aminoacides et sont classés comme ci-dessous:

• Les Dipeptides contiennent 2 aminoacides.

• Les Tripeptides contiennent 3 aminoacides.

• Les Polypeptides contiennent 50 ou moins aminoacides.

Les Protéines contiennent plus de 50 aminoacides.

5 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

-AminoAcides-AminoAcides

Les -AminoAcides ont un groupe amino en (sur le carbone suivant) du groupe carbonyle.

Les -AminoAcides ont un groupe amino en (sur le carbone suivant) du groupe carbonyle.

H2NCHCOH

OR

carbone

Les -Aminoacides sont classés comme neutre, acide, basique, primaire, ou secondaire, en relation avec la nature du groupe R.

6 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

-AminoAcides-AminoAcides

Les -Aminoacides sont neutres, acides, ou basiques.

Les -Aminoacides sont neutres, acides, ou basiques.

neutre

alanine

acide

acide aspartique

CH3CHCOH

O

NH2

HOCCH2CHCOH

NH2

OO

H2N(CH2)4CHCOH

O

NH2

basique

lysine

Nous allons étudier 15-aminoacides qui sont neutres, 2 sont acides, et 3 sont basiques.

7 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

-AminoAcides-AminoAcides

La plupart des -aminoacides sont primaires, quelques uns sont secondaires.

La plupart des -aminoacides sont primaires, quelques uns sont secondaires.

CCOH

O

NH

primaire

alanine

secondaire

proline

CH3CHCOH

O

NH2

Nous allons étudier 19-aminoacides qui sont primaires et seulement 1 qui est secondaire.

8 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

-AminoAcides-AminoAcides

Les -Aminoacides sont nommés par une lettre code ou par 3 lettres codes.

Les -Aminoacides sont nommés par une lettre code ou par 3 lettres codes.

CCOH

O

NH

alanine

Ala or A

proline

Pro or P

CH3CHCOH

O

NH2

La plupart des codes sont évidents, certains le sont moins.

lysine

Lys or K

H2N(CH2)4CHCOH

O

NH2

9 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

-AminoAcides-AminoAcides

Nous allons étudier 19 -aminoacides qui possèdent des carbones - stéréocentres.

Nous allons étudier 19 -aminoacides qui possèdent des carbones - stéréocentres.

CH2N C

OH

O

R H

*

Seul un -aminoacide, que nous allons étudier, ne possède pas de stéréocentre sur le carbone .

CH2N C

OH

O

H H

glycine

10 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

A lan in e (A la)

O

NH2

CH3 OH

O

NH2

OHCH3

A m in o b u tyricA cid (A b u )

NH

O

NH

NH2

NH2

OH

A rg in in e (A rg )

O

O

NH2

NH2

OH

A sp arag in e (A sn )

OHOH

NH2O

O

A sp articA cid (A sp )

O

NH2

SH OH

C yste in e (C y s)

O O

OHOH

NH2

G lu tam in e (G ln )

O

NH2 OH

G lyc in e (G ly )

O

NH2

NH

N

OH

H istid in e (H is)

11 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

NH2

SHOH

H o m o cyste in e (H cy )

O

NH2

CH3CH3 OH

Iso leu c in e (I le)

O

NH2

CH3

CH3

OH

L eu c in e (L eu )

O

NH2

NH2 OH

L ysin e (L y s)

O

NH2

SCH3 OH

M eth io n in e (M et)

O

NH2

OHCH3

N o rleu c in e (N le)

OH

NH2

NH2

O

O rn ith in e (O rn )

O

NH2

OH

P h en yla lan in e (P h e)

O

NH

OH

P ro lin e (P ro)

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O

NH2

OH OH

S erin e (S er)

O

NH2

OH

CH3

OH

T h reo n in e (T h r)

O

NH2NH

OH

T ryp to p h an (T rp )

O

NH2OH

OH

T yro sin e (T y r)

O

NH2

CH3

CH3 OH

V alin e (V al)

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L-AminoAcidesL-AminoAcides

Parce que la plupart des -aminoacides contiennent un stéréocentre, il est donc possible d’avoir des énantiomères. Toutefois, la nature n’utilise qu’un seul des deux énantiomères, l’aminoacide L-.

Parce que la plupart des -aminoacides contiennent un stéréocentre, il est donc possible d’avoir des énantiomères. Toutefois, la nature n’utilise qu’un seul des deux énantiomères, l’aminoacide L-.

L-glycéraldéhyde

(un sucre L-)

CHO

HHO

CH2OH

COOH

HH2N

CH2OH

L-sérine

(un aminoacide L-)

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AminoAcides essentielsAminoAcides essentiels

Les 20 -aminoacides que nous allons étudier sont utiles pour la synthèse des protéines, mais l’homme

n’est capable d’en synthétiser que 12 d’entre eux. Les 8 autres (les aminoacides essentiels) doivent

être fournis par la nourriture.Ces derniers sont l’isoleucine, leucine, méthionine, phénylalanine, thréonine,

tryptophane, valine, et lysine.

15 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ZwitterionsZwitterions

Un Zwitterion est un ion dipolaire. Parce que les aminoacides contiennent à la fois un groupe acide et basique, une réaction interne acide-base forme un zwitterion.

Un Zwitterion est un ion dipolaire. Parce que les aminoacides contiennent à la fois un groupe acide et basique, une réaction interne acide-base forme un zwitterion.

H2NCHCOH

OR

H3NCHCO

OR

aminoacide zwitterion

Les Aminoacides existent principalement en tant que zwitterions.

16 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

H3NCHCO

OR

OH-

+ + H2OH2NCHCO

OR

H3NCHCO

OR

H3O+

+ H3NCHCOH

OR

+ H2O

ZwitterionsZwitterions

Les zwitterions d’Aminoacides sont amphotères. Ils peuvent réagir aussi bien en tant qu’acides ou en tant que bases.

Les zwitterions d’Aminoacides sont amphotères. Ils peuvent réagir aussi bien en tant qu’acides ou en tant que bases.

En solution acide

En solution basique

zwitterion protoné

zwitterion déprotoné

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Points IsoélectriquesPoints Isoélectriques

Le point isoélectrique d’un aminoacide se situe à une zone de pH où l’aminoacide existe en tant que zwitterion.

Le point isoélectrique d’un aminoacide se situe à une zone de pH où l’aminoacide existe en tant que zwitterion.

déprotoné

solution basique

pH élevé

protoné

solution acide

pH faible

zwitterion

point isoélectrique

H3NCHCO

ORH3O

+

H3NCHCOH

OROH

-H2NCHCO

OR

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AlanineAlanine

Le point isoélectrique pour l’alanine est à pH = 6.00, pH où la forme zwitterionique est prépondérante. A pH > 6.00, la forme déprotonée est prépondérante et à pH < 6.00, la forme protonée est prépondérante.

Le point isoélectrique pour l’alanine est à pH = 6.00, pH où la forme zwitterionique est prépondérante. A pH > 6.00, la forme déprotonée est prépondérante et à pH < 6.00, la forme protonée est prépondérante.

H3O+

H3NCHCOH

O

CH3

H3NCHCO

O

CH3

OH-

H2NCHCO

O

CH3

déprotonée

pH > 6.00

protonée

pH < 6.00

zwitterion

point isoélectrique

pH = 6.00

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Acide AspartiqueAcide Aspartique

Le point isoélectrique pour l’acide aspartique est à pH = 2.77.

Le point isoélectrique pour l’acide aspartique est à pH = 2.77.

déprotonée

pH > 2.77

protonée

pH < 2.77

zwitterion

point isoélectrique

pH = 2.77

H3O+

H3NCHCOH

O

CH2COOH

H3NCHCO

O

CH2COOH

OH-

H2NCHCO

O

CH2COO

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LysineLysine

Le point isoélectrique pour la lysine est à pH = 9.74.Le point isoélectrique pour la lysine est à pH = 9.74.

déprotonée

pH > 9.74

protonée

pH < 9.74

zwitterion

point isoélectrique

pH = 9.74

H3O+

H3NCHCOH

O

(CH2)4NH3

H3NCHCO

O

(CH2)4NH2

OH-

H2NCHCO

O

(CH2)4NH2

21 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Réactivité et Synthèses des aminoacides

Réactivité et Synthèses des aminoacides

22 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

R

NH2

O

OH

R

NH2

OH

AlLiH4 ou BH3

R

NH2

O

OH

R

NH2

O

Cl

R

NH2

O

O

R1

SOCl2R1OH

La réactivité de la fonction acide est observée. La stéréochimie du carbone asymétrique est conservée selon les conditions opératoires.

La réactivité de la fonction acide est observée. La stéréochimie du carbone asymétrique est conservée selon les conditions opératoires.

Réaction de réductionRéaction de réduction

Réaction d’éstérificationRéaction d’éstérification

Conservation de l’asymétrie

Disparition de l’asymétrie

23 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

R

NH2

O

OH

R

NH2

O

OR1

SOCl2+ R1OH

Réaction d’éstérificationRéaction d’éstérification

Conservation de l’asymétrie

24 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

R

NH2

O

OH

R

NH2

O

OR1

+ R1OH

+O

Cl

O

CH3O

O

O

O

CH3

R

NH2

+ CH3

O

OH

O

OH CH3

+CO2

Réaction d’éstérificationRéaction d’éstérification

Conservation de l’asymétrie

25 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

R

NH2

O

OH

NaNO2/HCl R

N+

O

ON

H

O

R OR

OH

O

OH

H2O

OHH

Réaction de diazotationRéaction de diazotation

On obtient un acide alcool

26 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Protection et déprotection d’une fonction amine.Protection et déprotection d’une fonction amine.

Groupement BOC: tertioButylOxyCarbonyleGroupement BOC: tertioButylOxyCarbonyle

NH2

O

OH

R

+t-Bu

O

O

NH

CH3

O

OH

t-Bu

O

O

NH

CH3

O

ORNH2

O

O

R

R

+CH2

CH3

CH3

CO2

H3O+

O

O

O

t-Bu

t-Bu

27 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Groupement FMOC: 9-FluoranylMethOxyCarbonyl

Groupement FMOC: 9-FluoranylMethOxyCarbonyl

H

O

O

NH

R

O

OH

N

CH3

CH3

CH3

CH2

+CO2 +

NH2

O

OH

R

28 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Groupement CBZ: BenzyloxyCarbonyl, déprotection par hydrogénolyse

Groupement CBZ: BenzyloxyCarbonyl, déprotection par hydrogénolyse

O

O

NH

R

O

OH H2, PdCH3

+

HO

O

NH

R

O

OH

NH2

R

O

OH

+CO2

+

29 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Protection et déprotection d’une fonction amine.Protection et déprotection d’une fonction amine.

Groupement BOC: tertioButylOxyCarbonyleGroupement BOC: tertioButylOxyCarbonyle

NH2

O

OH

R

+t-Bu

O

O

NH

CH3

O

OH

t-Bu

O

O

NH

CH3

O

ORNH2

O

O

R

R

+CH2

CH3

CH3

CO2

H3O+

O

t-Bu

O

O

t-Bu

On peut également employer l’acide trifluoroacétique (TFA) dans le CH2Cl2 ou HBr

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Groupement FMOC: 9-FluoranylMethOxyCarbonyl

Groupement FMOC: 9-FluoranylMethOxyCarbonyl

H

O

O

NH

R

O

OH

N

CH3

CH3

CH3

CH2

+CO2 +

NH2

O

OH

R

31 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Groupement CBZ: BenzyloxyCarbonyl, déprotection par hydrogénolyse

Groupement CBZ: BenzyloxyCarbonyl, déprotection par hydrogénolyse

O

O

NH

R

O

OH H2, PdCH3

+

HO

O

NH

R

O

OH

NH2

R

O

OH

+CO2

+

32 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Préparation des aminoacides.Préparation des aminoacides.

Réaction de StreckerRéaction de Strecker

NH2

R

O

OH

R

R1

O

-C N

H+

R

R1

OH

N

R

R1

O+

N

HH

R

R1

N+

N

HHH

NH3

H3O+,

H+

33 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Préparation des aminoacides.Préparation des aminoacides.

Réaction de Hell-Volhard-ZelinskiRéaction de Hell-Volhard-Zelinski

CH3

O

OH

+ Br2 /P

CH3

O

OH

Br

CH3

O

O-

H3N+

NH3 , 25°C

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Synthèse des Amines selon Gabriel

Synthèse des Amines selon Gabriel

N

O

O

K

R Cl

N

O

O

R + K Cl

N-

O

O

R Cl N

O

O

R Cl-

Phtalimide de potassium

35 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

R NH2+N

O

O

RHCl puis neutralisation

O

O

OH

OH

Synthèse des Amines selon Gabriel

Synthèse des Amines selon Gabriel

OU

R NH2+N

O

O

R

NH2NH2

O

O

NH

NH

Deux méthodes pour faire l’hydrolyse du N-phtalimide:

Hydrolyse acide

Hydrazinolyse

36 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Synthèse des Amines selon Gabriel

Synthèse des Amines selon Gabriel

N

O

O

R

H

O

H

H+

N

O

O

R

H

O

H

NH

O

O

R

H

O

H O

H

H+

H O

NH

O

O

R

H

O

H

Mécanisme:

37 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Synthèse des Amines selon Gabriel

Synthèse des Amines selon Gabriel

H O

NH

O

O

R

H

O

HO

O

O

H

O

H

NH2 R+

38 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Synthèse des Amines selon Gabriel

Synthèse des Amines selon Gabriel

N

O

O

R

NH2NH2N

O

O

R

NHNH2

H

NH

O

O

R

NHNH2

NH

O

O R

NH

NH

H

Mécanisme:

39 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Synthèse des Amines selon Gabriel

Synthèse des Amines selon Gabriel

NH

O

O R

NH

NH

H

O

O

NH

NHNH2

R

40 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ElectrophorèseElectrophorèse

L’électrophorèse est une technique qui permet la séparation d’un mélange d’aminoacides. Elle utilise la différence dans les valeurs des points isoélectriques des aminoacides.

L’électrophorèse est une technique qui permet la séparation d’un mélange d’aminoacides. Elle utilise la différence dans les valeurs des points isoélectriques des aminoacides.

- +

aminoacide chargé

négativement (déprotoné)

aminoacide chargé

positivement (protoné)

aminoacide à son point

isoélectrique

41 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ElectrophorèseElectrophorèse

Un mélange de lysine, alanine, et d’acide aspartique peut être séparé par électrophorèse à pH = 6.00.

Un mélange de lysine, alanine, et d’acide aspartique peut être séparé par électrophorèse à pH = 6.00.

H3NCHCO

O

CH3

H3NCHCOH

O

(CH2)4NH3

H2NCHCO

O

CH2COO- +

acide aspartique

chargé négativement (déprotoné)

lysine

chargée positivement

(protonée)

alanine à son point

isoélectrique à pH = 6.00

42 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ElectrophorèseElectrophorèse

Un mélange d’histidine, sérine, et d’acide glutamique peut être séparé par électrophorèse à pH = 5.68.

Un mélange d’histidine, sérine, et d’acide glutamique peut être séparé par électrophorèse à pH = 5.68.

- +

acide glutamique

chargé négativement (déprotoné)

sérine à son point

isoélectrique pH = 5.68

H3NCHCOH

O

CH2

N

NH2

H3NCHCO

O

CH2OH

H2NCHCO

O

CH2CH2COO

histidine chargée

positivement (protonée)

43 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

DipeptidesDipeptides

Un dipeptide est formé par combinaison de 2 aminoacides.

Un dipeptide est formé par combinaison de 2 aminoacides.

H2NCHCOH

O

CH3

H2NCHCOH

O

CH2OH

H2NCHC

O

CH3

H

CH2OH

O

NCHCOH

alanine

Ala

sérine

Ser

alanylsérine

Ala-Ser

Les Dipeptides sont dessinés en écrivant le groupe NH2 libre sur la gauche et le groupe COOH libre sur la droite.

44 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

DipeptidesDipeptides

Un autre dipeptide peut être formé par combinaison d’alanine et de sérine.

Un autre dipeptide peut être formé par combinaison d’alanine et de sérine.

H2NCHCOH

O

CH3

H2NCHCOH

O

CH2OH

alanine

Ala

sérine

Ser

sérylalanine

Ser-Ala

H2NCHC

O

CH2OH

H

CH3

O

NCHCOH

Les Dipeptides sont dessinés en écrivant le groupe NH2 libre sur la gauche et le groupe COOH libre sur la droite.

45 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

DipeptidesDipeptides

Quels sont les 2 dipeptides que l’on peut former par combinaison de la leucine et de la cystéine?

Quels sont les 2 dipeptides que l’on peut former par combinaison de la leucine et de la cystéine?

Leu-Cys

H2NCHC

O

CH2

CH(CH3)2

H

CH2SH

O

NCHCOH

CH2SH

O

H2NCHC

H

CH(CH3)2

CH2

O

NCHCOH

Cys-Leu

46 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

TripeptidesTripeptides

Quels sont les six tripeptides que l’on peut former par combinaison de l’alanine, de la lysine, et de la proline?

Quels sont les six tripeptides que l’on peut former par combinaison de l’alanine, de la lysine, et de la proline?

Ala-Lys-Pro

Ala-Pro-Lys

Lys-Ala-Pro

Lys-Pro-Ala

Pro-Ala-Lys

Pro-Lys-Ala

Ala

Lys

Pro

47 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

TripeptidesTripeptides

Les tripeptides Ala-Lys-Pro et Pro-Lys-Ala n’ont pas la même structure.

Les tripeptides Ala-Lys-Pro et Pro-Lys-Ala n’ont pas la même structure.

H2NCHC

O

CH3

H

N

O

NCHC

(CH2)4

NH2

COH

O

CHC

O H

NHCHCOH

O

NCHC

(CH2)4

NH2

NH O

CH3

Ala-Lys-Pro

Pro-Lys-Ala

48 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

N+

O

N

O

OHH

H

HH

H HH

H

H

H

H

H

H

H

H

H

O-

H

PeptidesPeptides

L’Aspartame est un dipeptide noté Asp-Phe-OMeL’Aspartame est un dipeptide noté Asp-Phe-OMe

L’aspartame est un édulcorant hypocalorique (Nutrasweet)L’aspartame est un édulcorant hypocalorique (Nutrasweet)

Asp

Phe-OMe

49 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

PeptidesPeptides

OO

N

S

H

H

H HH

O

N

O

HH

H

H

O

O-

N+

HH

HH

H

HH

H

Le Glutathion est un tripeptide: -Glu-Cys-GlyLe Glutathion est un tripeptide: -Glu-Cys-Gly

Le glutathion se trouve dans toutes les cellules vivantes (concentrations élevées dans le cristallin de

l’œil). Elle est un agent de réduction dans les processus biochimiques.

Le glutathion se trouve dans toutes les cellules vivantes (concentrations élevées dans le cristallin de

l’œil). Elle est un agent de réduction dans les processus biochimiques.

-GluCys

Gly

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PeptidesPeptides

La gramacidine S est un peptide cyclique.La gramacidine S est un peptide cyclique.

La gramacidine est un antibiotique constitué de deux chaînes pentapeptides [2*(R-Phe-Pro-Val-Orn-Leu)] unis tête à queue. A noter la configuration R-Phe et l’ornithine, acide aminé rare.

H

N

O

N

H

O

O

HN

O

H

N

N+

O

H

NO

H

N

O

NO

H

N

O

H

N+

NO

NH

H H

H

H

H

H

H

H

HH

HHHH

HH

HH H

HH

HH

HH

HH

H

H

H

H

H H

H

H

H

HH

H

HH

H

HHH

H

H

H

H

H

H

HH

H

HH

H

H

HH

H

H

HH

H

H

H

H

H

HH H

H H

H

H

H

H

HH

HHH

H

H

H

H

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PeptidesPeptides

La soie est un polypeptide (protéine) qui présente de manière répétitive la séquence Gly-Ser-Gly-Ala-Gly-Ala. Elle présente une stucture en feuillets. D’autres polypeptides, les protéines présentent des stuctures en hélice (myosine dans le muscle, -kératine dans les cheveux, les ongles et la laine).

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Le pont DisulfureLe pont Disulfure

En addition à la liaison amide, un autre type de liaison, le pont Disulfure, peut se former entre deux aminoacides de type cystéine.

En addition à la liaison amide, un autre type de liaison, le pont Disulfure, peut se former entre deux aminoacides de type cystéine.

C

CHCH2SH

NH

O

HSCH2CH

C

NH

O C

CHCH2S

NH

O O

NH

C

SCH2CH

pont disulfure

Le pont didulfure est écrit comme étant CyS CyS quand on utilise les trois lettres codes.

53 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Le pont disulfureLe pont disulfure

Ci-dessous est représentée la structure partielle de l’insuline, qui contient un pont disulfure qui forme une boucle dans une même chaîne et deux ponts entre deux chaînes distinctes.

Ci-dessous est représentée la structure partielle de l’insuline, qui contient un pont disulfure qui forme une boucle dans une même chaîne et deux ponts entre deux chaînes distinctes.

-Gln-CyS-CyS-Thr-Ser-Ile-CyS-Ser-

-Leu-CyS-Gly-

pont

boucle

L’insuline est utilisée dans le traitement du diabète (propriétés hypoglycémiantes). Elle est extraite de

pancréas d’animaux d’abattoirs.

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InsulineInsuline

Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Ala-Ser-Val-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn

Phe-Val-Asn-Gln-His-Leu-Cys-Gly-Ser-His-Leu-Val-Glu-Ala-Leu-Tyr-Leu-Val-Cys-Gly-Glu-

Ala-Lys-Pro-Thr-Tyr-Phe-Phe-Gly-Arg-

Chaîne A

Chaîne B

5 10 15 21

5 10 15 20

2530

SS

S

S

S

S

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InsulineInsuline

carbonecarbone azoteazote oxygèneoxygène soufresoufre

56 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

InsulineInsuline

chaîne A (21 unités)

chaîne B (30 unités)

ponts disulfures

boucle disulfure

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Liaison Hydrogène pour les -Hélices

NH

HN

NH

HN

NH

HN

NH

O

O

O

O

O

OR R R

R R R

HN

O

R

1

2

3 5 7

4 6

R

8

Carbonyl Oxygen of Residue i H-bonds to Amide Hydrogen of Residue i + 4

L’oxygène du carbonyle est lié à l’hydrogène i-H de la fonction amide. Cet hydrogène est situé à i+4

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Une Hélice

Liaisons et atomes(semi éclaté)

Modèle compact (Stéreo)

59 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Liaison Hydrogène dans les feuillets

N

N

N

O

O

O

H

H

HR

H

R

H

H

R R

H

N

N

N

O

O H

H

H O

N

R

HH

RH

R R

H

O

H

Chain direction

Chain direction

Direction de la chaîne

Direction de la chaîne

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Détermination de la structure peptidique

Détermination de la structure peptidique

Dans le but de connaître la structure d’un peptide, il faut déterminer…

• quels sont les aminoacides présents

• la molécularité de chaque aminoacide présent

• l’ordre avec lequel les aminoacides sont liés

Dans le but de connaître la structure d’un peptide, il faut déterminer…

• quels sont les aminoacides présents

• la molécularité de chaque aminoacide présent

• l’ordre avec lequel les aminoacides sont liés

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L’analyseur d’aminoacides nous renseigne sur la nature des aminoacides présents et le nombre (molécularité) de chaque aminoacide. Le peptide à analyser est hydrolysé en aminoacides individuels qui sont ensuite chromatographiés.

L’analyseur d’aminoacides nous renseigne sur la nature des aminoacides présents et le nombre (molécularité) de chaque aminoacide. Le peptide à analyser est hydrolysé en aminoacides individuels qui sont ensuite chromatographiés.

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

La Dégradation d’Edman nous renseigne sur l’ordre (ou séquence) avec lequel les aminoacides sont liés. Le peptide à analyser est traité chimiquement et analysé, l’aminoacide terminal est identifié.

La Dégradation d’Edman nous renseigne sur l’ordre (ou séquence) avec lequel les aminoacides sont liés. Le peptide à analyser est traité chimiquement et analysé, l’aminoacide terminal est identifié.

62 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Le séquençage complet de protéines n’est pas effectué par la dégradation d’Edman. En fait une hydrolyse partielle coupe la protéine en fragments plus petits et mieux identifiables (manipulables).

Le séquençage complet de protéines n’est pas effectué par la dégradation d’Edman. En fait une hydrolyse partielle coupe la protéine en fragments plus petits et mieux identifiables (manipulables).

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

L’hydrolyse partielle peut être réalisée en utilisant de l’acide dilué (méthode non-sélective) ou par des enzymes trypsine et chymotrypsine (méthode hautement spécifique).

L’hydrolyse partielle peut être réalisée en utilisant de l’acide dilué (méthode non-sélective) ou par des enzymes trypsine et chymotrypsine (méthode hautement spécifique).

63 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

L’hydrolyse totale est effectuée par de l’HCl 6N, 110°C, 24h. Les acides aminés sont alors chromatographiés dans un appareil automatique: l’analyseur d’acides aminés. On obtient ainsi en fonction du pH (variable) l’ensemble des acides aminés et leur proportion.

L’hydrolyse totale est effectuée par de l’HCl 6N, 110°C, 24h. Les acides aminés sont alors chromatographiés dans un appareil automatique: l’analyseur d’acides aminés. On obtient ainsi en fonction du pH (variable) l’ensemble des acides aminés et leur proportion.

Phe--Leu—Met—Lys—Tyr—Asp—Gly—Gly—Arg—Val—Ile—Pro--Tyr

HCl, 6N, 24h Phe + Leu + Met + Lys + 2 Tyr + Asp + 2 Gly + Arg + Val + Ile + Pro

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Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Le peptide à analyser, hydrolysé en aminoacides individuels, est ensuite chromatographié. La variation du pH permet une séparation complète.

Le peptide à analyser, hydrolysé en aminoacides individuels, est ensuite chromatographié. La variation du pH permet une séparation complète.

L’ammoniac est ici donné à titre indicatif

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Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Dégradation de Sanger: le peptide est traité par du 1-fluoro-2,4-dinitrobenzène. Le produit résultant est

ensuite hydrolysé par de l’acide HCl / 6N, puis analysé par chromatographie.

Dégradation de Sanger: le peptide est traité par du 1-fluoro-2,4-dinitrobenzène. Le produit résultant est

ensuite hydrolysé par de l’acide HCl / 6N, puis analysé par chromatographie.

O2N

NO2

F + C

O

HNH2NCHR

1) -HF

2) HCl 6N,

NO2

O2N NHCHRCO2H + acides aminés

66 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

La dégradation d’Edman: le peptide est traité par l’isothiocyanate de phényle. Le produit résultant est ensuite

hydrolysé. On obtient ainsi une phénylthiohydantoïne de l’aminoacide terminal et un peptide possédant un aminoacide en

moins (par la gauche). On recommence ensuite l’opération.

La dégradation d’Edman: le peptide est traité par l’isothiocyanate de phényle. Le produit résultant est ensuite

hydrolysé. On obtient ainsi une phénylthiohydantoïne de l’aminoacide terminal et un peptide possédant un aminoacide en

moins (par la gauche). On recommence ensuite l’opération.

N + C

O

HNH2NCHRC S

NH

S

NH

ONH

R

NNH

S

OR

NH2+puis H+, H2O

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La Trypsine hydrolyse au niveau du site carboxylique des aminoacides arginine et lysine.

La Trypsine hydrolyse au niveau du site carboxylique des aminoacides arginine et lysine.

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

La Chymotrypsine hydrolyse au niveau du site carboxylique des aminoacides substitués par un groupe aryle phénylalanine, tyrosine, et tryptophane.

La Chymotrypsine hydrolyse au niveau du site carboxylique des aminoacides substitués par un groupe aryle phénylalanine, tyrosine, et tryptophane.

Phe-Leu-Met-Lys-Tyr-Asp-Gly-Gly-Arg-Val-Ile-Pro-Tyr

chymotrypsine

trypsine

68 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Phe-Leu-Met-Lys-Tyr-Asp-Gly-Gly-Arg-Val-Ile-Pro-Tyr

La clostripaïne hydrolyse au niveau du site carboxylique de l’ aminoacide arginine.

La clostripaïne hydrolyse au niveau du site carboxylique de l’ aminoacide arginine.

La pepsine hydrolyse au niveau du site carboxylique des aminoacides Asp, Glu, Leu, Phé,

Trp et Tyr.

La pepsine hydrolyse au niveau du site carboxylique des aminoacides Asp, Glu, Leu, Phé,

Trp et Tyr.

La thermolysine hydrolyse au niveau du site amine des aminoacides Leu, Ile et Val.

La thermolysine hydrolyse au niveau du site amine des aminoacides Leu, Ile et Val.

clostripaïnepepsineThermolysine

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La détermination en aminoacides d’un heptapeptide montre qu’il est constitué de Asp, Gly, Leu, Phe, Pro2, et Val. La dégradation d’Edman montre que la glycine est le groupe N-terminal. L’hydrolyse partielle en milieu acide donne les fragments suivants. Quelle est la structure de l’heptapeptide?

La détermination en aminoacides d’un heptapeptide montre qu’il est constitué de Asp, Gly, Leu, Phe, Pro2, et Val. La dégradation d’Edman montre que la glycine est le groupe N-terminal. L’hydrolyse partielle en milieu acide donne les fragments suivants. Quelle est la structure de l’heptapeptide?

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Val-Pro-Leu Gly Gly-Asp-Phe-Pro Phe-Pro-Val

Gly-Asp-Phe-Pro

Phe-Pro-Val

Val-Pro-Leu

Gly-Asp-Phe-Pro-Val-Pro-Leu

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L’analyseur d’Aminoacides montre qu’un hexapeptide est constitué de: Arg, Gly, Ile, Leu, Pro, et Val. L’hydrolyse partielle en milieu acide donne les fragments suivants. Quelle est la structure de l’hexapeptide?

L’analyseur d’Aminoacides montre qu’un hexapeptide est constitué de: Arg, Gly, Ile, Leu, Pro, et Val. L’hydrolyse partielle en milieu acide donne les fragments suivants. Quelle est la structure de l’hexapeptide?

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Pro-Leu-Gly Arg-Pro Gly-Ile-Val

Arg-Pro

Pro-Leu-Gly

Gly-Ile-Val

Arg-Pro-Leu-Gly-Ile-Val

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L’analyseur d’Aminoacides montre qu’un hexapeptide est constitué de: Asp, Leu, Met, Trp, and Val2. L’hydrolyse partielle en milieu acide donne les fragments suivants. Quelle est la structure de l’hexapeptide?

L’analyseur d’Aminoacides montre qu’un hexapeptide est constitué de: Asp, Leu, Met, Trp, and Val2. L’hydrolyse partielle en milieu acide donne les fragments suivants. Quelle est la structure de l’hexapeptide?

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Val-Leu Val-Met-Trp Trp-Asp-Val

Val-Met-Trp

Trp-Asp-Val

Val-Leu

Val-Met-Trp-Asp-Val-Leu

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chymotrypsine: Leu-Arg et Ser-Ile-Arg-Val-Val-Pro-Tyr

trypsine: Val-Val-Pro-Tyr-Leu-Arg et Ser-Ile-Arg

Ser-Ile-Arg-Val-Val-Pro-Tyr

Un nonapeptide donne les fragments ci-dessous quand il est traité par la trypsine et la chymotrypsine. Quelle est la structure de ce nonapeptide?

Un nonapeptide donne les fragments ci-dessous quand il est traité par la trypsine et la chymotrypsine. Quelle est la structure de ce nonapeptide?

Détermination de la Structure PeptidiqueDétermination de la Structure Peptidique

Ser-Ile-Arg-Val-Val-Pro-Tyr-Leu-Arg

Ser-Ile-Arg

Val-Val-Pro-Tyr-Leu-ArgLeu-Arg

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Synthèse des peptides et polypeptidesSynthèse des peptides et polypeptides

Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

NH2

O

OH

R

+t-Bu

O

O

NH

R

O

OH

O

t-Bu

O

O

t-Bu

Groupe terbutyloxycarbonyl: Boc

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t-Bu

O

O

NH

R

O

O-

polystyrène

Cl

éthanol, 80°C

t-Bu

O

O

NH

R

O

O

polystyrène

Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

La réaction de l’ion carboxylate avec l’atome de chlore est une réaction de substitution SN

Synthèse de Merrifield

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t-Bu

O

O

NH

R

O

O

polystyrène

TFA, DCM ou

HCl, AcOH

H3N+

R

O

O

polystyrène

Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

Le groupe Boc est coupé par le TFA (acide trifluoroacétique dans le DCM (dichlorométhane)

76 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

H3N+

R

O

O

polystyrène

TEA, DCM

H2N

R

O

O

polystyrène

Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

On neutralise le sel d’ammonium par la TEA (triéthylamine) dans le DCM

77 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

H2N

R

O

O

polystyrène

Boc-aminoacide, DCCI

NH

R

O

O

polystyrène

O

NH

R1

Boc

Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

On fait ensuite réagir l’amine avec l’aminoacide sous sa forme protégée Boc, en présence de DDCI (dicyclohexylcarbodiimide)

78 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

NH

R

O

O

polystyrène

O

NH

R1

Boc

HF ou HBr/TFA

NH

R

O

OH

O

NH2

R1

Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

On déprotège ensuite et libère le peptide ainsi créé par traitement à l’HF ou le

mélange de HBr/TFA

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Synthèse en phase solide : Stratégie Boc

NH

R

O

O

polystyrène

O

NH

R1

Boc

1) TFA, DCM

2) TEA, DCM

3) Boc-aminoacide, DCCI

NH

R

O

O

polystyrène

O

NH

R1O

NH

R2

Boc

etc....

Mais, on peut poursuivre la synthèse

en additionnant un autre Boc-aminoacide

123

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PapaïnePapaïne

• Enzyme isolée du fruit (jus) de la papaye

• contient 121 amino acides (c’est une petite protéïne)

• MM = 23.350 g/mol

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PapaïneLa fonction biologique est l’hydrolyse

(coupure) des protéïnes

Notez que la réaction est réversible. Sous les bonnes conditions, la papaïne peut catalyser la formation de liaisons peptidiques.

Protéine NH CH C

R

O

NH Protéine

Protéin NH CH C

R

O

NH2 ProtéineOH

+ H2Opapaine

+Liaison Réactive

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Mécanisme de l’action de la Papaïne

SH R C

O

NHR'+PapainSH

Papain R C

O

NHR'

1. Formation d’un complexe réversible

Un ComplexeEnzyme-Substrat

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2. Formation d’un Intermédiaire Thioester

SHPapain R C

O

NHR'S

Papain C

OR

+ NH2R'

Mécanisme de l’action de la Papaïne

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3. Hydrolyse du Thioester

SPapain C

OR

+ H2OSH

Papain +R C

O

OH

Le Catalyseurest régénéré!

Mécanisme de l’action de la Papaïne

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Papaïne• Peut également hydrolyser les dérivés amides

d’aminoacides ou catalyser la préparation de liaison amide à partir d’amines et d’acides carboxyliques

C

O

NH CH CO2H

R

NH2

C

O

NH CH C

R

NH

O

papaine

acide Benzoylaminocarboxylique

Benzoylaminocarboxanilide

aniline

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Papaïne

• La Papaïne est chirale. Elle peut ainsi se lier aux dérivés d’aminoacides (D)- et (L)- de manière différente (Les complexes sont des diastéréoisomères)

• Seul l’énantiomère L- peut réagir pour donner un produit

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PapaïneC

O

NH CH CO2 H

R

NH2

C

O

NH CH C

R

NH

O

C

O

NH CH CO2 H

R

papaine

Acide (D,L)-Benzoylaminocarboxylique

(L)-Benzoyl aminocarboxyanilide Acide (D)-Benzoylaminocarboxylique

aniline

O

NH

CH3

O

NH

N-(2-anilino-1-methyl-2-oxoethyl)benzamide

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Résolution Enzymatique d’un acide Benzoylaminocarboxylique

H3NCO2

R CO

Cl

HCl HNCO2H

R

C O

HNC

R

C OHN

CO2

R

C O

O

NH

HH

NaOH (aq) (D,L)-aminoacide

(D,L)-benzoylaminoacide

papaine, tampon citrate

(L)-cystéine

Anilide du (L)-benzoyl-aminoacide

Carboxylate du (D)-benzoylaminoacide

NH2

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A lan in e (A la)

O

NH2

CH3 OH

O

NH2

OHCH3

A m in o b u tyricA cid (A b u )

NH

O

NH

NH2

NH2

OH

A rg in in e (A rg )

O

O

NH2

NH2

OH

A sp arag in e (A sn )

OHOH

NH2O

O

A sp articA cid (A sp )

O

NH2

SH OH

C yste in e (C y s)

O O

OHOH

NH2

G lu tam in e (G ln )

O

NH2 OH

G lyc in e (G ly )

O

NH2

NH

N

OH

H istid in e (H is)

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O

NH2

SHOH

H o m o cyste in e (H cy )

O

NH2

CH3CH3 OH

Iso leu c in e (I le)

O

NH2

CH3

CH3

OH

L eu c in e (L eu )

O

NH2

NH2 OH

L ysin e (L y s)

O

NH2

SCH3 OH

M eth io n in e (M et)

O

NH2

OHCH3

N o rleu c in e (N le)

OH

NH2

NH2

O

O rn ith in e (O rn )

O

NH2

OH

P h en yla lan in e (P h e)

O

NH

OH

P ro lin e (P ro)

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O

NH2

OH OH

S erin e (S er)

O

NH2

OH

CH3

OH

T h reo n in e (T h r)

O

NH2NH

OH

T ryp to p h an (T rp )

O

NH2OH

OH

T yro sin e (T y r)

O

NH2

CH3

CH3 OH

V alin e (V al)

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Analyse Spectroscopique des acides aminés

Analyse Spectroscopique des acides aminés

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10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0

1.23[6]1.25[6]

3.37[3,5]3.52[4]

3.54[4]3.56[4]

3.58[4]

CH36 4

2

O1

OH3

NH25

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal du CH3 est le signalle plus blindé du spectre

94 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0

1.23[6]1.25[6]

3.37[3,5]3.52[4]

3.54[4]3.56[4]

3.58[4]

CH36 4

2

O1

OH3

NH25

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

On trouve ensuite les signauxdes autres protons

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CH36 4

2

O1

OH3

NH25

3.70 3.60 3.50 3.40 3.30

3.37[3,5]

3.52[4a]

3.54[4a]3.56[4a]

3.58[4a]

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Détaillons les massifs

Nous avons tout d’abord le signaldes groupes NH2 et OH

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CH36

4

2

O1

OH3

NH25

H

3.70 3.60 3.50 3.40 3.30

3.37[3,5]

3.52[4a]

3.54[4a]3.56[4a]

3.58[4a]

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal du proton porté par le carboneen apparaît sous forme d’un quadruplet

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CH36

4

2

O1

OH3

NH25

H

3.70 3.60 3.50 3.40 3.30

3.37[3,5]

3.52[4a]

3.54[4a]3.56[4a]

3.58[4a]

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le protonen sous forme de quadruplet

(couplage avec le CH3)

Il n’y a pas de couplageavec le groupe NH2

98 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

1.60 1.50 1.40 1.30 1.20 1.10 1.00 0.90

1.23[6]1.25[6]

CH36 4

2

O1

OH3

NH25

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le CH3 se présentesous forme d’un doublet

99 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

CH36

4

2

O1

OH3

NH25

H

1.30 1.20 1.10

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le CH3 se présentesous forme d’un doublet

100 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le carbone C=O est le signalle plus déblindé du spectre C13

101 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

On trouve ensuite le carbone en

102 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Puis le carbone de type CH3

103 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9 Spectrométrie de MasseSpectrométrie de Masse

M+.

-15-30

CO2

104 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

InfrarougeInfrarouge

NH2,NH3

+

105 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

InfrarougeInfrarouge

CH deCOOH

106 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

InfrarougeInfrarouge

NH3+

107 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

InfrarougeInfrarouge

C=O

108 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

InfrarougeInfrarouge

COO-

109 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

19.6

51.6174.9

InfrarougeInfrarouge

CH3

110 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0

2.82[7<'>]

2.83[7<'>]

2.85[7<'>]3.01[7<''>]

3.77[8]3.80[8]

3.93[12,9]

7.15[6]

7.17[2,6]

7.18[Comb]7.20[4]

7.21[4]

7.23[4]

7.25[5]

7.28[Comb]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54 1H NMR

1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Les protons du groupe phényle donnent les signaux les plus déblindés

111 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0

2.82[7<'>]

2.83[7<'>]

2.85[7<'>]3.01[7<''>]

3.77[8]3.80[8]

3.93[12,9]

7.15[6]

7.17[2,6]

7.18[Comb]7.20[4]

7.21[4]

7.23[4]

7.25[5]

7.28[Comb]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54 1H NMR

1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

On trouve ensuite lessignaux des autres protons

112 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0

2.82[7<'>]

2.83[7<'>]

2.85[7<'>]3.01[7<''>]

3.77[8]3.80[8]

3.93[12,9]

7.15[6]

7.17[2,6]

7.18[Comb]7.20[4]

7.21[4]

7.23[4]

7.25[5]

7.28[Comb]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54 1H NMR

1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal du CH2 benzyliqueest facilement identifiable

113 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

7.60 7.50 7.40 7.30 7.20 7.10 7.00 6.90 6.80

7.13[Comb]7.14[Comb]7.15[6]

7.15[2]7.15[6]

7.15[6]7.16[Comb]

7.17[6]

7.17[2,6]7.23[4]

7.23[4]

7.23[Comb]

7.24[3]

7.25[5]

7.25[5]

7.25[Comb]7.26[3]

7.26[3]7.27[5]

7.28[Comb]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54 1H NMR

1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Les protons du groupe phényle donnent un massif complexe

114 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

4.20 4.10 4.00 3.90 3.80 3.70 3.60 3.50 3.40

3.77[8]3.78[8]

3.80[8]

3.93[12,9]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54 1H NMR

1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal dus aux protons OH et NH2

donnent un signal unique élargi

115 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

4.20 4.10 4.00 3.90 3.80 3.70 3.60 3.50 3.40

3.77[8]3.78[8]

3.80[8]

3.93[12,9]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54

H

HH

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal du proton portépar le carbone en est caractéristique

116 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54

H7a

H7b H

8a

4.00 3.90 3.80 3.70

3.77[8a]3.79[8a]

3.80[8a]

3.93[12,9]

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

On note pour celui-ci

un doublet dédoublé,couplage

H8a-H7a etH8a-H7b

117 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

3.30 3.20 3.10 3.00 2.90 2.80 2.70 2.60 2.50

2.79[7<'>]2.82[7<'>]

2.83[7<'>]2.85[7<'>]

3.00[7<''>]3.01[7<''>]

3.03[7<''>]3.04[7<''>]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54

H7a

H7b H

8a

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal du proton H7a porté

par le carbonebenzylique

est caractéristique

118 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

3.30 3.20 3.10 3.00 2.90 2.80 2.70 2.60 2.50

2.79[7<'>]2.82[7<'>]

2.83[7<'>]2.85[7<'>]

3.00[7<''>]3.01[7<''>]

3.03[7<''>]3.04[7<''>]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54

H7a

H7b H

8a

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le signal du protonH7b

porté parle carbonebenzylique

est caractéristique

119 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

3.00 2.90 2.80

2.79[7<'>]2.82[7<'>]

2.83[7<'>]2.85[7<'>]

3.00[7<''>]3.01[7<''>]

3.04[7<''>]

78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54

H7a

H7b H

8a

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

On observe une sériede couplages

120 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

3.80 3.70 3.60 3.50 3.40 3.30 3.20 3.10 3.00 2.90 2.80 2.70

2.79[7a]2.81[7a]

2.83[7a]2.85[7a]

3.00[7b]3.01[7b]

3.03[7b]3.05[7b]

3.77[8a] 78

10

O11

OH12

NH29

12 6

3 54

H7a

H7b H

8a

1H NMR1H NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Ces couplages se retrouventsur le signal du proton H8a

121 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Le carbone C=O est le signalle plus déblindé du spectre C13

122 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

On trouve ensuite le carbone ipso

123 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Puis les carbones ortho et méta

124 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Et enfin para

125 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Les carbones les plus blindésdu spectre sont le carbone

126 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

… et le carbone benzylique

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O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

InfrarougeInfrarouge

CH

128 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

InfrarougeInfrarouge

NH et OH

129 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

InfrarougeInfrarouge

NH3+

COO-

130 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

O

OHH2N

39.4

56.8

174.9

139.5

127.8

128.7

126.0128.7

127.8

Spectrométrie de MasseSpectrométrie de Masse

M+.

-45-CO2

H .-46-CH2CHNH2

.

C7H7+.

C6H5+.

-29-CHNH2

.

131 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

AspartameAspartame

132 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

AspartameAspartameONH

O

OH

NH2O

O

CH3

133 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

AspartameAspartame

134 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

InfrarougeInfrarouge

NH3+

COO-

NH et OH

NH2,NH3

+

135 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

InfrarougeInfrarouge

CH

COO-

C=O

136 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

Spectrométrie de MasseSpectrométrie de Masse

M+.

C7H7+.

137 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Voici le spectre réel de l’aspartame

138 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

On observe les protons du noyau phényle

139 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Puis les protons mobiles (NH2, NH et OH)

140 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Le signal du groupe CH3

est caractéristique: singulet

141 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Et enfin tous les autres protons

142 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Examinons le spectre théoriquede l’aspartame

143 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Les protons du groupe phényle donnent les signaux les plus déblindés

144 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Le signal des protons H15, H21, et H9des groupes OH,

NH etNH2

est caractéristique(singulet,

déplacement variable)

145 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

On trouve ensuite lessignaux des autres protons

146 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Le signal des protons H17 du groupe CH3

est caractéristique(singulet)

147 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

7.50 7.40 7.30 7.20 7.10 7.00 6.90 6.80 6.70 6.60 6.50 6.40

6.85[15,21,9]

7.15[Comb]7.16[Comb]

7.17[4]

7.17[6]

7.17[6]

7.18[Comb]

7.19[2]

7.20[3]

7.21[Comb]

7.22[3]7.22[Comb]

7.22[3]

7.24[Comb]7.24[5]

7.25[Comb]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Les protons du groupe phényle donnent un massif complexe

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7.50 7.40 7.30 7.20 7.10 7.00 6.90 6.80 6.70 6.60 6.50 6.40

6.85[15,21,9]

7.15[Comb]7.16[Comb]

7.17[4]

7.17[6]

7.17[6]

7.18[Comb]

7.19[2]

7.20[3]

7.21[Comb]

7.22[3]7.22[Comb]

7.22[3]

7.24[Comb]7.24[5]

7.25[Comb]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Le signal des protons H15, H21, et H9des groupes OH,

NH etNH2

est caractéristique(singulet élargi)

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8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

On observe ensuite les signaux de autresprotons fortement couplés

150 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

On observe ensuite les signaux de autresprotons fortement couplés

151 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Attention les couplages s’observententre protons voisins

152 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

8.0 7.5 7.0 6.5 6.0 5.5 5.0 4.5 4.0 3.5 3.0 2.5 2.0 1.5 1.0 0.5 0.0

2.42[18<'>]

2.59[18<''>]2.60[18<''>]

3.06[7<''>]

3.60[17]

3.89[14]

4.57[8]4.58[8]

4.59[8]4.60[8]

6.85[15,21,9]

7.19[2]

7.21[Comb]

7.22[3]7.24[3]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Attention les couplages s’observententre protons voisins

153 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

3.30 3.20 3.10 3.00 2.90 2.80 2.70 2.60 2.50 2.40 2.30 2.20

2.38[18<'>]2.41[18<'>]

2.42[18<'>]2.45[18<'>]2.60[18<''>]

2.62[18<''>]2.63[18<''>]

2.88[7<'>]

2.89[7<'>]2.91[7<'>]

3.05[7<''>]3.06[7<''>]

3.09[7<''>]3.10[7<''>]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

4.80 4.70 4.60 4.50 4.40 4.30 4.20 4.10 4.00 3.90 3.80 3.70

3.86[14]3.89[14]

4.57[8]4.60[8]

Il nous faut examiner ces deux ensembles

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4.80 4.70 4.60 4.50 4.40 4.30 4.20 4.10 4.00 3.90 3.80 3.70

3.86[14]3.89[14]

4.57[8]4.60[8]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Soit pour le premier massif

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128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Les deux protons benzyliques H7 ne sont pas équivalents.

Ils montrent entre eux un couplage gem

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128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Les deux protons benzyliques H7a et H7b sont couplés avec H8, proton

porté par un centre d’anomérie

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4.80 4.70 4.60 4.50 4.40 4.30 4.20 4.10 4.00 3.90 3.80 3.70

3.86[14]3.89[14]

4.57[8]4.60[8]

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Soit pour le second massif

158 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Les deux protons H18 ne sont pas équivalents.

Ils montrent entre eux un couplage gem

159 Copyright© 2005, D. BLONDEAU. All rights reserved.

128 O

13

7

NH9

1

2

65

34

O16

OH21

NH215

O20

O11

14191018

CH317

Déplacement chimique (, ppm)

1H NMR1H NMR

Les deux protons H18a et H18b sont couplés avec H14, proton

porté par un centre d’anomérie

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ONH

O

OH

NH2O

O

CH3

13C NMR13C NMR

Déplacement chimique (, ppm)

Voici le spectre réel de l’aspartame

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H2N

O

HO

O

NH

OO

49.7171.8

42.8177.3

53.1

171.6

37.0

139.5127.8

128.7

126.0

128.7

127.8

51.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Voici le spectre théorique de l’aspartame

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H2N

O

HO

O

NH

OO

49.7171.8

42.8177.3

53.1

171.6

37.0

139.5127.8

128.7

126.0

128.7

127.8

51.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Le signal le plus déblindé correspondau carbone C=O de la fonction acide

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H2N

O

HO

O

NH

OO

49.7171.8

42.8177.3

53.1

171.6

37.0

139.5127.8

128.7

126.0

128.7

127.8

51.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Les signaux suivants correspondentaux carbone C=O de la fonction amide et ester

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H2N

O

HO

O

NH

OO

49.7171.8

42.8177.3

53.1

171.6

37.0

139.5127.8

128.7

126.0

128.7

127.8

51.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Les signaux suivants du noyauphényle sont facilement identifiables

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H2N

O

HO

O

NH

OO

49.7171.8

42.8177.3

53.1

171.6

37.0

139.5127.8

128.7

126.0

128.7

127.8

51.9

020406080100120140160180PPM

13C NMR13C NMR

Les signaux les plus blindés correspondent aux carbones

de la chaîne

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